RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586965.1

SEMA6B-202, Transcript of semaphorin 6B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SEMA6B, Length 2,034 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6B-202ENST00000586965 ABCC10Q5T3U5 1492 aa29.2■■■□□ 2.26
SEMA6B-202ENST00000586965 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa29.19■■■□□ 2.26
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SEMA6B-202ENST00000586965 NEUROD1Q13562 356 aa29.15■■■□□ 2.26
SEMA6B-202ENST00000586965 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP29.15■■■□□ 2.26
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SEMA6B-202ENST00000586965 ABCC2Q92887 1545 aa29.12■■■□□ 2.25
SEMA6B-202ENST00000586965 ROCK1Q13464 1354 aa29.12■■■□□ 2.25
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SEMA6B-202ENST00000586965 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
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SEMA6B-202ENST00000586965 MIER1Q8N108 512 aa28.97■■■□□ 2.23
SEMA6B-202ENST00000586965 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa28.97■■■□□ 2.23
SEMA6B-202ENST00000586965 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
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SEMA6B-202ENST00000586965 TTC37Q6PGP7 1564 aa28.94■■■□□ 2.22
SEMA6B-202ENST00000586965 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa28.93■■■□□ 2.22
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SEMA6B-202ENST00000586965 KDM5BQ9UGL1 1544 aa28.92■■■□□ 2.22
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SEMA6B-202ENST00000586965 KCNH8Q96L42 1107 aa28.89■■■□□ 2.21
SEMA6B-202ENST00000586965 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP28.88■■■□□ 2.21
SEMA6B-202ENST00000586965 MBD5Q9P267 1494 aa28.87■■■□□ 2.21
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SEMA6B-202ENST00000586965 SHANK2Q9UPX8 1470 aa28.86■■■□□ 2.21
SEMA6B-202ENST00000586965 C9orf84Q5VXU9 1444 aa28.85■■■□□ 2.21
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SEMA6B-202ENST00000586965 OSCARQ8IYS5 282 aa28.83■■■□□ 2.21
SEMA6B-202ENST00000586965 ARHGEF5Q12774 1597 aa28.83■■■□□ 2.21
SEMA6B-202ENST00000586965 ARHGAP5Q13017 1502 aa28.82■■■□□ 2.2
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SEMA6B-202ENST00000586965 TSPY10P0CW01 314 aa28.8■■■□□ 2.2
SEMA6B-202ENST00000586965 MYO5CQ9NQX4 1742 aa28.77■■■□□ 2.2
SEMA6B-202ENST00000586965 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa28.77■■■□□ 2.2
SEMA6B-202ENST00000586965 PZPP20742 1482 aa28.76■■■□□ 2.2
SEMA6B-202ENST00000586965 CCDC141Q6ZP82 1450 aa28.76■■■□□ 2.2
SEMA6B-202ENST00000586965 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP28.76■■■□□ 2.19
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SEMA6B-202ENST00000586965 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa28.72■■■□□ 2.19
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SEMA6B-202ENST00000586965 KIF15Q9NS87 1388 aa28.7■■■□□ 2.18
SEMA6B-202ENST00000586965 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP28.69■■■□□ 2.18
SEMA6B-202ENST00000586965 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa28.67■■■□□ 2.18
SEMA6B-202ENST00000586965 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa28.66■■■□□ 2.18
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SEMA6B-202ENST00000586965 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
SEMA6B-202ENST00000586965 NUP155O75694 1391 aa28.6■■■□□ 2.17
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SEMA6B-202ENST00000586965 L3MBTL2Q969R5 705 aa28.59■■■□□ 2.17
SEMA6B-202ENST00000586965 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa28.57■■■□□ 2.16
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SEMA6B-202ENST00000586965 ASXL2Q76L83 1435 aa28.56■■■□□ 2.16
SEMA6B-202ENST00000586965 KDM5DQ9BY66 1539 aa28.55■■■□□ 2.16
SEMA6B-202ENST00000586965 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa28.53■■■□□ 2.16
SEMA6B-202ENST00000586965 TEX14Q8IWB6 1497 aa28.52■■■□□ 2.16
SEMA6B-202ENST00000586965 ARAP3Q8WWN8 1544 aa28.52■■■□□ 2.16
SEMA6B-202ENST00000586965 PLXNC1O60486 1568 aa28.5■■■□□ 2.15
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SEMA6B-202ENST00000586965 AFAP1Q8N556 730 aa28.43■■■□□ 2.14
SEMA6B-202ENST00000586965 FAM135AQ9P2D6 1515 aa28.42■■■□□ 2.14
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SEMA6B-202ENST00000586965 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP28.36■■■□□ 2.13
SEMA6B-202ENST00000586965 ERBINQ96RT1 1412 aa28.35■■■□□ 2.13
SEMA6B-202ENST00000586965 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa28.34■■■□□ 2.13
SEMA6B-202ENST00000586965 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
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SEMA6B-202ENST00000586965 ADGRL1O94910 1474 aa28.32■■■□□ 2.12
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SEMA6B-202ENST00000586965 MAGI2Q86UL8 1455 aa28.29■■■□□ 2.12
SEMA6B-202ENST00000586965 IQGAP3Q86VI3 1631 aa28.28■■■□□ 2.12
SEMA6B-202ENST00000586965 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP28.27■■■□□ 2.12
SEMA6B-202ENST00000586965 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
SEMA6B-202ENST00000586965 ATP7AQ04656 1500 aa28.24■■■□□ 2.11
SEMA6B-202ENST00000586965 CD109Q6YHK3 1445 aa28.24■■■□□ 2.11
SEMA6B-202ENST00000586965 PLA2R1Q13018 1463 aa28.23■■■□□ 2.11
SEMA6B-202ENST00000586965 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
SEMA6B-202ENST00000586965 CYB5RLQ6IPT4 315 aa28.19■■■□□ 2.1
SEMA6B-202ENST00000586965 WASHC2AQ641Q2 1341 aa28.17■■■□□ 2.1
SEMA6B-202ENST00000586965 MYT1LQ9UL68 1186 aa28.17■■■□□ 2.1
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