RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000109698.8

Sh3bp1-204, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp1, Length 1,923 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Kdm6bQ5NCY0 1641 aa29.41■■■□□ 2.3
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 TonslQ6NZL6 1363 aa29.41■■■□□ 2.3
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Wdr7Q920I9 1489 aa29.41■■■□□ 2.3
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Fhod3Q76LL6 1578 aa29.4■■■□□ 2.3
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 NhsB1AV60 1647 aa29.4■■■□□ 2.3
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Las1lA2BE28 776 aaKnown RBP29.39■■■□□ 2.3
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ankrd36D3Z4K0 1415 aa29.39■■■□□ 2.3
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Dennd4bQ3U1Y4 1499 aa29.38■■■□□ 2.29
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Cdk11bP24788 784 aaKnown RBP29.35■■■□□ 2.29
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Il16O54824 1322 aa29.33■■■□□ 2.29
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Mtus2Q3UHD3 1353 aa29.32■■■□□ 2.28
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Chic2Q9D9G3 165 aa29.3■■■□□ 2.28
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Fkbp15Q6P9Q6 1216 aaKnown RBP29.3■■■□□ 2.28
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Rnf17Q99MV7 1640 aa29.29■■■□□ 2.28
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Kdm3bQ6ZPY7 1562 aa29.27■■■□□ 2.28
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Cabp1Q9JLK7 227 aa29.26■■■□□ 2.27
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Igf1rQ60751 1373 aa29.23■■■□□ 2.27
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Abca8bQ8K440 1620 aa29.22■■■□□ 2.27
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 SphkapQ6NSW3 1687 aa29.22■■■□□ 2.27
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ythdc2B2RR83 1445 aaKnown RBP29.22■■■□□ 2.27
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Pdcd11Q6NS46 1862 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.27
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 NclP09405 707 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.27
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Tdrd9Q14BI7 1383 aa29.2■■■□□ 2.26
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Eid3Q3V124 375 aa29.2■■■□□ 2.26
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gm32742A0A1B0GT42 1604 aa29.16■■■□□ 2.26
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa29.16■■■□□ 2.26
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Cfap74Q3UY96 1578 aa29.16■■■□□ 2.26
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Pcgf6Q99NA9 353 aa29.14■■■□□ 2.25
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Setbp1Q9Z180 1582 aa29.14■■■□□ 2.25
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Atp10dQ8K2X1 1416 aa29.13■■■□□ 2.25
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP29.12■■■□□ 2.25
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Arhgap5P97393 1501 aa29.12■■■□□ 2.25
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Fmn2Q9JL04 1578 aa29.11■■■□□ 2.25
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 PtprtQ99M80 1454 aa29.11■■■□□ 2.25
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Adgrb2Q8CGM1 1561 aa29.1■■■□□ 2.25
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Neurl4Q5NCX5 1563 aa29.08■■■□□ 2.25
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Lamc1P02468 1607 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Supt5hO55201 1082 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 AI481877A2ALV5 1481 aa29.06■■■□□ 2.24
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Mast1Q9R1L5 1570 aa29.06■■■□□ 2.24
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Hecw1Q8K4P8 1604 aa29.04■■■□□ 2.24
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Cep170Q6A065 1588 aa29.03■■■□□ 2.24
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ube2uB1AUC4 352 aa29.03■■■□□ 2.24
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 AlkP97793 1621 aa29.03■■■□□ 2.24
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Adgrl2Q8JZZ7 1487 aa29.02■■■□□ 2.24
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Kif21bQ9QXL1 1668 aa29.02■■■□□ 2.24
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Abcc3B2RX12 1523 aa29.02■■■□□ 2.24
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Lrrc9Q8CDN9 1456 aa29.02■■■□□ 2.24
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Mphosph9A6H5Y1 991 aa29■■■□□ 2.23
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Znf608Q56A10 1511 aa28.96■■■□□ 2.23
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Trappc8E9PWG2 1437 aa28.95■■■□□ 2.22
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Trpm2Q91YD4 1506 aa28.94■■■□□ 2.22
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Aebp2Q9Z248 504 aaKnown RBP28.9■■■□□ 2.22
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Hspa5P20029 655 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Zfp644E9QA22 1323 aa28.88■■■□□ 2.21
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Pprc1Q6NZN1 1644 aa28.86■■■□□ 2.21
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Camsap2Q8C1B1 1461 aa28.86■■■□□ 2.21
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Kidins220E9Q9B7 1793 aa28.86■■■□□ 2.21
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Zfyve16Q80U44 1528 aa28.86■■■□□ 2.21
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Cdc42bpbQ7TT50 1713 aa28.85■■■□□ 2.21
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Sall2Q9QX96 1004 aa28.83■■■□□ 2.21
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Sart1Q9Z315 806 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 ClspnQ80YR7 1315 aa28.83■■■□□ 2.21
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Naip5Q9R016 1403 aa28.82■■■□□ 2.2
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Wdr66E9Q743 1299 aa28.81■■■□□ 2.2
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Supt6hQ62383 1726 aaKnown RBP28.79■■■□□ 2.2
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Rprd2Q6NXI6 1469 aaKnown RBP28.78■■■□□ 2.2
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Nup155Q99P88 1391 aaKnown RBP28.77■■■□□ 2.2
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Prdm16A2A935 1275 aa28.77■■■□□ 2.2
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Abca9Q8K449 1623 aa28.76■■■□□ 2.2
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Pkd2O35245 966 aa28.76■■■□□ 2.19
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ssh2Q5SW75 1423 aa28.75■■■□□ 2.19
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Pik3c2gO70167 1506 aa28.75■■■□□ 2.19
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gm156Q58A37 223 aa28.73■■■□□ 2.19
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ifnlr1Q8CGK5 535 aa28.73■■■□□ 2.19
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ttll5Q8CHB8 1328 aa28.72■■■□□ 2.19
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Rrp7aQ9D1C9 280 aaKnown RBP28.71■■■□□ 2.19
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Clstn2Q9ER65 966 aa28.71■■■□□ 2.19
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 DroshaQ5HZJ0 1373 aaKnown RBP28.7■■■□□ 2.18
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ak9G3UYQ4 1894 aa28.69■■■□□ 2.18
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Abca17E9PX95 1733 aa28.67■■■□□ 2.18
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Adgrl3Q80TS3 1537 aa28.67■■■□□ 2.18
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Usp47Q8BY87 1376 aa28.66■■■□□ 2.18
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 PtprgQ05909 1442 aa28.65■■■□□ 2.18
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Map4P27546 1125 aaKnown RBP28.65■■■□□ 2.18
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Arid3cA6PWV5 409 aa28.65■■■□□ 2.18
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Trak1Q6PD31 939 aa28.57■■■□□ 2.16
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Asxl1P59598 1514 aa28.57■■■□□ 2.16
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Spag9Q58A65 1321 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Xrn1P97789 1719 aaKnown RBP28.56■■■□□ 2.16
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Dhx9O70133 1380 aaKnown RBP28.55■■■□□ 2.16
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Robo2Q7TPD3 1470 aa28.53■■■□□ 2.16
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Lemd3Q9WU40 921 aa28.53■■■□□ 2.16
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Nos1Q9Z0J4 1429 aa28.53■■■□□ 2.16
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gm13697A2AK42 830 aa28.53■■■□□ 2.16
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Map3k5O35099 1380 aa28.52■■■□□ 2.16
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Kif1bQ60575 1816 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.16
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Kif14L0N7N1 1674 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.15
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Usp54Q8BL06 1588 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 14.9 ms