RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000594624.6

LIPE-AS1-204, LIPE antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LIPE-AS1, Length 1,448 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPE-AS1-204ENST00000594624 CPT1AP50416 773 aa16■□□□□ 0.15
LIPE-AS1-204ENST00000594624 PDE1AP54750 535 aa16■□□□□ 0.15
LIPE-AS1-204ENST00000594624 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
LIPE-AS1-204ENST00000594624 WDR11Q9BZH6 1224 aa16■□□□□ 0.15
LIPE-AS1-204ENST00000594624 RAD50Q92878 1312 aa16■□□□□ 0.15
LIPE-AS1-204ENST00000594624 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
LIPE-AS1-204ENST00000594624 RRP1P56182 461 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
LIPE-AS1-204ENST00000594624 TTBK2Q6IQ55 1244 aa15.99■□□□□ 0.15
LIPE-AS1-204ENST00000594624 TMEM47Q9BQJ4 181 aa15.99■□□□□ 0.15
LIPE-AS1-204ENST00000594624 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
LIPE-AS1-204ENST00000594624 GPCPD1Q9NPB8 672 aa15.99■□□□□ 0.15
LIPE-AS1-204ENST00000594624 ZMYM6O95789 1325 aa15.99■□□□□ 0.15
LIPE-AS1-204ENST00000594624 GRXCR1A8MXD5 290 aa15.98■□□□□ 0.15
LIPE-AS1-204ENST00000594624 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP15.98■□□□□ 0.15
LIPE-AS1-204ENST00000594624 NT5C2P49902 561 aa15.98■□□□□ 0.15
LIPE-AS1-204ENST00000594624 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
LIPE-AS1-204ENST00000594624 TJAP1Q5JTD0 557 aa15.98■□□□□ 0.15
LIPE-AS1-204ENST00000594624 AKNAD1Q5T1N1 836 aa15.98■□□□□ 0.15
LIPE-AS1-204ENST00000594624 MFSD6Q6ZSS7 791 aa15.98■□□□□ 0.15
LIPE-AS1-204ENST00000594624 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
LIPE-AS1-204ENST00000594624 TRPV6Q9H1D0 765 aa15.98■□□□□ 0.15
LIPE-AS1-204ENST00000594624 SLC28A3Q9HAS3 691 aa15.98■□□□□ 0.15
LIPE-AS1-204ENST00000594624 NFIBO00712 420 aa15.97■□□□□ 0.15
LIPE-AS1-204ENST00000594624 GRIN2DO15399 1336 aa15.97■□□□□ 0.15
LIPE-AS1-204ENST00000594624 B4GALT4O60513 344 aa15.97■□□□□ 0.15
LIPE-AS1-204ENST00000594624 KPNA6O60684 536 aa15.97■□□□□ 0.15
LIPE-AS1-204ENST00000594624 PFKMP08237 780 aa15.97■□□□□ 0.15
LIPE-AS1-204ENST00000594624 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
LIPE-AS1-204ENST00000594624 PDHBP11177 359 aa15.97■□□□□ 0.15
LIPE-AS1-204ENST00000594624 CALML3P27482 149 aa15.97■□□□□ 0.15
LIPE-AS1-204ENST00000594624 PBX2P40425 430 aa15.97■□□□□ 0.15
LIPE-AS1-204ENST00000594624 CCL23P55773 120 aa15.97■□□□□ 0.15
LIPE-AS1-204ENST00000594624 PDE4DQ08499 809 aa15.97■□□□□ 0.15
LIPE-AS1-204ENST00000594624 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
LIPE-AS1-204ENST00000594624 RNF207Q6ZRF8 634 aa15.97■□□□□ 0.15
LIPE-AS1-204ENST00000594624 RASGRP2Q7LDG7 609 aa15.97■□□□□ 0.15
LIPE-AS1-204ENST00000594624 DNERQ8NFT8 737 aa15.97■□□□□ 0.15
LIPE-AS1-204ENST00000594624 FAM227BQ96M60 508 aa15.97■□□□□ 0.15
LIPE-AS1-204ENST00000594624 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
LIPE-AS1-204ENST00000594624 PRDM12Q9H4Q4 367 aa15.97■□□□□ 0.15
LIPE-AS1-204ENST00000594624 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa15.97■□□□□ 0.15
LIPE-AS1-204ENST00000594624 CDH23Q9H251 3354 aa15.97■□□□□ 0.15
LIPE-AS1-204ENST00000594624 WDR19Q8NEZ3 1342 aa15.96■□□□□ 0.15
LIPE-AS1-204ENST00000594624 A0A0D9SFI3 127 aa15.96■□□□□ 0.15
LIPE-AS1-204ENST00000594624 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
LIPE-AS1-204ENST00000594624 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa15.96■□□□□ 0.15
LIPE-AS1-204ENST00000594624 PSMC6P62333 389 aa15.96■□□□□ 0.15
LIPE-AS1-204ENST00000594624 ZNF543Q08ER8 600 aa15.96■□□□□ 0.15
LIPE-AS1-204ENST00000594624 AAMPQ13685 434 aa15.96■□□□□ 0.15
LIPE-AS1-204ENST00000594624 PPP2R5BQ15173 497 aa15.96■□□□□ 0.15
LIPE-AS1-204ENST00000594624 CCDC178Q5BJE1 867 aa15.96■□□□□ 0.15
LIPE-AS1-204ENST00000594624 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
LIPE-AS1-204ENST00000594624 OTOP2Q7RTS6 562 aa15.96■□□□□ 0.15
LIPE-AS1-204ENST00000594624 OR6J1Q8NGC5 347 aa15.96■□□□□ 0.15
LIPE-AS1-204ENST00000594624 SCFD2Q8WU76 684 aa15.96■□□□□ 0.15
LIPE-AS1-204ENST00000594624 ESR2Q92731 530 aa15.96■□□□□ 0.15
LIPE-AS1-204ENST00000594624 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
LIPE-AS1-204ENST00000594624 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
LIPE-AS1-204ENST00000594624 MAF1Q9H063 256 aa15.96■□□□□ 0.15
LIPE-AS1-204ENST00000594624 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
LIPE-AS1-204ENST00000594624 MYO9BQ13459 2157 aa15.96■□□□□ 0.14
LIPE-AS1-204ENST00000594624 CCDC171Q6TFL3 1326 aa15.95■□□□□ 0.14
LIPE-AS1-204ENST00000594624 MYL3P08590 195 aa15.95■□□□□ 0.14
LIPE-AS1-204ENST00000594624 PURAQ00577 322 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
LIPE-AS1-204ENST00000594624 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
LIPE-AS1-204ENST00000594624 TNKSO95271 1327 aa15.95■□□□□ 0.14
LIPE-AS1-204ENST00000594624 UMODL1Q5DID0 1318 aa15.95■□□□□ 0.14
LIPE-AS1-204ENST00000594624 ACTN1P12814 892 aa15.94■□□□□ 0.14
LIPE-AS1-204ENST00000594624 HAND2P61296 217 aa15.94■□□□□ 0.14
LIPE-AS1-204ENST00000594624 RPS6P62753 249 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
LIPE-AS1-204ENST00000594624 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
LIPE-AS1-204ENST00000594624 SLC30A10Q6XR72 485 aa15.94■□□□□ 0.14
LIPE-AS1-204ENST00000594624 RGS22Q8NE09 1264 aa15.94■□□□□ 0.14
LIPE-AS1-204ENST00000594624 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
LIPE-AS1-204ENST00000594624 CLEC4DQ8WXI8 215 aa15.94■□□□□ 0.14
LIPE-AS1-204ENST00000594624 RILPL2Q969X0 211 aa15.94■□□□□ 0.14
LIPE-AS1-204ENST00000594624 CRBNQ96SW2 442 aa15.94■□□□□ 0.14
LIPE-AS1-204ENST00000594624 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa15.94■□□□□ 0.14
LIPE-AS1-204ENST00000594624 ZBBXA8MT70 800 aa15.94■□□□□ 0.14
LIPE-AS1-204ENST00000594624 SNHG28P0DPA3 235 aa15.94■□□□□ 0.14
LIPE-AS1-204ENST00000594624 IGFBP4P22692 258 aa15.94■□□□□ 0.14
LIPE-AS1-204ENST00000594624 PTGS1P23219 599 aa15.94■□□□□ 0.14
LIPE-AS1-204ENST00000594624 RFC2P35250 354 aa15.94■□□□□ 0.14
LIPE-AS1-204ENST00000594624 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
LIPE-AS1-204ENST00000594624 FAM47CQ5HY64 1035 aa15.94■□□□□ 0.14
LIPE-AS1-204ENST00000594624 TMEM63BQ5T3F8 832 aa15.94■□□□□ 0.14
LIPE-AS1-204ENST00000594624 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
LIPE-AS1-204ENST00000594624 IQCA1Q86XH1 822 aa15.94■□□□□ 0.14
LIPE-AS1-204ENST00000594624 DGKHQ86XP1 1220 aa15.94■□□□□ 0.14
LIPE-AS1-204ENST00000594624 USP38Q8NB14 1042 aa15.94■□□□□ 0.14
LIPE-AS1-204ENST00000594624 RETREG2Q8NC44 543 aa15.94■□□□□ 0.14
LIPE-AS1-204ENST00000594624 PPM1EQ8WY54 764 aa15.94■□□□□ 0.14
LIPE-AS1-204ENST00000594624 WNT8AQ9H1J5 351 aa15.94■□□□□ 0.14
LIPE-AS1-204ENST00000594624 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
LIPE-AS1-204ENST00000594624 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa15.94■□□□□ 0.14
LIPE-AS1-204ENST00000594624 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa15.93■□□□□ 0.14
LIPE-AS1-204ENST00000594624 VCANP13611 3396 aa15.93■□□□□ 0.14
LIPE-AS1-204ENST00000594624 EYSQ5T1H1 3165 aa15.93■□□□□ 0.14
LIPE-AS1-204ENST00000594624 LRRC37A2A6NM11 1700 aa15.93■□□□□ 0.14
LIPE-AS1-204ENST00000594624 ZNF213O14771 459 aa15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.7 ms