RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586851.5

CAPNS1-202, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 616 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-202ENST00000586851 CCDC96Q2M329 555 aa8.58□□□□□ -1.04
CAPNS1-202ENST00000586851 TMEM266Q2M3C6 531 aa8.58□□□□□ -1.04
CAPNS1-202ENST00000586851 CFAP58Q5T655 872 aa8.58□□□□□ -1.04
CAPNS1-202ENST00000586851 MCTP2Q6DN12 878 aa8.58□□□□□ -1.04
CAPNS1-202ENST00000586851 NCAPH2Q6IBW4 605 aa8.58□□□□□ -1.04
CAPNS1-202ENST00000586851 C8orf74Q6P047 294 aa8.58□□□□□ -1.04
CAPNS1-202ENST00000586851 WDR59Q6PJI9 974 aa8.58□□□□□ -1.04
CAPNS1-202ENST00000586851 KDM7AQ6ZMT4 941 aa8.58□□□□□ -1.04
CAPNS1-202ENST00000586851 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa8.58□□□□□ -1.04
CAPNS1-202ENST00000586851 IRF2BP1Q8IU81 584 aa8.58□□□□□ -1.04
CAPNS1-202ENST00000586851 MICALL1Q8N3F8 863 aa8.58□□□□□ -1.04
CAPNS1-202ENST00000586851 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
CAPNS1-202ENST00000586851 KCTD17Q8N5Z5 321 aa8.58□□□□□ -1.04
CAPNS1-202ENST00000586851 C4orf32Q8N8J7 132 aa8.58□□□□□ -1.04
CAPNS1-202ENST00000586851 PIGBQ92521 554 aa8.58□□□□□ -1.04
CAPNS1-202ENST00000586851 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
CAPNS1-202ENST00000586851 CEP63Q96MT8 703 aa8.58□□□□□ -1.04
CAPNS1-202ENST00000586851 MMS19Q96T76 1030 aa8.58□□□□□ -1.04
CAPNS1-202ENST00000586851 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
CAPNS1-202ENST00000586851 SPZ1Q9BXG8 430 aa8.58□□□□□ -1.04
CAPNS1-202ENST00000586851 GLT8D2Q9H1C3 349 aa8.58□□□□□ -1.04
CAPNS1-202ENST00000586851 EPC1Q9H2F5 836 aa8.58□□□□□ -1.04
CAPNS1-202ENST00000586851 C6orf50Q9HD87 102 aa8.58□□□□□ -1.04
CAPNS1-202ENST00000586851 TAOK2Q9UL54 1235 aa8.58□□□□□ -1.04
CAPNS1-202ENST00000586851 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
CAPNS1-202ENST00000586851 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
CAPNS1-202ENST00000586851 ATAD5Q96QE3 1844 aa8.58□□□□□ -1.04
CAPNS1-202ENST00000586851 KIF13BQ9NQT8 1826 aa8.58□□□□□ -1.04
CAPNS1-202ENST00000586851 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
CAPNS1-202ENST00000586851 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
CAPNS1-202ENST00000586851 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa8.57□□□□□ -1.04
CAPNS1-202ENST00000586851 TMCO5BA8MYB1 307 aa8.57□□□□□ -1.04
CAPNS1-202ENST00000586851 KLRC4O43908 158 aa8.57□□□□□ -1.04
CAPNS1-202ENST00000586851 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
CAPNS1-202ENST00000586851 OR52Z1P0C646 297 aa8.57□□□□□ -1.04
CAPNS1-202ENST00000586851 MCM7P33993 719 aa8.57□□□□□ -1.04
CAPNS1-202ENST00000586851 IRAK1P51617 712 aa8.57□□□□□ -1.04
CAPNS1-202ENST00000586851 BIRC3Q13489 604 aa8.57□□□□□ -1.04
CAPNS1-202ENST00000586851 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
CAPNS1-202ENST00000586851 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa8.57□□□□□ -1.04
CAPNS1-202ENST00000586851 CENPPQ6IPU0 288 aa8.57□□□□□ -1.04
CAPNS1-202ENST00000586851 PPP1R18Q6NYC8 613 aa8.57□□□□□ -1.04
CAPNS1-202ENST00000586851 RUFY4Q6ZNE9 571 aa8.57□□□□□ -1.04
CAPNS1-202ENST00000586851 UNC13DQ70J99 1090 aa8.57□□□□□ -1.04
CAPNS1-202ENST00000586851 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa8.57□□□□□ -1.04
CAPNS1-202ENST00000586851 SPATA4Q8NEY3 305 aa8.57□□□□□ -1.04
CAPNS1-202ENST00000586851 LRRC45Q96CN5 670 aa8.57□□□□□ -1.04
CAPNS1-202ENST00000586851 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
CAPNS1-202ENST00000586851 CHP1Q99653 195 aa8.57□□□□□ -1.04
CAPNS1-202ENST00000586851 TRIM9Q9C026 710 aa8.57□□□□□ -1.04
CAPNS1-202ENST00000586851 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
CAPNS1-202ENST00000586851 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
CAPNS1-202ENST00000586851 BARHL2Q9NY43 387 aa8.57□□□□□ -1.04
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
CAPNS1-202ENST00000586851 STRCP1A6NGW2 1772 aa8.56□□□□□ -1.04
CAPNS1-202ENST00000586851 TSPY2A6NKD2 308 aa8.56□□□□□ -1.04
CAPNS1-202ENST00000586851 CCDC188H7C350 402 aa8.56□□□□□ -1.04
CAPNS1-202ENST00000586851 M0R2N6 131 aa8.56□□□□□ -1.04
CAPNS1-202ENST00000586851 PES1O00541 588 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
CAPNS1-202ENST00000586851 AKR1B10O60218 316 aa8.56□□□□□ -1.04
CAPNS1-202ENST00000586851 GFPT2O94808 682 aa8.56□□□□□ -1.04
CAPNS1-202ENST00000586851 FSBPO95073 299 aa8.56□□□□□ -1.04
CAPNS1-202ENST00000586851 PLEKHA8P1O95397 391 aa8.56□□□□□ -1.04
CAPNS1-202ENST00000586851 ADAMTS2O95450 1211 aa8.56□□□□□ -1.04
CAPNS1-202ENST00000586851 LDHCP07864 332 aa8.56□□□□□ -1.04
CAPNS1-202ENST00000586851 GPTP24298 496 aa8.56□□□□□ -1.04
CAPNS1-202ENST00000586851 INPP5BP32019 993 aa8.56□□□□□ -1.04
CAPNS1-202ENST00000586851 GBP1P32455 592 aa8.56□□□□□ -1.04
CAPNS1-202ENST00000586851 GGCXP38435 758 aa8.56□□□□□ -1.04
CAPNS1-202ENST00000586851 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP8.56□□□□□ -1.045e-6■■□□□ 12.9
CAPNS1-202ENST00000586851 KIF11P52732 1056 aa8.56□□□□□ -1.04
CAPNS1-202ENST00000586851 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
CAPNS1-202ENST00000586851 CHRNDQ07001 517 aa8.56□□□□□ -1.04
CAPNS1-202ENST00000586851 PDE4DQ08499 809 aa8.56□□□□□ -1.04
CAPNS1-202ENST00000586851 PDIA5Q14554 519 aa8.56□□□□□ -1.04
CAPNS1-202ENST00000586851 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP8.56□□□□□ -1.04
CAPNS1-202ENST00000586851 HLFQ16534 295 aa8.56□□□□□ -1.04
CAPNS1-202ENST00000586851 SOGA3Q5TF21 947 aa8.56□□□□□ -1.04
CAPNS1-202ENST00000586851 PPP4R3AQ6IN85 833 aa8.56□□□□□ -1.04
CAPNS1-202ENST00000586851 SV2BQ7L1I2 683 aa8.56□□□□□ -1.04
CAPNS1-202ENST00000586851 CABP7Q86V35 215 aa8.56□□□□□ -1.04
CAPNS1-202ENST00000586851 CREG2Q8IUH2 290 aa8.56□□□□□ -1.04
CAPNS1-202ENST00000586851 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
CAPNS1-202ENST00000586851 BCAS4Q8TDM0 211 aa8.56□□□□□ -1.04
CAPNS1-202ENST00000586851 LMBR1Q8WVP7 490 aa8.56□□□□□ -1.04
CAPNS1-202ENST00000586851 PBKQ96KB5 322 aa8.56□□□□□ -1.04
CAPNS1-202ENST00000586851 OSBPL9Q96SU4 736 aa8.56□□□□□ -1.04
CAPNS1-202ENST00000586851 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
CAPNS1-202ENST00000586851 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa8.56□□□□□ -1.04
CAPNS1-202ENST00000586851 ZMYND12Q9H0C1 365 aa8.56□□□□□ -1.04
CAPNS1-202ENST00000586851 SEC31BQ9NQW1 1179 aa8.56□□□□□ -1.04
CAPNS1-202ENST00000586851 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
CAPNS1-202ENST00000586851 CCDC87Q9NVE4 849 aa8.56□□□□□ -1.04
CAPNS1-202ENST00000586851 CEP72Q9P209 647 aa8.56□□□□□ -1.04
CAPNS1-202ENST00000586851 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa8.56□□□□□ -1.04
CAPNS1-202ENST00000586851 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa8.55□□□□□ -1.04
CAPNS1-202ENST00000586851 B4DLN1 442 aa8.55□□□□□ -1.04
CAPNS1-202ENST00000586851 PRKAB2O43741 272 aa8.55□□□□□ -1.04
CAPNS1-202ENST00000586851 TRIM37O94972 964 aa8.55□□□□□ -1.04
CAPNS1-202ENST00000586851 BAG3O95817 575 aa8.55□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.6 ms