RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566515.5

CCNDBP1-208, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 1,634 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-208ENST00000566515 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa24.21■■□□□ 1.47
CCNDBP1-208ENST00000566515 MCF2L2Q86YR7 1114 aa24.21■■□□□ 1.47
CCNDBP1-208ENST00000566515 PHKBQ93100 1093 aa24.21■■□□□ 1.47
CCNDBP1-208ENST00000566515 ASTN1O14525 1302 aa24.21■■□□□ 1.47
CCNDBP1-208ENST00000566515 CFBP00751 764 aa24.21■■□□□ 1.47
CCNDBP1-208ENST00000566515 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP24.21■■□□□ 1.475e-6■□□□□ 9.8
CCNDBP1-208ENST00000566515 RNF208Q9H0X6 261 aa24.21■■□□□ 1.47
CCNDBP1-208ENST00000566515 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
CCNDBP1-208ENST00000566515 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa24.2■■□□□ 1.46
CCNDBP1-208ENST00000566515 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa24.2■■□□□ 1.46
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
CCNDBP1-208ENST00000566515 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
CCNDBP1-208ENST00000566515 PFKFB2O60825 505 aa24.19■■□□□ 1.46
CCNDBP1-208ENST00000566515 LARGE1O95461 756 aa24.19■■□□□ 1.46
CCNDBP1-208ENST00000566515 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
CCNDBP1-208ENST00000566515 SCRN1Q12765 414 aa24.19■■□□□ 1.46
CCNDBP1-208ENST00000566515 RPTORQ8N122 1335 aa24.18■■□□□ 1.46
CCNDBP1-208ENST00000566515 IFNAR1P17181 557 aa24.18■■□□□ 1.46
CCNDBP1-208ENST00000566515 RABEP1Q15276 862 aa24.18■■□□□ 1.46
CCNDBP1-208ENST00000566515 ME3Q16798 604 aa24.18■■□□□ 1.46
CCNDBP1-208ENST00000566515 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa24.18■■□□□ 1.46
CCNDBP1-208ENST00000566515 TRPV1Q8NER1 839 aa24.18■■□□□ 1.46
CCNDBP1-208ENST00000566515 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
CCNDBP1-208ENST00000566515 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
CCNDBP1-208ENST00000566515 COL20A1Q9P218 1284 aa24.18■■□□□ 1.46
CCNDBP1-208ENST00000566515 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
CCNDBP1-208ENST00000566515 CPLX1O14810 134 aa24.17■■□□□ 1.46
CCNDBP1-208ENST00000566515 CAPN15O75808 1086 aa24.17■■□□□ 1.46
CCNDBP1-208ENST00000566515 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
CCNDBP1-208ENST00000566515 WWC2Q6AWC2 1192 aa24.17■■□□□ 1.46
CCNDBP1-208ENST00000566515 NECAB1Q8N987 351 aa24.17■■□□□ 1.46
CCNDBP1-208ENST00000566515 TMEM106CQ9BVX2 250 aa24.17■■□□□ 1.46
CCNDBP1-208ENST00000566515 SLC26A6Q9BXS9 759 aa24.17■■□□□ 1.46
CCNDBP1-208ENST00000566515 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP24.17■■□□□ 1.46
CCNDBP1-208ENST00000566515 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
CCNDBP1-208ENST00000566515 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
CCNDBP1-208ENST00000566515 HSD17B4P51659 736 aa24.17■■□□□ 1.46
CCNDBP1-208ENST00000566515 SOX10P56693 466 aa24.17■■□□□ 1.46
CCNDBP1-208ENST00000566515 ARMCX2Q7L311 632 aa24.17■■□□□ 1.46
CCNDBP1-208ENST00000566515 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
CCNDBP1-208ENST00000566515 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
CCNDBP1-208ENST00000566515 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa24.16■■□□□ 1.46
CCNDBP1-208ENST00000566515 DTNBO60941 627 aa24.16■■□□□ 1.46
CCNDBP1-208ENST00000566515 CYBAP13498 195 aa24.16■■□□□ 1.46
CCNDBP1-208ENST00000566515 CNGA1P29973 690 aa24.16■■□□□ 1.46
CCNDBP1-208ENST00000566515 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
CCNDBP1-208ENST00000566515 TAAR1Q96RJ0 339 aa24.16■■□□□ 1.46
CCNDBP1-208ENST00000566515 MAF1Q9H063 256 aa24.16■■□□□ 1.46
CCNDBP1-208ENST00000566515 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
CCNDBP1-208ENST00000566515 POTEFA5A3E0 1075 aa24.15■■□□□ 1.46
CCNDBP1-208ENST00000566515 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
CCNDBP1-208ENST00000566515 POLR2MP0CAP2 368 aa24.15■■□□□ 1.46
CCNDBP1-208ENST00000566515 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
CCNDBP1-208ENST00000566515 GHRHRQ02643 423 aa24.15■■□□□ 1.46
CCNDBP1-208ENST00000566515 PKN1Q16512 942 aa24.15■■□□□ 1.46
CCNDBP1-208ENST00000566515 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
CCNDBP1-208ENST00000566515 DEFB118Q96PH6 123 aa24.15■■□□□ 1.46
CCNDBP1-208ENST00000566515 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
CCNDBP1-208ENST00000566515 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
CCNDBP1-208ENST00000566515 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa24.15■■□□□ 1.46
CCNDBP1-208ENST00000566515 ASB14A6NK59 587 aa24.14■■□□□ 1.46
CCNDBP1-208ENST00000566515 SCG2P13521 617 aa24.14■■□□□ 1.46
CCNDBP1-208ENST00000566515 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.46
CCNDBP1-208ENST00000566515 TYW1BQ6NUM6 668 aa24.14■■□□□ 1.46
CCNDBP1-208ENST00000566515 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.46
CCNDBP1-208ENST00000566515 CNPY2Q9Y2B0 182 aa24.14■■□□□ 1.46
CCNDBP1-208ENST00000566515 STXBP3O00186 592 aa24.13■■□□□ 1.45
CCNDBP1-208ENST00000566515 GJB1P08034 283 aa24.13■■□□□ 1.45
CCNDBP1-208ENST00000566515 NAPAP54920 295 aa24.13■■□□□ 1.45
CCNDBP1-208ENST00000566515 USP17L6PQ6QN14 398 aa24.13■■□□□ 1.45
CCNDBP1-208ENST00000566515 DNERQ8NFT8 737 aa24.13■■□□□ 1.45
CCNDBP1-208ENST00000566515 PSTPIP2Q9H939 334 aa24.13■■□□□ 1.45
CCNDBP1-208ENST00000566515 BARHL2Q9NY43 387 aa24.13■■□□□ 1.45
CCNDBP1-208ENST00000566515 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
CCNDBP1-208ENST00000566515 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
CCNDBP1-208ENST00000566515 FCHSD1Q86WN1 690 aa24.13■■□□□ 1.45
CCNDBP1-208ENST00000566515 TRIM22Q8IYM9 498 aa24.13■■□□□ 1.45
CCNDBP1-208ENST00000566515 SAMD3Q8N6K7 520 aa24.13■■□□□ 1.45
CCNDBP1-208ENST00000566515 GTF3C6Q969F1 213 aa24.13■■□□□ 1.45
CCNDBP1-208ENST00000566515 RMDN3Q96TC7 470 aa24.13■■□□□ 1.45
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
CCNDBP1-208ENST00000566515 hCG_1984214I3L0E3 225 aa24.11■■□□□ 1.45
CCNDBP1-208ENST00000566515 MEIS2O14770 477 aa24.11■■□□□ 1.45
CCNDBP1-208ENST00000566515 ST18O60284 1047 aa24.11■■□□□ 1.45
CCNDBP1-208ENST00000566515 CTDNEP1O95476 244 aa24.11■■□□□ 1.45
CCNDBP1-208ENST00000566515 ACVR2BQ13705 512 aa24.11■■□□□ 1.45
CCNDBP1-208ENST00000566515 ARHGEF16Q5VV41 709 aa24.11■■□□□ 1.45
CCNDBP1-208ENST00000566515 EEPD1Q7L9B9 569 aa24.11■■□□□ 1.45
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
CCNDBP1-208ENST00000566515 MORC4Q8TE76 937 aa24.11■■□□□ 1.45
CCNDBP1-208ENST00000566515 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
CCNDBP1-208ENST00000566515 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
CCNDBP1-208ENST00000566515 CUL5Q93034 780 aa24.11■■□□□ 1.45
CCNDBP1-208ENST00000566515 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa24.11■■□□□ 1.45
CCNDBP1-208ENST00000566515 NRBP1Q9UHY1 535 aa24.11■■□□□ 1.45
CCNDBP1-208ENST00000566515 LRRC37A2A6NM11 1700 aa24.11■■□□□ 1.45
CCNDBP1-208ENST00000566515 CDKL5O76039 1030 aa24.1■■□□□ 1.45
CCNDBP1-208ENST00000566515 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
CCNDBP1-208ENST00000566515 EN2P19622 333 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.5 ms