RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-231ENST00000552222 TNKSO95271 1327 aa16.4■□□□□ 0.22
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CS-231ENST00000552222 DEFB103AP81534 67 aa16.39■□□□□ 0.21
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CS-231ENST00000552222 FAM133AQ8N9E0 248 aa16.39■□□□□ 0.21
CS-231ENST00000552222 AP5M1Q9H0R1 490 aa16.39■□□□□ 0.21
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CS-231ENST00000552222 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
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CS-231ENST00000552222 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
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CS-231ENST00000552222 CLIP2Q9UDT6 1046 aa16.37■□□□□ 0.21
CS-231ENST00000552222 ATP2A1O14983 1001 aa16.36■□□□□ 0.21
CS-231ENST00000552222 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
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CS-231ENST00000552222 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa16.36■□□□□ 0.21
CS-231ENST00000552222 MUM1L1Q5H9M0 696 aa16.36■□□□□ 0.21
CS-231ENST00000552222 RILPL2Q969X0 211 aa16.36■□□□□ 0.21
CS-231ENST00000552222 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
CS-231ENST00000552222 SDSP20132 328 aa16.35■□□□□ 0.21
CS-231ENST00000552222 NBPF20Q3BBV1 942 aa16.35■□□□□ 0.21
CS-231ENST00000552222 LEXMQ3ZCV2 418 aa16.35■□□□□ 0.21
CS-231ENST00000552222 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa16.35■□□□□ 0.21
CS-231ENST00000552222 ZNF536O15090 1300 aa16.35■□□□□ 0.21
CS-231ENST00000552222 GRXCR2A6NFK2 248 aa16.34■□□□□ 0.21
CS-231ENST00000552222 PRDM1O75626 825 aa16.34■□□□□ 0.21
CS-231ENST00000552222 WDR5P61964 334 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
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CS-231ENST00000552222 IER5LQ5T953 404 aa16.34■□□□□ 0.21
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CS-231ENST00000552222 ACTN1P12814 892 aa16.33■□□□□ 0.2
CS-231ENST00000552222 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa16.33■□□□□ 0.2
CS-231ENST00000552222 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP16.33■□□□□ 0.2
CS-231ENST00000552222 C17orf80Q9BSJ5 609 aa16.33■□□□□ 0.2
CS-231ENST00000552222 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
CS-231ENST00000552222 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa16.33■□□□□ 0.2
CS-231ENST00000552222 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa16.33■□□□□ 0.2
CS-231ENST00000552222 POTEB3A0JP26 581 aa16.32■□□□□ 0.2
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CS-231ENST00000552222 KIF28PB7ZC32 967 aa16.32■□□□□ 0.2
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CS-231ENST00000552222 ALAS1P13196 640 aa16.32■□□□□ 0.2
CS-231ENST00000552222 BMP2KLQ5H9B9 411 aa16.32■□□□□ 0.2
CS-231ENST00000552222 POTEBQ6S5H4 581 aa16.32■□□□□ 0.2
CS-231ENST00000552222 EP400NLQ6ZTU2 488 aa16.32■□□□□ 0.2
CS-231ENST00000552222 PRSS33Q8NF86 280 aa16.32■□□□□ 0.2
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CS-231ENST00000552222 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP16.32■□□□□ 0.2
CS-231ENST00000552222 ACAD9Q9H845 621 aa16.32■□□□□ 0.2
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CS-231ENST00000552222 IQSEC1Q6DN90 963 aa16.31■□□□□ 0.2
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CS-231ENST00000552222 NYAP2Q9P242 653 aa16.31■□□□□ 0.2
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CS-231ENST00000552222 LCTP09848 1927 aa16.31■□□□□ 0.2
CS-231ENST00000552222 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa16.3■□□□□ 0.2
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CS-231ENST00000552222 MINDY4BA8MYZ0 360 aa16.3■□□□□ 0.2
CS-231ENST00000552222 M0R2C6 588 aa16.3■□□□□ 0.2
CS-231ENST00000552222 HIP1O00291 1037 aa16.3■□□□□ 0.2
CS-231ENST00000552222 NSMFQ6X4W1 530 aa16.3■□□□□ 0.2
CS-231ENST00000552222 RETREG2Q8NC44 543 aa16.3■□□□□ 0.2
CS-231ENST00000552222 CEP95Q96GE4 821 aa16.3■□□□□ 0.2
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