RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527224.1

PACS1-205, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene PACS1, Length 3,024 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-205ENST00000527224 ZNF844Q08AG5 666 aa20.53■□□□□ 0.88
PACS1-205ENST00000527224 SPA17Q15506 151 aa20.53■□□□□ 0.88
PACS1-205ENST00000527224 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
PACS1-205ENST00000527224 MST1RQ04912 1400 aa20.53■□□□□ 0.88
PACS1-205ENST00000527224 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
PACS1-205ENST00000527224 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
PACS1-205ENST00000527224 ECEL1O95672 775 aa20.53■□□□□ 0.88
PACS1-205ENST00000527224 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa20.53■□□□□ 0.88
PACS1-205ENST00000527224 CCDC42Q96M95 316 aa20.53■□□□□ 0.88
PACS1-205ENST00000527224 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
PACS1-205ENST00000527224 ABCF3Q9NUQ8 709 aa20.53■□□□□ 0.88
PACS1-205ENST00000527224 CAPN11Q9UMQ6 739 aa20.53■□□□□ 0.88
PACS1-205ENST00000527224 C5orf60A6NFR6 353 aa20.52■□□□□ 0.88
PACS1-205ENST00000527224 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
PACS1-205ENST00000527224 MYL6BP14649 208 aa20.52■□□□□ 0.88
PACS1-205ENST00000527224 SCNN1BP51168 640 aa20.52■□□□□ 0.88
PACS1-205ENST00000527224 APOA5Q6Q788 366 aa20.52■□□□□ 0.88
PACS1-205ENST00000527224 TEKT4Q8WW24 435 aa20.52■□□□□ 0.88
PACS1-205ENST00000527224 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
PACS1-205ENST00000527224 GOLGA8AA7E2F4 631 aa20.52■□□□□ 0.88
PACS1-205ENST00000527224 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
PACS1-205ENST00000527224 SPATA21Q7Z572 469 aa20.52■□□□□ 0.88
PACS1-205ENST00000527224 IRF2BP1Q8IU81 584 aa20.52■□□□□ 0.88
PACS1-205ENST00000527224 MFN1Q8IWA4 741 aa20.52■□□□□ 0.88
PACS1-205ENST00000527224 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa20.52■□□□□ 0.88
PACS1-205ENST00000527224 PTPRUQ92729 1446 aa20.52■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 PMS1P54277 932 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 TMEM165Q9HC07 324 aa20.51■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 STRN4Q9NRL3 753 aa20.51■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 CEP131Q9UPN4 1083 aa20.51■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 FLT4P35916 1363 aa20.51■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 RNF8O76064 485 aa20.51■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 GHRP10912 638 aa20.51■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 FERP16591 822 aa20.51■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 TCP1P17987 556 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP20.51■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 HHATQ5VTY9 493 aa20.51■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 ALS2CR12Q96Q35 445 aa20.51■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 MYD88Q99836 296 aa20.51■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 MTFR1LQ9H019 292 aa20.51■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 RGL1Q9NZL6 768 aa20.51■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 SLC12A4Q9UP95 1085 aa20.51■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 C2CD2Q9Y426 696 aa20.51■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 CD2APQ9Y5K6 639 aa20.51■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 ZNF213O14771 459 aa20.51■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 CDKL5O76039 1030 aa20.51■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 SPAG1Q07617 926 aa20.51■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 PTPROQ16827 1216 aa20.51■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 GSDMAQ96QA5 445 aa20.51■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 TLR10Q9BXR5 811 aa20.51■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 SH2D4AQ9H788 454 aa20.51■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP20.5■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 POLE2P56282 527 aa20.5■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 CHMP6Q96FZ7 201 aa20.5■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 KIF13AQ9H1H9 1805 aa20.5■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 B4E1Z4 1266 aa20.5■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 H7C1W4 665 aa20.5■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 RAD51CO43502 376 aa20.5■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 TNFRSF8P28908 595 aa20.5■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 SLC17A8Q8NDX2 589 aa20.5■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 TRIM33Q9UPN9 1127 aa20.5■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 ZBTB43O43298 467 aa20.49■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 ORC4O43929 436 aa20.49■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 FAM163BP0C2L3 166 aa20.49■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 FLT3P36888 993 aa20.49■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa20.49■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 XDHP47989 1333 aa20.49■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP20.49■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 USO1O60763 962 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 FTCDO95954 541 aa20.49■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 PRCPP42785 496 aa20.49■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 ITIH3Q06033 890 aa20.49■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 NTRK3Q16288 839 aa20.49■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa20.49■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 FBXL16Q8N461 479 aa20.49■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 CCHCR1Q8TD31 782 aa20.49■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 TBC1D5Q92609 795 aa20.49■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 C3P01024 1663 aa20.49■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 RASSF10A6NK89 507 aa20.48■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 WNT7AO00755 349 aa20.48■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 UBOX5O94941 541 aa20.48■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 MMP1P03956 469 aa20.48■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 SHBGP04278 402 aa20.48■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 KRT16P08779 473 aa20.48■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 MEA1Q16626 185 aa20.48■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 CNBD1Q8NA66 436 aa20.48■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 RWDD2AQ9UIY3 292 aa20.48■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 LGALS16A8MUM7 142 aa20.48■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 NQO1P15559 274 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
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