RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507116.5

PDE4D-216, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 3,350 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-216ENST00000507116 NLRP12P59046 1061 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-216ENST00000507116 CHMP4BP1P59074 171 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-216ENST00000507116 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-216ENST00000507116 ACAP1Q15027 740 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-216ENST00000507116 BMP2KLQ5H9B9 411 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-216ENST00000507116 KCTD16Q68DU8 428 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-216ENST00000507116 UNC5DQ6UXZ4 953 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-216ENST00000507116 BEND5Q7L4P6 421 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-216ENST00000507116 VPS36Q86VN1 386 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-216ENST00000507116 SPARTQ8N0X7 666 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-216ENST00000507116 LARGE2Q8N3Y3 721 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-216ENST00000507116 NPLOC4Q8TAT6 608 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-216ENST00000507116 NCSTNQ92542 709 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-216ENST00000507116 COG3Q96JB2 828 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-216ENST00000507116 VPS50Q96JG6 964 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-216ENST00000507116 HEY1Q9Y5J3 304 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-216ENST00000507116 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-216ENST00000507116 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-216ENST00000507116 MUSKO15146 869 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-216ENST00000507116 SP100P23497 879 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-216ENST00000507116 ANXA13P27216 316 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-216ENST00000507116 TKTP29401 623 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-216ENST00000507116 SERPINB8P50452 374 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-216ENST00000507116 UBASH3AP57075 661 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-216ENST00000507116 TBX4P57082 545 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-216ENST00000507116 DSTNP60981 165 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-216ENST00000507116 SKOR1P84550 965 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-216ENST00000507116 DEPDC1Q5TB30 811 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-216ENST00000507116 NAA35Q5VZE5 725 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-216ENST00000507116 FAM173BQ6P4H8 233 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-216ENST00000507116 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-216ENST00000507116 MAP7D3Q8IWC1 876 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-216ENST00000507116 LINS1Q8NG48 757 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-216ENST00000507116 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-216ENST00000507116 CDKL2Q92772 493 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-216ENST00000507116 HAUS1Q96CS2 278 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-216ENST00000507116 SH3GL2Q99962 352 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-216ENST00000507116 DCTPP1Q9H773 170 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-216ENST00000507116 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-216ENST00000507116 HDAC9Q9UKV0 1011 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-216ENST00000507116 EXOC7Q9UPT5 735 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-216ENST00000507116 NAIPQ13075 1403 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-216ENST00000507116 FYCO1Q9BQS8 1478 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-216ENST00000507116 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 A0A0J9YVX5 310 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 NPM3O75607 178 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 HSPA1LP34931 641 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 SLFN5Q08AF3 891 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 ARID5BQ14865 1188 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 PCSK7Q16549 785 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 WASHC4Q2M389 1173 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 ANKDD1AQ495B1 522 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 C6orf89Q6UWU4 347 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 STKLD1Q8NE28 680 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 GIMAP5Q96F15 307 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 PSMD14O00487 310 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 NMT2O60551 498 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 KPNA6O60684 536 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 BCAR3O75815 825 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 CYP2C9P11712 490 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 KRT4P19013 534 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 ETFBP38117 255 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 AP2B1P63010 937 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 LAPTM5Q13571 262 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 MTMR3Q13615 1198 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 SYDE2Q5VT97 1194 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 ZNF449Q6P9G9 518 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 TUBA3EQ6PEY2 450 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 TRIM65Q6PJ69 517 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 SLAIN1Q8ND83 568 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 B3GNT4Q9C0J1 378 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 PDP2Q9P2J9 529 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 STAP2Q9UGK3 403 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 RASAL2Q9UJF2 1139 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 SYNJ2O15056 1496 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 OPLAHO14841 1288 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 MAP3K13O43283 966 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 PYGMP11217 842 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 SEPT6Q14141 434 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 TNIP1Q15025 636 aa6.77□□□□□ -1.33
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