RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492741.5

PSPC1-204, Transcript of paraspeckle component 1, humanhuman

TSL 2

Gene PSPC1, Length 1,709 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPC1-204ENST00000492741 NSMFQ6X4W1 530 aa25.17■■□□□ 1.62
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PSPC1-204ENST00000492741 TEX2Q8IWB9 1127 aa25.17■■□□□ 1.62
PSPC1-204ENST00000492741 RASSF10A6NK89 507 aa25.16■■□□□ 1.62
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PSPC1-204ENST00000492741 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
PSPC1-204ENST00000492741 AP3B2Q13367 1082 aa25.16■■□□□ 1.62
PSPC1-204ENST00000492741 NCAPG2Q86XI2 1143 aa25.16■■□□□ 1.62
PSPC1-204ENST00000492741 IFNL1Q8IU54 200 aa25.16■■□□□ 1.62
PSPC1-204ENST00000492741 RIOX2Q8IUF8 465 aa25.16■■□□□ 1.62
PSPC1-204ENST00000492741 TBCKQ8TEA7 893 aa25.16■■□□□ 1.62
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PSPC1-204ENST00000492741 TRAPPC10P48553 1259 aa25.15■■□□□ 1.62
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PSPC1-204ENST00000492741 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
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PSPC1-204ENST00000492741 SREBF1P36956 1147 aa25.07■■□□□ 1.6
PSPC1-204ENST00000492741 USP11P51784 963 aa25.07■■□□□ 1.6
PSPC1-204ENST00000492741 FAM110CQ1W6H9 321 aa25.07■■□□□ 1.6
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