RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP18.25■□□□□ 0.51
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PRDX5P30044 214 aa18.25■□□□□ 0.51
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ABCB5Q2M3G0 1257 aa18.25■□□□□ 0.51
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GBP6Q6ZN66 633 aa18.25■□□□□ 0.51
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CXCR5P32302 372 aa18.23■□□□□ 0.51
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PDE11AQ9HCR9 933 aa18.23■□□□□ 0.51
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CYB5R4Q7L1T6 521 aa18.22■□□□□ 0.51
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CLIC2O15247 247 aa18.21■□□□□ 0.51
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KCTD16Q68DU8 428 aa18.21■□□□□ 0.51
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GDAQ9Y2T3 454 aa18.21■□□□□ 0.51
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NMT2O60551 498 aa18.2■□□□□ 0.5
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TTLL1O95922 423 aa18.2■□□□□ 0.5
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PLCG1P19174 1290 aa18.2■□□□□ 0.5
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 METTL13Q8N6R0 699 aa18.2■□□□□ 0.5
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FLAD1Q8NFF5 587 aa18.2■□□□□ 0.5
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SPTLC3Q9NUV7 552 aa18.2■□□□□ 0.5
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CCPG1Q9ULG6 757 aa18.2■□□□□ 0.5
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NEDD4P46934 1319 aa18.2■□□□□ 0.5
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LRCH2Q5VUJ6 765 aa18.2■□□□□ 0.5
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa18.2■□□□□ 0.5
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NLGN1Q8N2Q7 840 aa18.2■□□□□ 0.5
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLC44A5Q8NCS7 719 aa18.2■□□□□ 0.5
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NBPF26B4DH59 902 aa18.2■□□□□ 0.5
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GAS8O95995 478 aa18.2■□□□□ 0.5
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ALDH3A1P30838 453 aa18.2■□□□□ 0.5
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