RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429299.2

LTB-210, Transcript of lymphotoxin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LTB, Length 897 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTB-210ENST00000429299 TLL1O43897 1013 aa23.02■■□□□ 1.28
LTB-210ENST00000429299 CYP2C9P11712 490 aa23.02■■□□□ 1.28
LTB-210ENST00000429299 RFC2P35250 354 aa23.02■■□□□ 1.28
LTB-210ENST00000429299 PDE4BQ07343 736 aa23.02■■□□□ 1.28
LTB-210ENST00000429299 TMEM63BQ5T3F8 832 aa23.02■■□□□ 1.28
LTB-210ENST00000429299 DEFB128Q7Z7B8 93 aa23.02■■□□□ 1.28
LTB-210ENST00000429299 SLC9A7Q96T83 725 aa23.02■■□□□ 1.28
LTB-210ENST00000429299 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
LTB-210ENST00000429299 ECHDC1Q9NTX5 307 aa23.02■■□□□ 1.28
LTB-210ENST00000429299 TNKSO95271 1327 aa23.02■■□□□ 1.28
LTB-210ENST00000429299 PLIN4Q96Q06 1357 aa23.01■■□□□ 1.27
LTB-210ENST00000429299 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
LTB-210ENST00000429299 GPAA1O43292 621 aa23.01■■□□□ 1.27
LTB-210ENST00000429299 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
LTB-210ENST00000429299 MCCP23508 829 aa23.01■■□□□ 1.27
LTB-210ENST00000429299 TFAP4Q01664 338 aa23.01■■□□□ 1.27
LTB-210ENST00000429299 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa23.01■■□□□ 1.27
LTB-210ENST00000429299 CERS4Q9HA82 394 aa23.01■■□□□ 1.27
LTB-210ENST00000429299 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
LTB-210ENST00000429299 KIF28PB7ZC32 967 aa23■■□□□ 1.27
LTB-210ENST00000429299 CPT1AP50416 773 aa23■■□□□ 1.27
LTB-210ENST00000429299 MUM1L1Q5H9M0 696 aa23■■□□□ 1.27
LTB-210ENST00000429299 RCSD1Q6JBY9 416 aa23■■□□□ 1.27
LTB-210ENST00000429299 IFNL3Q8IZI9 196 aa23■■□□□ 1.27
LTB-210ENST00000429299 EXOC6Q8TAG9 804 aa23■■□□□ 1.27
LTB-210ENST00000429299 HLA-CQ95604 372 aa23■■□□□ 1.27
LTB-210ENST00000429299 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
LTB-210ENST00000429299 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa22.99■■□□□ 1.27
LTB-210ENST00000429299 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
LTB-210ENST00000429299 PURAQ00577 322 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
LTB-210ENST00000429299 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
LTB-210ENST00000429299 TMEM31Q5JXX7 168 aa22.99■■□□□ 1.27
LTB-210ENST00000429299 WDR11Q9BZH6 1224 aa22.99■■□□□ 1.27
LTB-210ENST00000429299 NACAP1Q9BZK3 213 aa22.99■■□□□ 1.27
LTB-210ENST00000429299 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
LTB-210ENST00000429299 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa22.99■■□□□ 1.27
LTB-210ENST00000429299 EPOPA6NHQ4 379 aa22.98■■□□□ 1.27
LTB-210ENST00000429299 PITPNM1O00562 1244 aa22.98■■□□□ 1.27
LTB-210ENST00000429299 TAP1Q03518 808 aa22.98■■□□□ 1.27
LTB-210ENST00000429299 NSMFQ6X4W1 530 aa22.98■■□□□ 1.27
LTB-210ENST00000429299 RETREG2Q8NC44 543 aa22.98■■□□□ 1.27
LTB-210ENST00000429299 ARNTL2Q8WYA1 636 aa22.98■■□□□ 1.27
LTB-210ENST00000429299 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
LTB-210ENST00000429299 PRR12Q9ULL5 1215 aa22.98■■□□□ 1.27
LTB-210ENST00000429299 BRWD1Q9NSI6 2320 aa22.97■■□□□ 1.27
LTB-210ENST00000429299 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
LTB-210ENST00000429299 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
LTB-210ENST00000429299 KRT40Q6A162 431 aa22.97■■□□□ 1.27
LTB-210ENST00000429299 KCTD1Q719H9 257 aa22.97■■□□□ 1.27
LTB-210ENST00000429299 HERC6Q8IVU3 1022 aa22.97■■□□□ 1.27
LTB-210ENST00000429299 CCPG1Q9ULG6 757 aa22.97■■□□□ 1.27
LTB-210ENST00000429299 MUC6Q6W4X9 2439 aa22.96■■□□□ 1.27
LTB-210ENST00000429299 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
LTB-210ENST00000429299 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
LTB-210ENST00000429299 GPR37L1O60883 481 aa22.96■■□□□ 1.27
LTB-210ENST00000429299 MYL3P08590 195 aa22.96■■□□□ 1.27
LTB-210ENST00000429299 IQCF3P0C7M6 154 aa22.96■■□□□ 1.27
LTB-210ENST00000429299 SNAP25P60880 206 aa22.96■■□□□ 1.27
LTB-210ENST00000429299 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
LTB-210ENST00000429299 NBPF20Q3BBV1 942 aa22.96■■□□□ 1.27
LTB-210ENST00000429299 NFRKBQ6P4R8 1299 aa22.96■■□□□ 1.27
LTB-210ENST00000429299 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
LTB-210ENST00000429299 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP22.96■■□□□ 1.27
LTB-210ENST00000429299 M0R2C6 588 aa22.95■■□□□ 1.26
LTB-210ENST00000429299 KPNA6O60684 536 aa22.95■■□□□ 1.26
LTB-210ENST00000429299 ICAM1P05362 532 aa22.95■■□□□ 1.26
LTB-210ENST00000429299 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
LTB-210ENST00000429299 FAM47CQ5HY64 1035 aa22.95■■□□□ 1.26
LTB-210ENST00000429299 CHMP4CQ96CF2 233 aa22.95■■□□□ 1.26
LTB-210ENST00000429299 GPATCH3Q96I76 525 aa22.95■■□□□ 1.26
LTB-210ENST00000429299 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
LTB-210ENST00000429299 DCTPP1Q9H773 170 aa22.95■■□□□ 1.26
LTB-210ENST00000429299 STX8Q9UNK0 236 aa22.95■■□□□ 1.26
LTB-210ENST00000429299 BAIAP3O94812 1187 aa22.94■■□□□ 1.26
LTB-210ENST00000429299 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
LTB-210ENST00000429299 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
LTB-210ENST00000429299 GRB10Q13322 594 aa22.94■■□□□ 1.26
LTB-210ENST00000429299 BFSP2Q13515 415 aa22.94■■□□□ 1.26
LTB-210ENST00000429299 OR6J1Q8NGC5 347 aa22.94■■□□□ 1.26
LTB-210ENST00000429299 LMCD1Q9NZU5 365 aa22.94■■□□□ 1.26
LTB-210ENST00000429299 LRRC37A2A6NM11 1700 aa22.94■■□□□ 1.26
LTB-210ENST00000429299 SCN5AQ14524 2016 aa22.93■■□□□ 1.26
LTB-210ENST00000429299 RAD50Q92878 1312 aa22.93■■□□□ 1.26
LTB-210ENST00000429299 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP22.93■■□□□ 1.26
LTB-210ENST00000429299 NEFLP07196 543 aa22.93■■□□□ 1.26
LTB-210ENST00000429299 PPARAQ07869 468 aa22.93■■□□□ 1.26
LTB-210ENST00000429299 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
LTB-210ENST00000429299 NAPBQ9H115 298 aa22.93■■□□□ 1.26
LTB-210ENST00000429299 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
LTB-210ENST00000429299 A6NJR5 290 aa22.92■■□□□ 1.26
LTB-210ENST00000429299 ARHGEF15O94989 841 aa22.92■■□□□ 1.26
LTB-210ENST00000429299 IL17RBQ9NRM6 502 aa22.92■■□□□ 1.26
LTB-210ENST00000429299 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa22.92■■□□□ 1.26
LTB-210ENST00000429299 TSPY2A6NKD2 308 aa22.91■■□□□ 1.26
LTB-210ENST00000429299 LPXNO60711 386 aa22.91■■□□□ 1.26
LTB-210ENST00000429299 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
LTB-210ENST00000429299 NOD1Q9Y239 953 aa22.91■■□□□ 1.26
LTB-210ENST00000429299 TET1Q8NFU7 2136 aa22.9■■□□□ 1.26
LTB-210ENST00000429299 PI4K2BG5E9Z4 385 aa22.9■■□□□ 1.26
LTB-210ENST00000429299 KCNJ6P48051 423 aa22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.7 ms