RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425753.6

TSTA3-201, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TSTA3, Length 1,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-201ENST00000425753 FAM133AQ8N9E0 248 aa23.47■■□□□ 1.35
TSTA3-201ENST00000425753 CCDC148Q8NFR7 591 aa23.47■■□□□ 1.35
TSTA3-201ENST00000425753 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
TSTA3-201ENST00000425753 COBLO75128 1261 aa23.46■■□□□ 1.35
TSTA3-201ENST00000425753 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
TSTA3-201ENST00000425753 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
TSTA3-201ENST00000425753 RGS2P41220 211 aa23.46■■□□□ 1.35
TSTA3-201ENST00000425753 FLT3LGP49771 235 aa23.46■■□□□ 1.35
TSTA3-201ENST00000425753 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
TSTA3-201ENST00000425753 ZNF792Q3KQV3 632 aa23.46■■□□□ 1.35
TSTA3-201ENST00000425753 SLC30A10Q6XR72 485 aa23.46■■□□□ 1.35
TSTA3-201ENST00000425753 TBC1D5Q92609 795 aa23.46■■□□□ 1.35
TSTA3-201ENST00000425753 DDX11Q96FC9 970 aa23.46■■□□□ 1.35
TSTA3-201ENST00000425753 AIFM3Q96NN9 605 aa23.46■■□□□ 1.35
TSTA3-201ENST00000425753 APBA2Q99767 749 aa23.46■■□□□ 1.35
TSTA3-201ENST00000425753 GLT8D2Q9H1C3 349 aa23.46■■□□□ 1.35
TSTA3-201ENST00000425753 RIC8AQ9NPQ8 531 aa23.46■■□□□ 1.35
TSTA3-201ENST00000425753 VPS54Q9P1Q0 977 aa23.46■■□□□ 1.35
TSTA3-201ENST00000425753 GABRQQ9UN88 632 aa23.46■■□□□ 1.35
TSTA3-201ENST00000425753 TRIM17Q9Y577 477 aa23.46■■□□□ 1.35
TSTA3-201ENST00000425753 MEIS2O14770 477 aa23.45■■□□□ 1.34
TSTA3-201ENST00000425753 DTNBO60941 627 aa23.45■■□□□ 1.34
TSTA3-201ENST00000425753 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
TSTA3-201ENST00000425753 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
TSTA3-201ENST00000425753 ALG1Q9BT22 464 aa23.45■■□□□ 1.34
TSTA3-201ENST00000425753 PSTPIP2Q9H939 334 aa23.45■■□□□ 1.34
TSTA3-201ENST00000425753 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa23.45■■□□□ 1.34
TSTA3-201ENST00000425753 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
TSTA3-201ENST00000425753 CFBP00751 764 aa23.44■■□□□ 1.34
TSTA3-201ENST00000425753 IGHA2P01877 340 aa23.44■■□□□ 1.34
TSTA3-201ENST00000425753 POLR2MP0CAP2 368 aa23.44■■□□□ 1.34
TSTA3-201ENST00000425753 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
TSTA3-201ENST00000425753 CUL5Q93034 780 aa23.44■■□□□ 1.34
TSTA3-201ENST00000425753 FGD4Q96M96 766 aa23.44■■□□□ 1.34
TSTA3-201ENST00000425753 SLC5A4Q9NY91 659 aa23.44■■□□□ 1.34
TSTA3-201ENST00000425753 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa23.43■■□□□ 1.34
TSTA3-201ENST00000425753 SMCO2A6NFE2 343 aa23.43■■□□□ 1.34
TSTA3-201ENST00000425753 POTEB2H3BUK9 544 aa23.43■■□□□ 1.34
TSTA3-201ENST00000425753 PGK2P07205 417 aa23.43■■□□□ 1.34
TSTA3-201ENST00000425753 XBP1P17861 261 aa23.43■■□□□ 1.34
TSTA3-201ENST00000425753 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
TSTA3-201ENST00000425753 GALNT17Q6IS24 598 aa23.43■■□□□ 1.34
TSTA3-201ENST00000425753 COL20A1Q9P218 1284 aa23.43■■□□□ 1.34
TSTA3-201ENST00000425753 DOCK3Q8IZD9 2030 aa23.43■■□□□ 1.34
TSTA3-201ENST00000425753 GNA11P29992 359 aa23.42■■□□□ 1.34
TSTA3-201ENST00000425753 CLK2P49760 499 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
TSTA3-201ENST00000425753 ADCY7P51828 1080 aa23.42■■□□□ 1.34
TSTA3-201ENST00000425753 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
TSTA3-201ENST00000425753 NPY5RQ15761 445 aa23.42■■□□□ 1.34
TSTA3-201ENST00000425753 DPP9Q86TI2 863 aa23.42■■□□□ 1.34
TSTA3-201ENST00000425753 DAGLBQ8NCG7 672 aa23.42■■□□□ 1.34
TSTA3-201ENST00000425753 DNERQ8NFT8 737 aa23.42■■□□□ 1.34
TSTA3-201ENST00000425753 NPLOC4Q8TAT6 608 aa23.42■■□□□ 1.34
TSTA3-201ENST00000425753 PHF20Q9BVI0 1012 aa23.42■■□□□ 1.34
TSTA3-201ENST00000425753 C6orf50Q9HD87 102 aa23.42■■□□□ 1.34
TSTA3-201ENST00000425753 PTPN22Q9Y2R2 807 aa23.42■■□□□ 1.34
TSTA3-201ENST00000425753 KIF3AQ9Y496 699 aa23.42■■□□□ 1.34
TSTA3-201ENST00000425753 ASTN1O14525 1302 aa23.42■■□□□ 1.34
TSTA3-201ENST00000425753 CALML3P27482 149 aa23.41■■□□□ 1.34
TSTA3-201ENST00000425753 CNTN2Q02246 1040 aa23.41■■□□□ 1.34
TSTA3-201ENST00000425753 OLFML2BQ68BL8 750 aa23.41■■□□□ 1.34
TSTA3-201ENST00000425753 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
TSTA3-201ENST00000425753 FAM184AQ8NB25 1140 aa23.41■■□□□ 1.34
TSTA3-201ENST00000425753 PXYLP1Q8TE99 480 aa23.41■■□□□ 1.34
TSTA3-201ENST00000425753 MAML3Q96JK9 1138 aa23.41■■□□□ 1.34
TSTA3-201ENST00000425753 SMC3Q9UQE7 1217 aa23.41■■□□□ 1.34
TSTA3-201ENST00000425753 FRMPD4Q14CM0 1322 aa23.41■■□□□ 1.34
TSTA3-201ENST00000425753 LCTP09848 1927 aa23.41■■□□□ 1.34
TSTA3-201ENST00000425753 SOWAHBA6NEL2 793 aa23.4■■□□□ 1.34
TSTA3-201ENST00000425753 CYP2B6P20813 491 aa23.4■■□□□ 1.34
TSTA3-201ENST00000425753 GJB2P29033 226 aa23.4■■□□□ 1.34
TSTA3-201ENST00000425753 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
TSTA3-201ENST00000425753 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
TSTA3-201ENST00000425753 USP17L6PQ6QN14 398 aa23.4■■□□□ 1.34
TSTA3-201ENST00000425753 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa23.4■■□□□ 1.34
TSTA3-201ENST00000425753 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
TSTA3-201ENST00000425753 BICD2Q8TD16 824 aa23.4■■□□□ 1.34
TSTA3-201ENST00000425753 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
TSTA3-201ENST00000425753 NLRP5P59047 1200 aa23.4■■□□□ 1.34
TSTA3-201ENST00000425753 AP3B2Q13367 1082 aa23.4■■□□□ 1.34
TSTA3-201ENST00000425753 GJB4Q9NTQ9 266 aa23.4■■□□□ 1.34
TSTA3-201ENST00000425753 PCDHA4Q9UN74 947 aa23.4■■□□□ 1.34
TSTA3-201ENST00000425753 RPTORQ8N122 1335 aa23.39■■□□□ 1.33
TSTA3-201ENST00000425753 M0R2N6 131 aa23.39■■□□□ 1.33
TSTA3-201ENST00000425753 EDNRBP24530 442 aa23.39■■□□□ 1.33
TSTA3-201ENST00000425753 BECN1Q14457 450 aa23.39■■□□□ 1.33
TSTA3-201ENST00000425753 MCTP2Q6DN12 878 aa23.39■■□□□ 1.33
TSTA3-201ENST00000425753 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa23.39■■□□□ 1.33
TSTA3-201ENST00000425753 RAET1EQ8TD07 263 aa23.39■■□□□ 1.33
TSTA3-201ENST00000425753 MORC4Q8TE76 937 aa23.39■■□□□ 1.33
TSTA3-201ENST00000425753 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
TSTA3-201ENST00000425753 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa23.39■■□□□ 1.33
TSTA3-201ENST00000425753 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa23.38■■□□□ 1.33
TSTA3-201ENST00000425753 FOSP01100 380 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
TSTA3-201ENST00000425753 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
TSTA3-201ENST00000425753 UBE2SQ16763 222 aa23.38■■□□□ 1.33
TSTA3-201ENST00000425753 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
TSTA3-201ENST00000425753 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
TSTA3-201ENST00000425753 SLAIN1Q8ND83 568 aa23.38■■□□□ 1.33
TSTA3-201ENST00000425753 TRIB2Q92519 343 aa23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.6 ms