RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421832.2

CTU1-201, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTU1, Length 2,087 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU1-201ENST00000421832 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP27.72■■■□□ 2.03
CTU1-201ENST00000421832 ATG4CQ96DT6 458 aa27.72■■■□□ 2.03
CTU1-201ENST00000421832 SLC10A4Q96EP9 437 aa27.72■■■□□ 2.03
CTU1-201ENST00000421832 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP27.72■■■□□ 2.03
CTU1-201ENST00000421832 POLR3EQ9NVU0 708 aa27.72■■■□□ 2.03
CTU1-201ENST00000421832 RCOR1Q9UKL0 485 aa27.72■■■□□ 2.03
CTU1-201ENST00000421832 KCNH4Q9UQ05 1017 aa27.72■■■□□ 2.03
CTU1-201ENST00000421832 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa27.72■■■□□ 2.03
CTU1-201ENST00000421832 OPLAHO14841 1288 aa27.72■■■□□ 2.03
CTU1-201ENST00000421832 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa27.72■■■□□ 2.03
CTU1-201ENST00000421832 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa27.72■■■□□ 2.03
CTU1-201ENST00000421832 FAM200AQ8TCP9 573 aa27.72■■■□□ 2.03
CTU1-201ENST00000421832 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP27.71■■■□□ 2.03
CTU1-201ENST00000421832 LINC00301Q8NCQ3 95 aa27.71■■■□□ 2.03
CTU1-201ENST00000421832 PGBD1Q96JS3 809 aa27.71■■■□□ 2.03
CTU1-201ENST00000421832 AGBL1Q96MI9 1066 aa27.71■■■□□ 2.03
CTU1-201ENST00000421832 PSTPIP2Q9H939 334 aa27.71■■■□□ 2.03
CTU1-201ENST00000421832 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa27.71■■■□□ 2.03
CTU1-201ENST00000421832 FKBP1BP68106 108 aa27.71■■■□□ 2.03
CTU1-201ENST00000421832 RILPL1Q5EBL4 403 aa27.71■■■□□ 2.03
CTU1-201ENST00000421832 GADL1Q6ZQY3 521 aa27.71■■■□□ 2.03
CTU1-201ENST00000421832 C2orf69Q8N8R5 385 aa27.71■■■□□ 2.03
CTU1-201ENST00000421832 ELP1O95163 1332 aa27.7■■■□□ 2.03
CTU1-201ENST00000421832 USP17L15C9J2P7 530 aa27.7■■■□□ 2.02
CTU1-201ENST00000421832 USP17L13C9JLJ4 530 aa27.7■■■□□ 2.02
CTU1-201ENST00000421832 USP17L11C9JVI0 530 aa27.7■■■□□ 2.02
CTU1-201ENST00000421832 USP17L18D6R9N7 530 aa27.7■■■□□ 2.02
CTU1-201ENST00000421832 USP17L22D6RA61 530 aa27.7■■■□□ 2.02
CTU1-201ENST00000421832 USP17L17D6RBQ6 530 aa27.7■■■□□ 2.02
CTU1-201ENST00000421832 USP17L19D6RCP7 530 aa27.7■■■□□ 2.02
CTU1-201ENST00000421832 USP17L20D6RJB6 530 aa27.7■■■□□ 2.02
CTU1-201ENST00000421832 CXCL11O14625 94 aa27.7■■■□□ 2.02
CTU1-201ENST00000421832 USP17L24Q0WX57 530 aa27.7■■■□□ 2.02
CTU1-201ENST00000421832 USP17L6PQ6QN14 398 aa27.7■■■□□ 2.02
CTU1-201ENST00000421832 CUL5Q93034 780 aa27.7■■■□□ 2.02
CTU1-201ENST00000421832 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa27.69■■■□□ 2.02
CTU1-201ENST00000421832 PLCB2Q00722 1185 aa27.69■■■□□ 2.02
CTU1-201ENST00000421832 SLC20A2Q08357 652 aa27.69■■■□□ 2.02
CTU1-201ENST00000421832 PTPAQ15257 358 aa27.69■■■□□ 2.02
CTU1-201ENST00000421832 KIF18AQ8NI77 898 aa27.69■■■□□ 2.02
CTU1-201ENST00000421832 VWA5AO00534 786 aa27.69■■■□□ 2.02
CTU1-201ENST00000421832 MOGSQ13724 837 aa27.69■■■□□ 2.02
CTU1-201ENST00000421832 TERF2Q15554 542 aa27.69■■■□□ 2.02
CTU1-201ENST00000421832 INF2Q27J81 1249 aa27.69■■■□□ 2.02
CTU1-201ENST00000421832 CPXCR1Q8N123 301 aa27.69■■■□□ 2.02
CTU1-201ENST00000421832 KRT222Q8N1A0 295 aa27.69■■■□□ 2.02
CTU1-201ENST00000421832 FAM53CQ9NYF3 392 aa27.69■■■□□ 2.02
CTU1-201ENST00000421832 KIF3CO14782 793 aa27.68■■■□□ 2.02
CTU1-201ENST00000421832 DSG3P32926 999 aa27.68■■■□□ 2.02
CTU1-201ENST00000421832 CLK2P49760 499 aaKnown RBP27.68■■■□□ 2.02
CTU1-201ENST00000421832 STK38Q15208 465 aa27.68■■■□□ 2.02
CTU1-201ENST00000421832 BICD2Q8TD16 824 aa27.68■■■□□ 2.02
CTU1-201ENST00000421832 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP27.68■■■□□ 2.02
CTU1-201ENST00000421832 ICAM1P05362 532 aa27.68■■■□□ 2.02
CTU1-201ENST00000421832 COG2Q14746 738 aa27.68■■■□□ 2.02
CTU1-201ENST00000421832 CCDC112Q8NEF3 446 aa27.68■■■□□ 2.02
CTU1-201ENST00000421832 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP27.68■■■□□ 2.02
CTU1-201ENST00000421832 MEIS2O14770 477 aa27.67■■■□□ 2.02
CTU1-201ENST00000421832 YEATS4O95619 227 aa27.67■■■□□ 2.02
CTU1-201ENST00000421832 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP27.67■■■□□ 2.02
CTU1-201ENST00000421832 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP27.67■■■□□ 2.02
CTU1-201ENST00000421832 SPC24Q8NBT2 197 aa27.67■■■□□ 2.02
CTU1-201ENST00000421832 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP27.67■■■□□ 2.02
CTU1-201ENST00000421832 TBC1D5Q92609 795 aa27.67■■■□□ 2.02
CTU1-201ENST00000421832 CCPG1Q9ULG6 757 aa27.67■■■□□ 2.02
CTU1-201ENST00000421832 UNCXA6NJT0 531 aa27.66■■■□□ 2.02
CTU1-201ENST00000421832 PTGS1P23219 599 aa27.66■■■□□ 2.02
CTU1-201ENST00000421832 SLC39A14Q15043 492 aa27.66■■■□□ 2.02
CTU1-201ENST00000421832 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa27.66■■■□□ 2.02
CTU1-201ENST00000421832 MRVI1Q9Y6F6 885 aa27.66■■■□□ 2.02
CTU1-201ENST00000421832 MYH7BA7E2Y1 1941 aa27.66■■■□□ 2.02
CTU1-201ENST00000421832 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP27.66■■■□□ 2.02
CTU1-201ENST00000421832 TNNT1P13805 278 aa27.66■■■□□ 2.02
CTU1-201ENST00000421832 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP27.66■■■□□ 2.02
CTU1-201ENST00000421832 KRT25Q7Z3Z0 450 aa27.66■■■□□ 2.02
CTU1-201ENST00000421832 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP27.66■■■□□ 2.02
CTU1-201ENST00000421832 REPS2Q8NFH8 660 aa27.66■■■□□ 2.02
CTU1-201ENST00000421832 SPTLC2O15270 562 aa27.65■■■□□ 2.02
CTU1-201ENST00000421832 ZNF174Q15697 407 aa27.65■■■□□ 2.02
CTU1-201ENST00000421832 TTC38Q5R3I4 469 aa27.65■■■□□ 2.02
CTU1-201ENST00000421832 POTEEQ6S8J3 1075 aa27.65■■■□□ 2.02
CTU1-201ENST00000421832 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP27.65■■■□□ 2.02
CTU1-201ENST00000421832 PCDHA7Q9UN72 937 aa27.64■■■□□ 2.02
CTU1-201ENST00000421832 ZBED4O75132 1171 aa27.64■■■□□ 2.01
CTU1-201ENST00000421832 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP27.64■■■□□ 2.01
CTU1-201ENST00000421832 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP27.64■■■□□ 2.01
CTU1-201ENST00000421832 TBCKQ8TEA7 893 aa27.64■■■□□ 2.01
CTU1-201ENST00000421832 PASKQ96RG2 1323 aa27.64■■■□□ 2.01
CTU1-201ENST00000421832 EDIL3O43854 480 aa27.63■■■□□ 2.01
CTU1-201ENST00000421832 PEX10O60683 326 aa27.63■■■□□ 2.01
CTU1-201ENST00000421832 ME1P48163 572 aa27.63■■■□□ 2.01
CTU1-201ENST00000421832 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP27.63■■■□□ 2.01
CTU1-201ENST00000421832 TRAPPC10P48553 1259 aa27.63■■■□□ 2.01
CTU1-201ENST00000421832 HUNKP57058 714 aa27.63■■■□□ 2.01
CTU1-201ENST00000421832 GPAT2Q6NUI2 795 aa27.63■■■□□ 2.01
CTU1-201ENST00000421832 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP27.63■■■□□ 2.01
CTU1-201ENST00000421832 ABCB11O95342 1321 aa27.62■■■□□ 2.01
CTU1-201ENST00000421832 ALAS1P13196 640 aa27.62■■■□□ 2.01
CTU1-201ENST00000421832 SNAPC2Q13487 334 aa27.62■■■□□ 2.01
CTU1-201ENST00000421832 TMEM132BQ14DG7 1078 aa27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.8 ms