RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400053.8

PTPRM-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRM, Length 5,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-202ENST00000400053 TEX11Q8IYF3 940 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 CARD10Q9BWT7 1032 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 THEGQ9P2T0 379 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 TSPOAP1O95153 1857 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 IQGAP1P46940 1657 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 TMEM94Q12767 1356 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 SOWAHDA6NJG2 315 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 CXCR5P32302 372 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 RASSF7Q02833 373 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 PPP2R5AQ15172 486 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 KRT25Q7Z3Z0 450 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 EPB41L5Q9HCM4 733 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 GNPATO15228 680 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 ADORA1P30542 326 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 STAT1P42224 750 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 INPP1P49441 399 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 CALCRLQ16602 461 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 CCDC93Q567U6 631 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 FAM47AQ5JRC9 791 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 FANCBQ8NB91 859 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 WHAMMQ8TF30 809 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 HAUS1Q96CS2 278 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 ARHGAP42A6NI28 874 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 OPHN1O60890 802 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 GCNT3O95395 438 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 PPP2R5DQ14738 602 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 CTAGE3PQ8IX95 158 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 EFCC1Q9HA90 598 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 SPC25Q9HBM1 224 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP9.7□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 IKBKBO14920 756 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 IGKV5-2P06315 115 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 PHBP35232 272 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 CCDC197Q8NCU1 140 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 GREM2Q9H772 168 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 TRPC6Q9Y210 931 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 MYCT1Q8N699 235 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 C8orf37Q96NL8 207 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 SLC39A2Q9NP94 309 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 MED23Q9ULK4 1368 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 NRXN1Q9ULB1 1477 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 CFAP61Q8NHU2 1237 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 POLR3EQ9NVU0 708 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 DNM3Q9UQ16 869 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 HEG1Q9ULI3 1381 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 LRRD1A4D1F6 860 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 H7C1W4 665 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 SMIM24O75264 130 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 H2AFZP0C0S5 128 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 PHKA1P46020 1223 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 APBA1Q02410 837 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 PTGDRQ13258 359 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 MCTP2Q6DN12 878 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 H2AFVQ71UI9 128 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 CCDC13Q8IYE1 715 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 PDLIM2Q96JY6 352 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 RIC8AQ9NPQ8 531 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 CARMIL3Q8ND23 1372 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 M0QZ92 97 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 RPN1P04843 607 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 TRAPPC3LQ5T215 181 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 ICE2Q659A1 982 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 LINC00301Q8NCQ3 95 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 LZTS2Q9BRK4 669 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 CD2APQ9Y5K6 639 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 WDR17Q8IZU2 1322 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 ESYT2A0FGR8 921 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 RPS8P62241 208 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 TFAP4Q01664 338 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 ADCY1Q08828 1119 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 C2orf54Q08AI8 447 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 MYOCDQ8IZQ8 938 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 CNBD1Q8NA66 436 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 ZDHHC9Q9Y397 364 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 CRB1P82279 1406 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 DLC1Q96QB1 1528 aa9.68□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.5 ms