RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000389993.7

PSME4-201, Transcript of proteasome activator subunit 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PSME4, Length 6,581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4-201ENST00000389993 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
PSME4-201ENST00000389993 PRR29P0C7W0 189 aa16.09■□□□□ 0.17
PSME4-201ENST00000389993 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
PSME4-201ENST00000389993 DCUN1D2Q6PH85 259 aa16.09■□□□□ 0.17
PSME4-201ENST00000389993 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa16.09■□□□□ 0.17
PSME4-201ENST00000389993 BSPRYQ5W0U4 402 aa16.09■□□□□ 0.17
PSME4-201ENST00000389993 LY9Q9HBG7 655 aa16.09■□□□□ 0.17
PSME4-201ENST00000389993 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
PSME4-201ENST00000389993 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
PSME4-201ENST00000389993 KIF28PB7ZC32 967 aa16.08■□□□□ 0.17
PSME4-201ENST00000389993 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.17
PSME4-201ENST00000389993 ABL1P00519 1130 aa16.08■□□□□ 0.17
PSME4-201ENST00000389993 CXCR5P32302 372 aa16.08■□□□□ 0.17
PSME4-201ENST00000389993 CCDC93Q567U6 631 aa16.08■□□□□ 0.17
PSME4-201ENST00000389993 ARMCX5Q6P1M9 558 aa16.08■□□□□ 0.17
PSME4-201ENST00000389993 GSG1L2A8MUP6 293 aa16.08■□□□□ 0.16
PSME4-201ENST00000389993 CUL4BQ13620 913 aa16.08■□□□□ 0.16
PSME4-201ENST00000389993 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
PSME4-201ENST00000389993 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
PSME4-201ENST00000389993 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
PSME4-201ENST00000389993 FOXN1O15353 648 aa16.08■□□□□ 0.16
PSME4-201ENST00000389993 TMEM47Q9BQJ4 181 aa16.08■□□□□ 0.16
PSME4-201ENST00000389993 PI4KBQ9UBF8 816 aa16.08■□□□□ 0.16
PSME4-201ENST00000389993 RASSF7Q02833 373 aa16.08■□□□□ 0.16
PSME4-201ENST00000389993 POMGNT1Q8WZA1 660 aa16.08■□□□□ 0.16
PSME4-201ENST00000389993 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa16.08■□□□□ 0.16
PSME4-201ENST00000389993 TRIM49BA6NDI0 452 aa16.08■□□□□ 0.16
PSME4-201ENST00000389993 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa16.08■□□□□ 0.16
PSME4-201ENST00000389993 STAT3P40763 770 aa16.07■□□□□ 0.16
PSME4-201ENST00000389993 KAZNQ674X7 775 aa16.07■□□□□ 0.16
PSME4-201ENST00000389993 OTUD6AQ7L8S5 288 aa16.07■□□□□ 0.16
PSME4-201ENST00000389993 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
PSME4-201ENST00000389993 GLT8D2Q9H1C3 349 aa16.07■□□□□ 0.16
PSME4-201ENST00000389993 SOWAHDA6NJG2 315 aa16.07■□□□□ 0.16
PSME4-201ENST00000389993 FAM26FQ5R3K3 315 aa16.07■□□□□ 0.16
PSME4-201ENST00000389993 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
PSME4-201ENST00000389993 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa16.07■□□□□ 0.16
PSME4-201ENST00000389993 PPP2R5CQ13362 524 aa16.07■□□□□ 0.16
PSME4-201ENST00000389993 ASPRV1Q53RT3 343 aa16.07■□□□□ 0.16
PSME4-201ENST00000389993 SCYL2Q6P3W7 929 aa16.07■□□□□ 0.16
PSME4-201ENST00000389993 SLFN12Q8IYM2 578 aa16.07■□□□□ 0.16
PSME4-201ENST00000389993 GDAQ9Y2T3 454 aa16.07■□□□□ 0.16
PSME4-201ENST00000389993 MTERF2Q49AM1 385 aa16.07■□□□□ 0.16
PSME4-201ENST00000389993 FAM205CA6NFA0 338 aa16.07■□□□□ 0.16
PSME4-201ENST00000389993 DAPK3O43293 454 aa16.07■□□□□ 0.16
PSME4-201ENST00000389993 KIF4AO95239 1232 aa16.07■□□□□ 0.16
PSME4-201ENST00000389993 DNM2P50570 870 aa16.07■□□□□ 0.16
PSME4-201ENST00000389993 VAV2P52735 878 aa16.07■□□□□ 0.16
PSME4-201ENST00000389993 COPB1P53618 953 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
PSME4-201ENST00000389993 HS1BP3Q53T59 392 aa16.07■□□□□ 0.16
PSME4-201ENST00000389993 PEX26Q7Z412 305 aa16.07■□□□□ 0.16
PSME4-201ENST00000389993 BANK1Q8NDB2 785 aa16.07■□□□□ 0.16
PSME4-201ENST00000389993 PKNOX2Q96KN3 472 aa16.07■□□□□ 0.16
PSME4-201ENST00000389993 SH2D3AQ9BRG2 576 aa16.07■□□□□ 0.16
PSME4-201ENST00000389993 KCNK3O14649 394 aa16.06■□□□□ 0.16
PSME4-201ENST00000389993 DCAF15Q66K64 600 aa16.06■□□□□ 0.16
PSME4-201ENST00000389993 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa16.06■□□□□ 0.16
PSME4-201ENST00000389993 ARHGAP6O43182 974 aa16.06■□□□□ 0.16
PSME4-201ENST00000389993 DDIT3P35638 169 aa16.06■□□□□ 0.16
PSME4-201ENST00000389993 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
PSME4-201ENST00000389993 CIAPIN1Q6FI81 312 aa16.06■□□□□ 0.16
PSME4-201ENST00000389993 TMTC1Q8IUR5 882 aa16.06■□□□□ 0.16
PSME4-201ENST00000389993 ACRBPQ8NEB7 543 aa16.06■□□□□ 0.16
PSME4-201ENST00000389993 PAGE5Q96GU1 130 aa16.06■□□□□ 0.16
PSME4-201ENST00000389993 LONP1P36776 959 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
PSME4-201ENST00000389993 IMPACTQ9P2X3 320 aa16.06■□□□□ 0.16
PSME4-201ENST00000389993 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
PSME4-201ENST00000389993 TNNC1P63316 161 aa16.06■□□□□ 0.16
PSME4-201ENST00000389993 DPP9Q86TI2 863 aa16.06■□□□□ 0.16
PSME4-201ENST00000389993 KIF2CQ99661 725 aa16.06■□□□□ 0.16
PSME4-201ENST00000389993 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa16.06■□□□□ 0.16
PSME4-201ENST00000389993 SWAP70Q9UH65 585 aa16.06■□□□□ 0.16
PSME4-201ENST00000389993 NCAPD2Q15021 1401 aa16.06■□□□□ 0.16
PSME4-201ENST00000389993 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa16.06■□□□□ 0.16
PSME4-201ENST00000389993 TRIM14Q14142 442 aa16.06■□□□□ 0.16
PSME4-201ENST00000389993 GNPTABQ3T906 1256 aa16.06■□□□□ 0.16
PSME4-201ENST00000389993 PRPHP41219 470 aa16.05■□□□□ 0.16
PSME4-201ENST00000389993 KANSL2Q9H9L4 492 aa16.05■□□□□ 0.16
PSME4-201ENST00000389993 POLR3EQ9NVU0 708 aa16.05■□□□□ 0.16
PSME4-201ENST00000389993 ZNF609O15014 1411 aa16.05■□□□□ 0.16
PSME4-201ENST00000389993 ASIC3Q9UHC3 531 aa16.05■□□□□ 0.16
PSME4-201ENST00000389993 TECPR2O15040 1411 aa16.05■□□□□ 0.16
PSME4-201ENST00000389993 SPATA1Q5VX52 437 aa16.05■□□□□ 0.16
PSME4-201ENST00000389993 TTBK2Q6IQ55 1244 aa16.05■□□□□ 0.16
PSME4-201ENST00000389993 FERMT1Q9BQL6 677 aa16.05■□□□□ 0.16
PSME4-201ENST00000389993 AKT3Q9Y243 479 aa16.05■□□□□ 0.16
PSME4-201ENST00000389993 NR2F2P24468 414 aa16.05■□□□□ 0.16
PSME4-201ENST00000389993 PDIA6Q15084 440 aa16.05■□□□□ 0.16
PSME4-201ENST00000389993 CFAP58Q5T655 872 aa16.05■□□□□ 0.16
PSME4-201ENST00000389993 CLEC4GQ6UXB4 293 aa16.05■□□□□ 0.16
PSME4-201ENST00000389993 MGARPQ8TDB4 240 aa16.05■□□□□ 0.16
PSME4-201ENST00000389993 COA1Q9GZY4 146 aa16.05■□□□□ 0.16
PSME4-201ENST00000389993 PPP6R2O75170 966 aa16.05■□□□□ 0.16
PSME4-201ENST00000389993 IFNAR1P17181 557 aa16.05■□□□□ 0.16
PSME4-201ENST00000389993 STAG1Q8WVM7 1258 aa16.05■□□□□ 0.16
PSME4-201ENST00000389993 NUP58Q9BVL2 599 aa16.05■□□□□ 0.16
PSME4-201ENST00000389993 ZDHHC9Q9Y397 364 aa16.05■□□□□ 0.16
PSME4-201ENST00000389993 ABCB11O95342 1321 aa16.05■□□□□ 0.16
PSME4-201ENST00000389993 PREX1Q8TCU6 1659 aa16.05■□□□□ 0.16
PSME4-201ENST00000389993 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.6 ms