RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000382998.8

CTIF-202, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTIF, Length 4,407 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-202ENST00000382998 STX6O43752 255 aa15.03■□□□□ -0
CTIF-202ENST00000382998 TRPA1O75762 1119 aa15.03■□□□□ -0
CTIF-202ENST00000382998 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
CTIF-202ENST00000382998 SMIM5Q71RC9 77 aa15.03■□□□□ -0
CTIF-202ENST00000382998 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
CTIF-202ENST00000382998 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
CTIF-202ENST00000382998 HGSO14964 777 aaPredicted RBP15.02■□□□□ -0
CTIF-202ENST00000382998 LCA5LO95447 670 aa15.02■□□□□ -0
CTIF-202ENST00000382998 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa15.02■□□□□ -0
CTIF-202ENST00000382998 LONP2Q86WA8 852 aa15.02■□□□□ -0
CTIF-202ENST00000382998 GPT2Q8TD30 523 aa15.02■□□□□ -0
CTIF-202ENST00000382998 FBXO41Q8TF61 875 aa15.02■□□□□ -0
CTIF-202ENST00000382998 AP3B1O00203 1094 aa15.02■□□□□ -0
CTIF-202ENST00000382998 MCF2LO15068 1137 aa15.02■□□□□ -0
CTIF-202ENST00000382998 CPA1P15085 419 aa15.02■□□□□ -0
CTIF-202ENST00000382998 GJB2P29033 226 aa15.02■□□□□ -0
CTIF-202ENST00000382998 RASA3Q14644 834 aa15.02■□□□□ -0
CTIF-202ENST00000382998 CASP8Q14790 479 aa15.02■□□□□ -0
CTIF-202ENST00000382998 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP15.02■□□□□ -0
CTIF-202ENST00000382998 CNKSR1Q969H4 720 aa15.02■□□□□ -0
CTIF-202ENST00000382998 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP15.02■□□□□ -0
CTIF-202ENST00000382998 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP15.02□□□□□ -0.011e-6■■■■■ 50.9
CTIF-202ENST00000382998 NOP14P78316 857 aaKnown RBP15.02□□□□□ -0.01
CTIF-202ENST00000382998 ZNF569Q5MCW4 686 aa15.02□□□□□ -0.01
CTIF-202ENST00000382998 SUCLG2Q96I99 432 aa15.02□□□□□ -0.01
CTIF-202ENST00000382998 CNPY2Q9Y2B0 182 aa15.02□□□□□ -0.01
CTIF-202ENST00000382998 PTPRUQ92729 1446 aa15.02□□□□□ -0.01
CTIF-202ENST00000382998 SERPINI2O75830 405 aa15.01□□□□□ -0.01
CTIF-202ENST00000382998 DPY19L2Q6NUT2 758 aa15.01□□□□□ -0.01
CTIF-202ENST00000382998 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP15.01□□□□□ -0.01
CTIF-202ENST00000382998 TEX9Q8N6V9 391 aa15.01□□□□□ -0.01
CTIF-202ENST00000382998 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
CTIF-202ENST00000382998 CCSER2Q9H7U1 834 aa15.01□□□□□ -0.01
CTIF-202ENST00000382998 SLC40A1Q9NP59 571 aa15.01□□□□□ -0.01
CTIF-202ENST00000382998 LZTFL1Q9NQ48 299 aa15.01□□□□□ -0.01
CTIF-202ENST00000382998 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa15.01□□□□□ -0.01
CTIF-202ENST00000382998 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
CTIF-202ENST00000382998 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
CTIF-202ENST00000382998 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa15.01□□□□□ -0.01
CTIF-202ENST00000382998 H0YC42 278 aa15.01□□□□□ -0.01
CTIF-202ENST00000382998 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
CTIF-202ENST00000382998 ME1P48163 572 aa15.01□□□□□ -0.01
CTIF-202ENST00000382998 VAV2P52735 878 aa15.01□□□□□ -0.01
CTIF-202ENST00000382998 SLC7A5Q01650 507 aa15.01□□□□□ -0.01
CTIF-202ENST00000382998 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
CTIF-202ENST00000382998 KRT32Q14532 448 aa15.01□□□□□ -0.01
CTIF-202ENST00000382998 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
CTIF-202ENST00000382998 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
CTIF-202ENST00000382998 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
CTIF-202ENST00000382998 CEP78Q5JTW2 689 aa15.01□□□□□ -0.01
CTIF-202ENST00000382998 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
CTIF-202ENST00000382998 FHOD1Q9Y613 1164 aa15.01□□□□□ -0.01
CTIF-202ENST00000382998 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa15.01□□□□□ -0.01
CTIF-202ENST00000382998 SERPINB3P29508 390 aa15.01□□□□□ -0.01
CTIF-202ENST00000382998 SERPINB4P48594 390 aa15.01□□□□□ -0.01
CTIF-202ENST00000382998 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
CTIF-202ENST00000382998 TMEM154Q6P9G4 183 aa15.01□□□□□ -0.01
CTIF-202ENST00000382998 VAT1LQ9HCJ6 419 aa15.01□□□□□ -0.01
CTIF-202ENST00000382998 ZNF180Q9UJW8 692 aa15.01□□□□□ -0.01
CTIF-202ENST00000382998 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
CTIF-202ENST00000382998 GOLGA8JA6NMD2 632 aa15□□□□□ -0.01
CTIF-202ENST00000382998 GOLGA8TH3BQL2 631 aa15□□□□□ -0.01
CTIF-202ENST00000382998 GOLGA8HP0CJ92 632 aa15□□□□□ -0.01
CTIF-202ENST00000382998 SEPT2Q15019 361 aa15□□□□□ -0.01
CTIF-202ENST00000382998 NME8Q8N427 588 aa15□□□□□ -0.01
CTIF-202ENST00000382998 SAMD3Q8N6K7 520 aa15□□□□□ -0.01
CTIF-202ENST00000382998 EPAS1Q99814 870 aa15□□□□□ -0.01
CTIF-202ENST00000382998 BRD8Q9H0E9 1235 aa15□□□□□ -0.01
CTIF-202ENST00000382998 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
CTIF-202ENST00000382998 MGEA5O60502 916 aa15□□□□□ -0.01
CTIF-202ENST00000382998 VSIG1Q86XK7 387 aa15□□□□□ -0.01
CTIF-202ENST00000382998 LRRC8AQ8IWT6 810 aa15□□□□□ -0.01
CTIF-202ENST00000382998 PTCH1Q13635 1447 aa15□□□□□ -0.01
CTIF-202ENST00000382998 DOK7Q18PE1 504 aa15□□□□□ -0.01
CTIF-202ENST00000382998 OMA1Q96E52 524 aa15□□□□□ -0.01
CTIF-202ENST00000382998 THEGQ9P2T0 379 aa15□□□□□ -0.01
CTIF-202ENST00000382998 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa15□□□□□ -0.01
CTIF-202ENST00000382998 NEURL1BA8MQ27 555 aa14.99□□□□□ -0.01
CTIF-202ENST00000382998 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
CTIF-202ENST00000382998 KLHL29Q96CT2 875 aa14.99□□□□□ -0.01
CTIF-202ENST00000382998 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
CTIF-202ENST00000382998 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa14.99□□□□□ -0.01
CTIF-202ENST00000382998 NRBP1Q9UHY1 535 aa14.99□□□□□ -0.01
CTIF-202ENST00000382998 BNIP1Q12981 228 aa14.99□□□□□ -0.01
CTIF-202ENST00000382998 TNIP2Q8NFZ5 429 aa14.99□□□□□ -0.01
CTIF-202ENST00000382998 USP44Q9H0E7 712 aa14.99□□□□□ -0.01
CTIF-202ENST00000382998 GIMAP4Q9NUV9 329 aa14.99□□□□□ -0.01
CTIF-202ENST00000382998 SH3GLB1Q9Y371 365 aa14.99□□□□□ -0.01
CTIF-202ENST00000382998 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
CTIF-202ENST00000382998 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa14.99□□□□□ -0.01
CTIF-202ENST00000382998 N4BP3O15049 544 aa14.99□□□□□ -0.01
CTIF-202ENST00000382998 CHGBP05060 677 aa14.99□□□□□ -0.01
CTIF-202ENST00000382998 ZNF76P36508 570 aa14.99□□□□□ -0.01
CTIF-202ENST00000382998 PDE4BQ07343 736 aa14.99□□□□□ -0.01
CTIF-202ENST00000382998 TUBB2AQ13885 445 aa14.99□□□□□ -0.01
CTIF-202ENST00000382998 STK38Q15208 465 aa14.99□□□□□ -0.01
CTIF-202ENST00000382998 C11orf91Q3C1V1 193 aa14.99□□□□□ -0.01
CTIF-202ENST00000382998 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
CTIF-202ENST00000382998 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa14.99□□□□□ -0.01
CTIF-202ENST00000382998 IQUBQ8NA54 791 aa14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms