RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233331.11

INO80B-201, Transcript of INO80 complex subunit B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene INO80B, Length 1,261 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80B-201ENST00000233331 ADCYAP1R1P41586 468 aa35.6■■■■□ 3.29
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INO80B-201ENST00000233331 VTA1Q9NP79 307 aa35.6■■■■□ 3.29
INO80B-201ENST00000233331 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP35.59■■■■□ 3.29
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INO80B-201ENST00000233331 RXRAP19793 462 aa35.59■■■■□ 3.29
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INO80B-201ENST00000233331 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa35.59■■■■□ 3.29
INO80B-201ENST00000233331 SLC12A7Q9Y666 1083 aa35.59■■■■□ 3.29
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INO80B-201ENST00000233331 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa35.58■■■■□ 3.29
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INO80B-201ENST00000233331 CALM2P0DP24 149 aa35.57■■■■□ 3.28
INO80B-201ENST00000233331 CALM3P0DP25 149 aa35.57■■■■□ 3.28
INO80B-201ENST00000233331 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP35.57■■■■□ 3.28
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INO80B-201ENST00000233331 LZTS2Q9BRK4 669 aa35.55■■■■□ 3.28
INO80B-201ENST00000233331 SPZ1Q9BXG8 430 aa35.55■■■■□ 3.28
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INO80B-201ENST00000233331 RTP1P59025 263 aa35.54■■■■□ 3.28
INO80B-201ENST00000233331 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP35.54■■■■□ 3.28
INO80B-201ENST00000233331 CHRDL2Q6WN34 429 aa35.54■■■■□ 3.28
INO80B-201ENST00000233331 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa35.54■■■■□ 3.28
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INO80B-201ENST00000233331 TAAR1Q96RJ0 339 aa35.54■■■■□ 3.28
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INO80B-201ENST00000233331 B4DLN1 442 aa35.53■■■■□ 3.28
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INO80B-201ENST00000233331 A0A1W2PQY0 241 aa35.52■■■■□ 3.28
INO80B-201ENST00000233331 TLK2Q86UE8 772 aa35.52■■■■□ 3.28
INO80B-201ENST00000233331 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP35.52■■■■□ 3.28
INO80B-201ENST00000233331 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP35.52■■■■□ 3.28
INO80B-201ENST00000233331 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa35.52■■■■□ 3.28
INO80B-201ENST00000233331 MOXD2PA6NHM9 499 aa35.51■■■■□ 3.28
INO80B-201ENST00000233331 SMARCA1P28370 1054 aa35.51■■■■□ 3.28
INO80B-201ENST00000233331 ACLYP53396 1101 aa35.51■■■■□ 3.28
INO80B-201ENST00000233331 KCNA10Q16322 511 aa35.51■■■■□ 3.28
INO80B-201ENST00000233331 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP35.51■■■■□ 3.28
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INO80B-201ENST00000233331 PTGS1P23219 599 aa35.5■■■■□ 3.27
INO80B-201ENST00000233331 HSD17B4P51659 736 aa35.5■■■■□ 3.27
INO80B-201ENST00000233331 GNASQ5JWF2 1037 aa35.5■■■■□ 3.27
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INO80B-201ENST00000233331 APOA5Q6Q788 366 aa35.5■■■■□ 3.27
INO80B-201ENST00000233331 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP35.5■■■■□ 3.27
INO80B-201ENST00000233331 FANCBQ8NB91 859 aa35.5■■■■□ 3.27
INO80B-201ENST00000233331 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP35.5■■■■□ 3.27
INO80B-201ENST00000233331 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP35.5■■■■□ 3.27
INO80B-201ENST00000233331 GHRHRQ02643 423 aa35.49■■■■□ 3.27
INO80B-201ENST00000233331 SNX17Q15036 470 aa35.49■■■■□ 3.27
INO80B-201ENST00000233331 TRIM60Q495X7 471 aa35.49■■■■□ 3.27
INO80B-201ENST00000233331 TMEM63BQ5T3F8 832 aa35.49■■■■□ 3.27
INO80B-201ENST00000233331 AP5M1Q9H0R1 490 aa35.49■■■■□ 3.27
INO80B-201ENST00000233331 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP35.48■■■■□ 3.27
INO80B-201ENST00000233331 FGD1P98174 961 aa35.48■■■■□ 3.27
INO80B-201ENST00000233331 BEX3Q00994 111 aa35.48■■■■□ 3.27
INO80B-201ENST00000233331 ARHGEF16Q5VV41 709 aa35.48■■■■□ 3.27
INO80B-201ENST00000233331 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa35.48■■■■□ 3.27
INO80B-201ENST00000233331 TMTC3Q6ZXV5 915 aa35.48■■■■□ 3.27
INO80B-201ENST00000233331 WDR11Q9BZH6 1224 aa35.48■■■■□ 3.27
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