RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233330.6

RTKN-201, Transcript of rhotekin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RTKN, Length 2,220 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKN-201ENST00000233330 PMS1P54277 932 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
RTKN-201ENST00000233330 ETF1P62495 437 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
RTKN-201ENST00000233330 SLFN13Q68D06 897 aa22.13■■□□□ 1.13
RTKN-201ENST00000233330 SUPT20HQ8NEM7 779 aa22.13■■□□□ 1.13
RTKN-201ENST00000233330 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa22.13■■□□□ 1.13
RTKN-201ENST00000233330 ANKRD7Q92527 254 aa22.13■■□□□ 1.13
RTKN-201ENST00000233330 PSTPIP2Q9H939 334 aa22.13■■□□□ 1.13
RTKN-201ENST00000233330 PSMA7O14818 248 aa22.12■■□□□ 1.13
RTKN-201ENST00000233330 ICA1Q05084 483 aa22.12■■□□□ 1.13
RTKN-201ENST00000233330 GRB10Q13322 594 aa22.12■■□□□ 1.13
RTKN-201ENST00000233330 IRF2BP1Q8IU81 584 aa22.12■■□□□ 1.13
RTKN-201ENST00000233330 CAMKK2Q96RR4 588 aa22.12■■□□□ 1.13
RTKN-201ENST00000233330 STK32BQ9NY57 414 aa22.12■■□□□ 1.13
RTKN-201ENST00000233330 PPIP5K2O43314 1243 aa22.12■■□□□ 1.13
RTKN-201ENST00000233330 RAD21O60216 631 aa22.12■■□□□ 1.13
RTKN-201ENST00000233330 ENTPD3O75355 529 aa22.12■■□□□ 1.13
RTKN-201ENST00000233330 AMPD3Q01432 767 aa22.12■■□□□ 1.13
RTKN-201ENST00000233330 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
RTKN-201ENST00000233330 PDIA5Q14554 519 aa22.12■■□□□ 1.13
RTKN-201ENST00000233330 QRICH1Q2TAL8 776 aa22.12■■□□□ 1.13
RTKN-201ENST00000233330 TRIM65Q6PJ69 517 aa22.12■■□□□ 1.13
RTKN-201ENST00000233330 RAB34Q9BZG1 259 aa22.12■■□□□ 1.13
RTKN-201ENST00000233330 VPS16Q9H269 839 aa22.12■■□□□ 1.13
RTKN-201ENST00000233330 TAB2Q9NYJ8 693 aa22.12■■□□□ 1.13
RTKN-201ENST00000233330 MFAP3LO75121 409 aa22.11■■□□□ 1.13
RTKN-201ENST00000233330 ASIC1P78348 528 aa22.11■■□□□ 1.13
RTKN-201ENST00000233330 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
RTKN-201ENST00000233330 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa22.11■■□□□ 1.13
RTKN-201ENST00000233330 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
RTKN-201ENST00000233330 PNMA5Q96PV4 448 aa22.11■■□□□ 1.13
RTKN-201ENST00000233330 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
RTKN-201ENST00000233330 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
RTKN-201ENST00000233330 POTEMA6NI47 508 aa22.11■■□□□ 1.13
RTKN-201ENST00000233330 GDF11O95390 407 aa22.11■■□□□ 1.13
RTKN-201ENST00000233330 GYPCP04921 128 aa22.11■■□□□ 1.13
RTKN-201ENST00000233330 PDE4DQ08499 809 aa22.11■■□□□ 1.13
RTKN-201ENST00000233330 ABCB5Q2M3G0 1257 aa22.11■■□□□ 1.13
RTKN-201ENST00000233330 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
RTKN-201ENST00000233330 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
RTKN-201ENST00000233330 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa22.11■■□□□ 1.13
RTKN-201ENST00000233330 EXOC1Q9NV70 894 aa22.11■■□□□ 1.13
RTKN-201ENST00000233330 STK17AQ9UEE5 414 aa22.11■■□□□ 1.13
RTKN-201ENST00000233330 C21orf2O43822 256 aa22.1■■□□□ 1.13
RTKN-201ENST00000233330 TTI2Q6NXR4 508 aa22.1■■□□□ 1.13
RTKN-201ENST00000233330 CPLX3Q8WVH0 158 aa22.1■■□□□ 1.13
RTKN-201ENST00000233330 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
RTKN-201ENST00000233330 L2HGDHQ9H9P8 463 aa22.1■■□□□ 1.13
RTKN-201ENST00000233330 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
RTKN-201ENST00000233330 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa22.1■■□□□ 1.13
RTKN-201ENST00000233330 CASP14P31944 242 aa22.1■■□□□ 1.13
RTKN-201ENST00000233330 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
RTKN-201ENST00000233330 GLT8D2Q9H1C3 349 aa22.1■■□□□ 1.13
RTKN-201ENST00000233330 THAP9Q9H5L6 903 aa22.1■■□□□ 1.13
RTKN-201ENST00000233330 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP22.1■■□□□ 1.132e-6■■■■□ 21.3
RTKN-201ENST00000233330 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa22.09■■□□□ 1.13
RTKN-201ENST00000233330 F5H6K3 240 aa22.09■■□□□ 1.13
RTKN-201ENST00000233330 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
RTKN-201ENST00000233330 KLRC3Q07444 240 aa22.09■■□□□ 1.13
RTKN-201ENST00000233330 STK4Q13043 487 aa22.09■■□□□ 1.13
RTKN-201ENST00000233330 SV2BQ7L1I2 683 aa22.09■■□□□ 1.13
RTKN-201ENST00000233330 CNGA4Q8IV77 575 aa22.09■■□□□ 1.13
RTKN-201ENST00000233330 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa22.09■■□□□ 1.13
RTKN-201ENST00000233330 TRIM47Q96LD4 638 aa22.09■■□□□ 1.13
RTKN-201ENST00000233330 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
RTKN-201ENST00000233330 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
RTKN-201ENST00000233330 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa22.09■■□□□ 1.13
RTKN-201ENST00000233330 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
RTKN-201ENST00000233330 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP22.08■■□□□ 1.13
RTKN-201ENST00000233330 CREBRFQ8IUR6 639 aa22.08■■□□□ 1.13
RTKN-201ENST00000233330 HAS1Q92839 578 aa22.08■■□□□ 1.13
RTKN-201ENST00000233330 CCDC51Q96ER9 411 aa22.08■■□□□ 1.13
RTKN-201ENST00000233330 DNAI1Q9UI46 699 aa22.08■■□□□ 1.13
RTKN-201ENST00000233330 SNX29Q8TEQ0 813 aa22.08■■□□□ 1.13
RTKN-201ENST00000233330 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
RTKN-201ENST00000233330 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa22.08■■□□□ 1.13
RTKN-201ENST00000233330 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
RTKN-201ENST00000233330 SOWAHDA6NJG2 315 aa22.07■■□□□ 1.12
RTKN-201ENST00000233330 USP17L15C9J2P7 530 aa22.07■■□□□ 1.12
RTKN-201ENST00000233330 USP17L13C9JLJ4 530 aa22.07■■□□□ 1.12
RTKN-201ENST00000233330 USP17L11C9JVI0 530 aa22.07■■□□□ 1.12
RTKN-201ENST00000233330 USP17L18D6R9N7 530 aa22.07■■□□□ 1.12
RTKN-201ENST00000233330 USP17L22D6RA61 530 aa22.07■■□□□ 1.12
RTKN-201ENST00000233330 USP17L17D6RBQ6 530 aa22.07■■□□□ 1.12
RTKN-201ENST00000233330 USP17L19D6RCP7 530 aa22.07■■□□□ 1.12
RTKN-201ENST00000233330 USP17L20D6RJB6 530 aa22.07■■□□□ 1.12
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RTKN-201ENST00000233330 JAG1P78504 1218 aa22.07■■□□□ 1.12
RTKN-201ENST00000233330 USP17L24Q0WX57 530 aa22.07■■□□□ 1.12
RTKN-201ENST00000233330 MCM6Q14566 821 aa22.07■■□□□ 1.12
RTKN-201ENST00000233330 MTF1Q14872 753 aa22.07■■□□□ 1.12
RTKN-201ENST00000233330 COBLL1Q53SF7 1204 aa22.07■■□□□ 1.12
RTKN-201ENST00000233330 KRT79Q5XKE5 535 aa22.07■■□□□ 1.12
RTKN-201ENST00000233330 USP17L6PQ6QN14 398 aa22.07■■□□□ 1.12
RTKN-201ENST00000233330 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
RTKN-201ENST00000233330 GMCL1Q96IK5 515 aa22.07■■□□□ 1.12
RTKN-201ENST00000233330 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
RTKN-201ENST00000233330 NUDT12Q9BQG2 462 aa22.07■■□□□ 1.12
RTKN-201ENST00000233330 NDUFB10O96000 172 aa22.07■■□□□ 1.12
RTKN-201ENST00000233330 TPM1P09493 284 aa22.07■■□□□ 1.12
RTKN-201ENST00000233330 FCER1AP12319 257 aa22.07■■□□□ 1.12
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