RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000075430.11

CTDP1-201, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 3,538 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-201ENST00000075430 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
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CTDP1-201ENST00000075430 MYH15Q9Y2K3 1946 aa18.59■□□□□ 0.57
CTDP1-201ENST00000075430 TFAP4Q01664 338 aa18.59■□□□□ 0.57
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CTDP1-201ENST00000075430 NAA35Q5VZE5 725 aa18.59■□□□□ 0.57
CTDP1-201ENST00000075430 IQCEQ6IPM2 695 aa18.59■□□□□ 0.57
CTDP1-201ENST00000075430 TMTC3Q6ZXV5 915 aa18.59■□□□□ 0.57
CTDP1-201ENST00000075430 VGLL2Q8N8G2 317 aa18.59■□□□□ 0.57
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CTDP1-201ENST00000075430 RTL9Q8NET4 1388 aa18.58■□□□□ 0.57
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CTDP1-201ENST00000075430 NWD2Q9ULI1 1742 aa18.58■□□□□ 0.56
CTDP1-201ENST00000075430 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
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CTDP1-201ENST00000075430 AP1M1Q9BXS5 423 aa18.57■□□□□ 0.56
CTDP1-201ENST00000075430 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa18.57■□□□□ 0.56
CTDP1-201ENST00000075430 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
CTDP1-201ENST00000075430 SNX12Q9UMY4 172 aa18.57■□□□□ 0.56
CTDP1-201ENST00000075430 RAPGEF1Q13905 1077 aa18.57■□□□□ 0.56
CTDP1-201ENST00000075430 CREG2Q8IUH2 290 aa18.57■□□□□ 0.56
CTDP1-201ENST00000075430 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
CTDP1-201ENST00000075430 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP18.57■□□□□ 0.56
CTDP1-201ENST00000075430 KLRK1P26718 216 aa18.57■□□□□ 0.56
CTDP1-201ENST00000075430 MAP2K2P36507 400 aa18.57■□□□□ 0.56
CTDP1-201ENST00000075430 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
CTDP1-201ENST00000075430 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
CTDP1-201ENST00000075430 MCTP2Q6DN12 878 aa18.57■□□□□ 0.56
CTDP1-201ENST00000075430 ITIH6Q6UXX5 1313 aa18.57■□□□□ 0.56
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CTDP1-201ENST00000075430 GNAT2P19087 354 aa18.56■□□□□ 0.56
CTDP1-201ENST00000075430 PRDX5P30044 214 aa18.56■□□□□ 0.56
CTDP1-201ENST00000075430 ZBED6P86452 979 aa18.56■□□□□ 0.56
CTDP1-201ENST00000075430 ALX1Q15699 326 aa18.56■□□□□ 0.56
CTDP1-201ENST00000075430 NPY5RQ15761 445 aa18.56■□□□□ 0.56
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CTDP1-201ENST00000075430 LRRC15Q8TF66 581 aa18.56■□□□□ 0.56
CTDP1-201ENST00000075430 HYOU1Q9Y4L1 999 aa18.56■□□□□ 0.56
CTDP1-201ENST00000075430 MYH13Q9UKX3 1938 aa18.56■□□□□ 0.56
CTDP1-201ENST00000075430 NAPAP54920 295 aa18.56■□□□□ 0.56
CTDP1-201ENST00000075430 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
CTDP1-201ENST00000075430 MTMR8Q96EF0 704 aa18.56■□□□□ 0.56
CTDP1-201ENST00000075430 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
CTDP1-201ENST00000075430 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa18.55■□□□□ 0.56
CTDP1-201ENST00000075430 SEMA3EO15041 775 aa18.55■□□□□ 0.56
CTDP1-201ENST00000075430 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP18.55■□□□□ 0.56
CTDP1-201ENST00000075430 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP18.55■□□□□ 0.56
CTDP1-201ENST00000075430 ITPK1Q13572 414 aa18.55■□□□□ 0.56
CTDP1-201ENST00000075430 TRIM58Q8NG06 486 aa18.55■□□□□ 0.56
CTDP1-201ENST00000075430 PLA2G12BQ9BX93 195 aa18.55■□□□□ 0.56
CTDP1-201ENST00000075430 CCDC114Q96M63 670 aa18.55■□□□□ 0.56
CTDP1-201ENST00000075430 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP18.55■□□□□ 0.56
CTDP1-201ENST00000075430 GOPCQ9HD26 462 aa18.55■□□□□ 0.56
CTDP1-201ENST00000075430 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa18.55■□□□□ 0.56
CTDP1-201ENST00000075430 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP18.55■□□□□ 0.56
CTDP1-201ENST00000075430 LRRC10BA6NIK2 292 aa18.54■□□□□ 0.56
CTDP1-201ENST00000075430 RPSAP08865 295 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
CTDP1-201ENST00000075430 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
CTDP1-201ENST00000075430 DNAJC7Q99615 494 aa18.54■□□□□ 0.56
CTDP1-201ENST00000075430 CCDC113Q9H0I3 377 aa18.54■□□□□ 0.56
CTDP1-201ENST00000075430 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa18.54■□□□□ 0.56
CTDP1-201ENST00000075430 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
CTDP1-201ENST00000075430 TRAF5O00463 557 aa18.54■□□□□ 0.56
CTDP1-201ENST00000075430 EPS15P42566 896 aa18.54■□□□□ 0.56
CTDP1-201ENST00000075430 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP18.54■□□□□ 0.56
CTDP1-201ENST00000075430 GOLGA6L10A6NI86 522 aa18.54■□□□□ 0.56
CTDP1-201ENST00000075430 RASSF10A6NK89 507 aa18.54■□□□□ 0.56
CTDP1-201ENST00000075430 TUBB4BP68371 445 aa18.54■□□□□ 0.56
CTDP1-201ENST00000075430 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
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