RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000218686.1

Trappc6b-207, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

TSL 3 BASIC

Gene Trappc6b, Length 785 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Irgm2A0A140LIF8 407 aa25.15■■□□□ 1.62
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Zscan18E9PUD6 809 aa25.15■■□□□ 1.62
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ftl1P29391 183 aa25.15■■□□□ 1.62
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Anapc15P60007 132 aa25.15■■□□□ 1.62
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Stxbp3Q60770 592 aa25.15■■□□□ 1.62
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Adgrg6Q6F3F9 1165 aa25.15■■□□□ 1.62
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ccdc85bQ6PDY0 202 aa25.15■■□□□ 1.62
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Sgsm2Q80U12 1005 aa25.15■■□□□ 1.62
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Map3k11Q80XI6 850 aa25.15■■□□□ 1.62
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Snx29Q9D3S3 818 aa25.15■■□□□ 1.62
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 DgkkE9Q7N4 1118 aa25.14■■□□□ 1.62
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ptpn12P35831 775 aa25.14■■□□□ 1.62
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Pald1P70261 859 aa25.14■■□□□ 1.62
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Wnt8aQ64527 354 aa25.14■■□□□ 1.62
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Zhx2Q8C0C0 836 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 MyripQ8K3I4 856 aa25.14■■□□□ 1.62
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Xpo5Q924C1 1204 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Odf2lQ9D478 642 aa25.14■■□□□ 1.62
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Clip2Q9Z0H8 1047 aa25.14■■□□□ 1.62
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Cdc42ep5Q9Z0X0 150 aa25.14■■□□□ 1.62
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ulk4Q3V129 1303 aa25.13■■□□□ 1.61
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Map4k1P70218 827 aa25.13■■□□□ 1.61
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Tekt3Q6X6Z7 490 aa25.13■■□□□ 1.61
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ccdc158Q8CDI6 1109 aa25.13■■□□□ 1.61
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Gmcl1Q920G9 524 aa25.13■■□□□ 1.61
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 MutyhQ99P21 515 aa25.13■■□□□ 1.61
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Htatip2Q9Z2G9 242 aa25.13■■□□□ 1.61
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Kcnb2A6H8H5 907 aa25.12■■□□□ 1.61
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Gm20425E9Q035 978 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Lipo1J3QME6 396 aa25.12■■□□□ 1.61
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Bmp1P98063 991 aa25.12■■□□□ 1.61
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Eepd1Q3TGW2 569 aa25.12■■□□□ 1.61
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Tcaf3Q6QR59 914 aa25.12■■□□□ 1.61
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Pip5kl1Q6U7H8 395 aa25.12■■□□□ 1.61
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Tmc8Q7TN58 722 aa25.12■■□□□ 1.61
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Fbxo46Q8BG80 603 aa25.12■■□□□ 1.61
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 NkrfQ8BY02 690 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Sil1Q9EPK6 465 aa25.12■■□□□ 1.61
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Gfra4Q9JJT2 260 aa25.12■■□□□ 1.61
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Jakmip2D3YXK0 820 aa25.11■■□□□ 1.61
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Snap25P60879 206 aa25.11■■□□□ 1.61
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Sap30bpQ02614 308 aa25.11■■□□□ 1.61
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Etaa1Q5SVT3 877 aa25.11■■□□□ 1.61
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Vps72Q62481 368 aa25.11■■□□□ 1.61
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ipo8Q7TMY7 1010 aa25.11■■□□□ 1.61
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Vgll2Q8BGW8 322 aa25.11■■□□□ 1.61
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 DlatQ8BMF4 642 aa25.11■■□□□ 1.61
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Psma5Q9Z2U1 241 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Cbfa2t2O70374 594 aa25.1■■□□□ 1.61
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Sox9Q04887 507 aa25.1■■□□□ 1.61
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Znf618Q80YY7 953 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Aldh5a1Q8BWF0 523 aa25.1■■□□□ 1.61
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Robo3Q9Z2I4 1366 aa25.09■■□□□ 1.61
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Gm29094F6Q785 221 aa25.09■■□□□ 1.61
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 GaaP70699 953 aa25.09■■□□□ 1.61
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Kctd1Q5M956 257 aa25.09■■□□□ 1.61
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ca12Q8CI85 354 aa25.09■■□□□ 1.61
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Zcchc18Q8VD24 393 aa25.09■■□□□ 1.61
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Gpr108Q91WD0 569 aa25.09■■□□□ 1.61
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ttc9bQ9D6E4 239 aa25.09■■□□□ 1.61
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Trmt112Q9DCG9 125 aa25.09■■□□□ 1.61
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Foxe3Q9QY14 288 aa25.09■■□□□ 1.61
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Lrrc37aB1AWG4 3215 aa25.09■■□□□ 1.61
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Sbf2E9PXF8 1872 aa25.09■■□□□ 1.61
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Cyp2d34L7N463 504 aa25.08■■□□□ 1.61
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 March9Q3TZ87 348 aa25.08■■□□□ 1.61
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Trappc3lQ4KL14 181 aa25.08■■□□□ 1.61
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ccdc125Q5U465 500 aa25.08■■□□□ 1.61
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Gm21985Q6P6P5 1106 aa25.08■■□□□ 1.61
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Arhgef6Q8K4I3 771 aa25.08■■□□□ 1.61
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Prrg2Q8R182 198 aa25.08■■□□□ 1.61
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Adcy3Q8VHH7 1145 aa25.08■■□□□ 1.61
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Cntnap2Q9CPW0 1332 aa25.08■■□□□ 1.6
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 TriobpQ99KW3 2014 aa25.07■■□□□ 1.6
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 AW822073A0A0N4SUK1 652 aa25.07■■□□□ 1.6
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Man1b1A2AJ15 658 aa25.07■■□□□ 1.6
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Zkscan16A2ALW2 728 aa25.07■■□□□ 1.6
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Gm15448F6PZL4 682 aa25.07■■□□□ 1.6
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Nmt2O70311 529 aa25.07■■□□□ 1.6
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Alppl2P24823 529 aa25.07■■□□□ 1.6
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 PfkmP47857 780 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Calhm6Q8C9E8 313 aa25.07■■□□□ 1.6
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Paf1Q8K2T8 535 aa25.07■■□□□ 1.6
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Axin1O35625 863 aa25.06■■□□□ 1.6
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Exosc10P56960 887 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Fbxo10Q7TQF2 950 aa25.06■■□□□ 1.6
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Zbed4Q80WQ9 1168 aa25.06■■□□□ 1.6
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 BC048507Q80ZS7 89 aa25.06■■□□□ 1.6
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Pus7lQ8CE46 702 aa25.06■■□□□ 1.6
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Arhgef25Q9CWR0 618 aa25.06■■□□□ 1.6
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Acox2Q9QXD1 681 aa25.06■■□□□ 1.6
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Lnx1O70263 728 aa25.05■■□□□ 1.6
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Acvr2bP27040 536 aa25.05■■□□□ 1.6
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Bmp8aP34821 399 aa25.05■■□□□ 1.6
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 PuraP42669 321 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Sec23aQ01405 765 aa25.05■■□□□ 1.6
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Prdm1Q60636 856 aa25.05■■□□□ 1.6
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Brd2Q7JJ13 798 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Mrps27Q8BK72 415 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Cep55Q8BT07 462 aa25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 52.7 ms