RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618722.4

GGTLC2-205, Transcript of gamma-glutamyltransferase light chain 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GGTLC2, Length 1,047 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTLC2-205ENST00000618722 ABCB11O95342 1321 aa23.32■■□□□ 1.32
GGTLC2-205ENST00000618722 MYCP01106 439 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
GGTLC2-205ENST00000618722 ZNF792Q3KQV3 632 aa23.31■■□□□ 1.32
GGTLC2-205ENST00000618722 MUM1L1Q5H9M0 696 aa23.31■■□□□ 1.32
GGTLC2-205ENST00000618722 HOMER1Q86YM7 354 aa23.31■■□□□ 1.32
GGTLC2-205ENST00000618722 MAML3Q96JK9 1138 aa23.31■■□□□ 1.32
GGTLC2-205ENST00000618722 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
GGTLC2-205ENST00000618722 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa23.3■■□□□ 1.32
GGTLC2-205ENST00000618722 GOLGA8AA7E2F4 631 aa23.3■■□□□ 1.32
GGTLC2-205ENST00000618722 GOLGA8BA8MQT2 603 aa23.3■■□□□ 1.32
GGTLC2-205ENST00000618722 CAPN15O75808 1086 aa23.3■■□□□ 1.32
GGTLC2-205ENST00000618722 CCL5P13501 91 aa23.3■■□□□ 1.32
GGTLC2-205ENST00000618722 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
GGTLC2-205ENST00000618722 APOBRQ0VD83 1088 aa23.3■■□□□ 1.32
GGTLC2-205ENST00000618722 PPP2R5BQ15173 497 aa23.3■■□□□ 1.32
GGTLC2-205ENST00000618722 RTN1Q16799 776 aa23.3■■□□□ 1.32
GGTLC2-205ENST00000618722 IFFO2Q5TF58 517 aa23.3■■□□□ 1.32
GGTLC2-205ENST00000618722 NSMFQ6X4W1 530 aa23.3■■□□□ 1.32
GGTLC2-205ENST00000618722 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
GGTLC2-205ENST00000618722 PIGSQ96S52 555 aa23.3■■□□□ 1.32
GGTLC2-205ENST00000618722 PDRG1Q9NUG6 133 aa23.3■■□□□ 1.32
GGTLC2-205ENST00000618722 FLRT1Q9NZU1 646 aa23.3■■□□□ 1.32
GGTLC2-205ENST00000618722 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
GGTLC2-205ENST00000618722 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
GGTLC2-205ENST00000618722 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa23.29■■□□□ 1.32
GGTLC2-205ENST00000618722 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa23.29■■□□□ 1.32
GGTLC2-205ENST00000618722 POTEB2H3BUK9 544 aa23.29■■□□□ 1.32
GGTLC2-205ENST00000618722 CYTH3O43739 400 aa23.29■■□□□ 1.32
GGTLC2-205ENST00000618722 PLEKHA8P1O95397 391 aa23.29■■□□□ 1.32
GGTLC2-205ENST00000618722 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
GGTLC2-205ENST00000618722 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP23.29■■□□□ 1.32
GGTLC2-205ENST00000618722 MTFR1Q15390 333 aa23.29■■□□□ 1.32
GGTLC2-205ENST00000618722 TMTC3Q6ZXV5 915 aa23.29■■□□□ 1.32
GGTLC2-205ENST00000618722 IL17RAQ96F46 866 aa23.29■■□□□ 1.32
GGTLC2-205ENST00000618722 MAF1Q9H063 256 aa23.29■■□□□ 1.32
GGTLC2-205ENST00000618722 RNF208Q9H0X6 261 aa23.29■■□□□ 1.32
GGTLC2-205ENST00000618722 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
GGTLC2-205ENST00000618722 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
GGTLC2-205ENST00000618722 CYP39A1Q9NYL5 469 aa23.29■■□□□ 1.32
GGTLC2-205ENST00000618722 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
GGTLC2-205ENST00000618722 RPTORQ8N122 1335 aa23.29■■□□□ 1.32
GGTLC2-205ENST00000618722 NFIBO00712 420 aa23.28■■□□□ 1.32
GGTLC2-205ENST00000618722 TRIM32Q13049 653 aa23.28■■□□□ 1.32
GGTLC2-205ENST00000618722 SLC35G1Q2M3R5 365 aa23.28■■□□□ 1.32
GGTLC2-205ENST00000618722 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa23.28■■□□□ 1.32
GGTLC2-205ENST00000618722 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
GGTLC2-205ENST00000618722 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
GGTLC2-205ENST00000618722 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
GGTLC2-205ENST00000618722 CLEC4DQ8WXI8 215 aa23.28■■□□□ 1.32
GGTLC2-205ENST00000618722 PTPDC1A2A3K4 754 aa23.27■■□□□ 1.32
GGTLC2-205ENST00000618722 CYP2C19P33261 490 aa23.27■■□□□ 1.32
GGTLC2-205ENST00000618722 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
GGTLC2-205ENST00000618722 MCF2L2Q86YR7 1114 aa23.27■■□□□ 1.32
GGTLC2-205ENST00000618722 TINF2Q9BSI4 451 aa23.27■■□□□ 1.32
GGTLC2-205ENST00000618722 UNC93B1Q9H1C4 597 aa23.27■■□□□ 1.32
GGTLC2-205ENST00000618722 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa23.27■■□□□ 1.32
GGTLC2-205ENST00000618722 MYH6P13533 1939 aa23.26■■□□□ 1.31
GGTLC2-205ENST00000618722 SOX10P56693 466 aa23.26■■□□□ 1.31
GGTLC2-205ENST00000618722 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
GGTLC2-205ENST00000618722 RNF207Q6ZRF8 634 aa23.26■■□□□ 1.31
GGTLC2-205ENST00000618722 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
GGTLC2-205ENST00000618722 FAM133AQ8N9E0 248 aa23.26■■□□□ 1.31
GGTLC2-205ENST00000618722 RGS22Q8NE09 1264 aa23.26■■□□□ 1.31
GGTLC2-205ENST00000618722 PIBF1Q8WXW3 757 aa23.26■■□□□ 1.31
GGTLC2-205ENST00000618722 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP23.26■■□□□ 1.31
GGTLC2-205ENST00000618722 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa23.26■■□□□ 1.31
GGTLC2-205ENST00000618722 IGHA2P01877 340 aa23.25■■□□□ 1.31
GGTLC2-205ENST00000618722 EVCP57679 992 aa23.25■■□□□ 1.31
GGTLC2-205ENST00000618722 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
GGTLC2-205ENST00000618722 ANKRD1Q15327 319 aa23.25■■□□□ 1.31
GGTLC2-205ENST00000618722 CCDC82Q8N4S0 544 aa23.25■■□□□ 1.31
GGTLC2-205ENST00000618722 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa23.25■■□□□ 1.31
GGTLC2-205ENST00000618722 NID2Q14112 1375 aa23.25■■□□□ 1.31
GGTLC2-205ENST00000618722 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
GGTLC2-205ENST00000618722 GJB1P08034 283 aa23.24■■□□□ 1.31
GGTLC2-205ENST00000618722 CNTN2Q02246 1040 aa23.24■■□□□ 1.31
GGTLC2-205ENST00000618722 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa23.24■■□□□ 1.31
GGTLC2-205ENST00000618722 C22orf23Q9BZE7 217 aa23.24■■□□□ 1.31
GGTLC2-205ENST00000618722 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
GGTLC2-205ENST00000618722 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
GGTLC2-205ENST00000618722 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
GGTLC2-205ENST00000618722 NRBP1Q9UHY1 535 aa23.24■■□□□ 1.31
GGTLC2-205ENST00000618722 CNPY2Q9Y2B0 182 aa23.24■■□□□ 1.31
GGTLC2-205ENST00000618722 SMCHD1A6NHR9 2005 aa23.24■■□□□ 1.31
GGTLC2-205ENST00000618722 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
GGTLC2-205ENST00000618722 CALML3P27482 149 aa23.23■■□□□ 1.31
GGTLC2-205ENST00000618722 RPS6P62753 249 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
GGTLC2-205ENST00000618722 SLC30A10Q6XR72 485 aa23.23■■□□□ 1.31
GGTLC2-205ENST00000618722 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
GGTLC2-205ENST00000618722 ASB14A6NK59 587 aa23.22■■□□□ 1.31
GGTLC2-205ENST00000618722 CYBAP13498 195 aa23.22■■□□□ 1.31
GGTLC2-205ENST00000618722 CAPN2P17655 700 aa23.22■■□□□ 1.31
GGTLC2-205ENST00000618722 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
GGTLC2-205ENST00000618722 CDC27P30260 824 aa23.22■■□□□ 1.31
GGTLC2-205ENST00000618722 SAMD3Q8N6K7 520 aa23.22■■□□□ 1.31
GGTLC2-205ENST00000618722 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
GGTLC2-205ENST00000618722 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
GGTLC2-205ENST00000618722 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa23.22■■□□□ 1.31
GGTLC2-205ENST00000618722 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
GGTLC2-205ENST00000618722 BRCA2P51587 3418 aa23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.2 ms