RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615445.4

PTPRJ-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 4,773 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-208ENST00000615445 SAR1BQ9Y6B6 198 aa22.84■■□□□ 1.25
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PTPRJ-208ENST00000615445 MYO1AQ9UBC5 1043 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRJ-208ENST00000615445 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRJ-208ENST00000615445 PTPRMP28827 1452 aa22.84■■□□□ 1.25
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PTPRJ-208ENST00000615445 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
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PTPRJ-208ENST00000615445 DAAM2Q86T65 1068 aa22.83■■□□□ 1.25
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PTPRJ-208ENST00000615445 USTQ9Y2C2 406 aa22.83■■□□□ 1.25
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PTPRJ-208ENST00000615445 FBF1Q8TES7 1133 aa22.8■■□□□ 1.24
PTPRJ-208ENST00000615445 hCG_1984214I3L0E3 225 aa22.8■■□□□ 1.24
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PTPRJ-208ENST00000615445 GIMAP7Q8NHV1 300 aa22.78■■□□□ 1.24
PTPRJ-208ENST00000615445 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
PTPRJ-208ENST00000615445 CPDO75976 1380 aa22.77■■□□□ 1.24
PTPRJ-208ENST00000615445 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa22.77■■□□□ 1.24
PTPRJ-208ENST00000615445 P2RX5Q93086 422 aa22.77■■□□□ 1.24
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF577Q9BSK1 485 aa22.77■■□□□ 1.24
PTPRJ-208ENST00000615445 FAM169AQ9Y6X4 670 aa22.77■■□□□ 1.24
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