RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589146.5

CAPNS1-207, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CAPNS1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-207ENST00000589146 TBCKQ8TEA7 893 aa25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-207ENST00000589146 KCNH3Q9ULD8 1083 aa25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-207ENST00000589146 CCDC192P0DO97 292 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-207ENST00000589146 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF280CQ8ND82 737 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-207ENST00000589146 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-207ENST00000589146 C12orf42Q96LP6 360 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-207ENST00000589146 EMILIN3Q9NT22 766 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-207ENST00000589146 BACE1P56817 501 aa25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-207ENST00000589146 SNAP25P60880 206 aa25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-207ENST00000589146 AP3B2Q13367 1082 aa25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-207ENST00000589146 WDR90Q96KV7 1748 aa25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-207ENST00000589146 C19orf81C9J6K1 198 aa25.9■■□□□ 1.74
CAPNS1-207ENST00000589146 MEIS2O14770 477 aa25.9■■□□□ 1.74
CAPNS1-207ENST00000589146 EDIL3O43854 480 aa25.9■■□□□ 1.74
CAPNS1-207ENST00000589146 LONP1P36776 959 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
CAPNS1-207ENST00000589146 SPP2Q13103 211 aa25.9■■□□□ 1.74
CAPNS1-207ENST00000589146 IL17AQ16552 155 aa25.9■■□□□ 1.74
CAPNS1-207ENST00000589146 UBE2SQ16763 222 aa25.9■■□□□ 1.74
CAPNS1-207ENST00000589146 CKAP2LQ8IYA6 745 aa25.9■■□□□ 1.74
CAPNS1-207ENST00000589146 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
CAPNS1-207ENST00000589146 IQCA1LA6NCM1 817 aa25.89■■□□□ 1.74
CAPNS1-207ENST00000589146 ADM5C9JUS6 153 aa25.89■■□□□ 1.74
CAPNS1-207ENST00000589146 PIK3CDO00329 1044 aa25.89■■□□□ 1.74
CAPNS1-207ENST00000589146 MAP3K9P80192 1104 aa25.89■■□□□ 1.74
CAPNS1-207ENST00000589146 MTMR2Q13614 643 aa25.89■■□□□ 1.74
CAPNS1-207ENST00000589146 KRT26Q7Z3Y9 468 aa25.89■■□□□ 1.74
CAPNS1-207ENST00000589146 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
CAPNS1-207ENST00000589146 KIFC2Q96AC6 838 aa25.89■■□□□ 1.74
CAPNS1-207ENST00000589146 SLF1Q9BQI6 1058 aa25.89■■□□□ 1.74
CAPNS1-207ENST00000589146 SDF4Q9BRK5 362 aa25.89■■□□□ 1.74
CAPNS1-207ENST00000589146 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.74
CAPNS1-207ENST00000589146 OPLAHO14841 1288 aa25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-207ENST00000589146 FOSP01100 380 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-207ENST00000589146 TYRO3Q06418 890 aa25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-207ENST00000589146 LETM2Q2VYF4 491 aa25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-207ENST00000589146 PPP4R3AQ6IN85 833 aa25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-207ENST00000589146 KRBA2Q6ZNG9 492 aa25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-207ENST00000589146 TMEM60Q9H2L4 133 aa25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-207ENST00000589146 FBXO28Q9NVF7 368 aa25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-207ENST00000589146 ABCB11O95342 1321 aa25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-207ENST00000589146 VWA3AA6NCI4 1184 aa25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-207ENST00000589146 FDX1P10109 184 aa25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-207ENST00000589146 VCAM1P19320 739 aa25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-207ENST00000589146 SPECC1Q5M775 1068 aa25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-207ENST00000589146 SASS6Q6UVJ0 657 aa25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-207ENST00000589146 USP25Q9UHP3 1055 aa25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-207ENST00000589146 ZHX2Q9Y6X8 837 aa25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-207ENST00000589146 POTECB2RU33 542 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-207ENST00000589146 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-207ENST00000589146 NEMFO60524 1076 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-207ENST00000589146 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-207ENST00000589146 OR52Z1P0C646 297 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-207ENST00000589146 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-207ENST00000589146 USP11P51784 963 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-207ENST00000589146 USH1GQ495M9 461 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-207ENST00000589146 DTHD1Q6ZMT9 781 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-207ENST00000589146 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-207ENST00000589146 CRYGNQ8WXF5 182 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-207ENST00000589146 PNMA2Q9UL42 364 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-207ENST00000589146 FZD1Q9UP38 647 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-207ENST00000589146 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-207ENST00000589146 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-207ENST00000589146 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-207ENST00000589146 USP17L15C9J2P7 530 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-207ENST00000589146 USP17L13C9JLJ4 530 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-207ENST00000589146 USP17L11C9JVI0 530 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-207ENST00000589146 USP17L18D6R9N7 530 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-207ENST00000589146 USP17L22D6RA61 530 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-207ENST00000589146 USP17L17D6RBQ6 530 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-207ENST00000589146 USP17L19D6RCP7 530 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-207ENST00000589146 USP17L20D6RJB6 530 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-207ENST00000589146 ICAM1P05362 532 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-207ENST00000589146 USP17L24Q0WX57 530 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-207ENST00000589146 UVSSAQ2YD98 709 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-207ENST00000589146 LONRF3Q496Y0 759 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-207ENST00000589146 SH3D19Q5HYK7 790 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-207ENST00000589146 USP17L6PQ6QN14 398 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-207ENST00000589146 MOXD1Q6UVY6 613 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-207ENST00000589146 USP49Q70CQ1 688 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-207ENST00000589146 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-207ENST00000589146 MTMR9Q96QG7 549 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-207ENST00000589146 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-207ENST00000589146 ANO3Q9BYT9 981 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-207ENST00000589146 KIAA1468Q9P260 1216 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-207ENST00000589146 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-207ENST00000589146 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-207ENST00000589146 CAVIN2O95810 425 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-207ENST00000589146 CYP3A7P24462 503 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-207ENST00000589146 KANK3Q6NY19 840 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-207ENST00000589146 CCDC174Q6PII3 467 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-207ENST00000589146 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-207ENST00000589146 CDCA5Q96FF9 252 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-207ENST00000589146 EPSTI1Q96J88 318 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-207ENST00000589146 MBOAT7Q96N66 472 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-207ENST00000589146 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF536O15090 1300 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-207ENST00000589146 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
CAPNS1-207ENST00000589146 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
CAPNS1-207ENST00000589146 IREB2P48200 963 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
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