RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588780.5

CAPNS1-205, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-205ENST00000588780 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-205ENST00000588780 EEPD1Q7L9B9 569 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-205ENST00000588780 ARNTL2Q8WYA1 636 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-205ENST00000588780 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-205ENST00000588780 GRIN2DO15399 1336 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-205ENST00000588780 SMPD1P17405 629 aa26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-205ENST00000588780 PTGS1P23219 599 aa26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-205ENST00000588780 KRT40Q6A162 431 aa26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-205ENST00000588780 ZBED9Q6R2W3 1325 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-205ENST00000588780 PFKMP08237 780 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-205ENST00000588780 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
CAPNS1-205ENST00000588780 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
CAPNS1-205ENST00000588780 FAM133AQ8N9E0 248 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-205ENST00000588780 HLA-CQ95604 372 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-205ENST00000588780 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
CAPNS1-205ENST00000588780 RNF146Q9NTX7 359 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-205ENST00000588780 CHD7Q9P2D1 2997 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-205ENST00000588780 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-205ENST00000588780 CYP2C9P11712 490 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-205ENST00000588780 CHMP4CQ96CF2 233 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-205ENST00000588780 AGBL1Q96MI9 1066 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-205ENST00000588780 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-205ENST00000588780 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-205ENST00000588780 PDGFCQ9NRA1 345 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-205ENST00000588780 SOWAHBA6NEL2 793 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-205ENST00000588780 FAM86C2PA6NEL3 165 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-205ENST00000588780 KIF28PB7ZC32 967 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-205ENST00000588780 BMP3P12645 472 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-205ENST00000588780 ATP5JP18859 108 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-205ENST00000588780 SLFN13Q68D06 897 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-205ENST00000588780 IQSEC1Q6DN90 963 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-205ENST00000588780 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-205ENST00000588780 HAUS7Q99871 368 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-205ENST00000588780 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP25.98■■□□□ 1.751e-7■■■□□ 14.8
CAPNS1-205ENST00000588780 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-205ENST00000588780 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-205ENST00000588780 TMEM232C9JQI7 657 aa25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-205ENST00000588780 TLL1O43897 1013 aa25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-205ENST00000588780 HMMRO75330 724 aa25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-205ENST00000588780 ALAS1P13196 640 aa25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-205ENST00000588780 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-205ENST00000588780 FAM47CQ5HY64 1035 aa25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-205ENST00000588780 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-205ENST00000588780 SLC9A7Q96T83 725 aa25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-205ENST00000588780 ZNF287Q9HBT7 754 aa25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-205ENST00000588780 TNKSO95271 1327 aa25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-205ENST00000588780 EPOPA6NHQ4 379 aa25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-205ENST00000588780 PRDM1O75626 825 aa25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-205ENST00000588780 FDX1P10109 184 aa25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-205ENST00000588780 SBK1Q52WX2 424 aa25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-205ENST00000588780 CEP95Q96GE4 821 aa25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-205ENST00000588780 TRERF1Q96PN7 1200 aa25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-205ENST00000588780 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-205ENST00000588780 TTLL1O95922 423 aa25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-205ENST00000588780 MYL3P08590 195 aa25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-205ENST00000588780 STAT2P52630 851 aa25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-205ENST00000588780 RETREG2Q8NC44 543 aa25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-205ENST00000588780 Q9Y3F1 56 aa25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-205ENST00000588780 MYH4Q9Y623 1939 aa25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-205ENST00000588780 TDO2P48775 406 aa25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-205ENST00000588780 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-205ENST00000588780 PANK1Q8TE04 598 aa25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-205ENST00000588780 CHURC1Q8WUH1 139 aa25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-205ENST00000588780 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-205ENST00000588780 POLR3EQ9NVU0 708 aa25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-205ENST00000588780 MTMR4Q9NYA4 1195 aa25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-205ENST00000588780 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-205ENST00000588780 RAB11FIP3O75154 756 aa25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-205ENST00000588780 APPP05067 770 aa25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-205ENST00000588780 TAP1Q03518 808 aa25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-205ENST00000588780 TKFCQ3LXA3 575 aa25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-205ENST00000588780 TMEM63BQ5T3F8 832 aa25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-205ENST00000588780 MKL1Q969V6 931 aa25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-205ENST00000588780 VWCEQ96DN2 955 aa25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-205ENST00000588780 LRRC37A2A6NM11 1700 aa25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-205ENST00000588780 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-205ENST00000588780 GPR37L1O60883 481 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-205ENST00000588780 TAPT1Q6NXT6 567 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-205ENST00000588780 NSMFQ6X4W1 530 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-205ENST00000588780 FAM160B2Q86V87 743 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-205ENST00000588780 HERC6Q8IVU3 1022 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-205ENST00000588780 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-205ENST00000588780 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-205ENST00000588780 VTA1Q9NP79 307 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-205ENST00000588780 GSG1L2A8MUP6 293 aa25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-205ENST00000588780 TSPY3P0CV98 308 aa25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-205ENST00000588780 TSPY8P0CW00 308 aa25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-205ENST00000588780 RFC2P35250 354 aa25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-205ENST00000588780 SLC1A4P43007 532 aa25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-205ENST00000588780 GRB10Q13322 594 aa25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-205ENST00000588780 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-205ENST00000588780 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-205ENST00000588780 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-205ENST00000588780 MYH7P12883 1935 aa25.9■■□□□ 1.74
CAPNS1-205ENST00000588780 SNAP25P60880 206 aa25.9■■□□□ 1.74
CAPNS1-205ENST00000588780 GIMAP6Q6P9H5 292 aa25.9■■□□□ 1.74
CAPNS1-205ENST00000588780 STAG1Q8WVM7 1258 aa25.9■■□□□ 1.74
CAPNS1-205ENST00000588780 NOD1Q9Y239 953 aa25.9■■□□□ 1.74
CAPNS1-205ENST00000588780 XIRP2A4UGR9 3374 aa25.9■■□□□ 1.74
CAPNS1-205ENST00000588780 REV3LO60673 3130 aa25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 104.6 ms