RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574728.1

PRPF8-211, Transcript of pre-mRNA processing factor 8, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF8, Length 466 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8-211ENST00000574728 TXNRD1Q16881 649 aa6.4□□□□□ -1.38
PRPF8-211ENST00000574728 PAOXQ6QHF9 649 aa6.4□□□□□ -1.38
PRPF8-211ENST00000574728 BEND4Q6ZU67 534 aa6.4□□□□□ -1.38
PRPF8-211ENST00000574728 CLEC10AQ8IUN9 316 aa6.4□□□□□ -1.38
PRPF8-211ENST00000574728 HID1Q8IV36 788 aa6.4□□□□□ -1.38
PRPF8-211ENST00000574728 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP6.4□□□□□ -1.38
PRPF8-211ENST00000574728 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa6.4□□□□□ -1.38
PRPF8-211ENST00000574728 FERD3LQ96RJ6 166 aa6.4□□□□□ -1.38
PRPF8-211ENST00000574728 TPSG1Q9NRR2 321 aa6.4□□□□□ -1.38
PRPF8-211ENST00000574728 REV1Q9UBZ9 1251 aa6.4□□□□□ -1.38
PRPF8-211ENST00000574728 RAXQ9Y2V3 346 aa6.4□□□□□ -1.38
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PRPF8-211ENST00000574728 IMPDH2P12268 514 aa6.39□□□□□ -1.39
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PRPF8-211ENST00000574728 EHMT1Q9H9B1 1298 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF8-211ENST00000574728 STOML1Q9UBI4 398 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF8-211ENST00000574728 STRIP2Q9ULQ0 834 aa6.39□□□□□ -1.39
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PRPF8-211ENST00000574728 ZNF827Q17R98 1081 aa6.38□□□□□ -1.39
PRPF8-211ENST00000574728 SULT6B1Q6IMI4 303 aa6.38□□□□□ -1.39
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PRPF8-211ENST00000574728 GMLQ99445 158 aa6.38□□□□□ -1.39
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PRPF8-211ENST00000574728 DOT1LQ8TEK3 1739 aa6.38□□□□□ -1.39
PRPF8-211ENST00000574728 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
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PRPF8-211ENST00000574728 FBXW10Q5XX13 1052 aa6.37□□□□□ -1.39
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PRPF8-211ENST00000574728 AMIGO3Q86WK7 504 aa6.37□□□□□ -1.39
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PRPF8-211ENST00000574728 CRBNQ96SW2 442 aa6.37□□□□□ -1.39
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PRPF8-211ENST00000574728 HMX2A2RU54 273 aa6.35□□□□□ -1.39
PRPF8-211ENST00000574728 ERVV-2B6SEH9 535 aa6.35□□□□□ -1.39
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PRPF8-211ENST00000574728 EIF6P56537 245 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PRPF8-211ENST00000574728 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PRPF8-211ENST00000574728 SLC15A2Q16348 729 aa6.35□□□□□ -1.39
PRPF8-211ENST00000574728 AMOTQ4VCS5 1084 aa6.35□□□□□ -1.39
PRPF8-211ENST00000574728 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PRPF8-211ENST00000574728 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa6.35□□□□□ -1.39
PRPF8-211ENST00000574728 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PRPF8-211ENST00000574728 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa6.35□□□□□ -1.39
PRPF8-211ENST00000574728 CCDC81Q6ZN84 652 aa6.35□□□□□ -1.39
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