RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566749.5

PPP4C-209, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,490 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-209	ENST00000566749	NFIB	O00712	420 aa		28.68	■■■□□ 2.18
PPP4C-209	ENST00000566749	DDAH1	O94760	285 aa		28.68	■■■□□ 2.18
PPP4C-209	ENST00000566749	LIFR	P42702	1097 aa		28.68	■■■□□ 2.18
PPP4C-209	ENST00000566749	QRICH1	Q2TAL8	776 aa		28.68	■■■□□ 2.18
PPP4C-209	ENST00000566749	MAMDC4	Q6UXC1	1216 aa		28.68	■■■□□ 2.18
PPP4C-209	ENST00000566749	DHX32	Q7L7V1	743 aa	Known RBP	28.68	■■■□□ 2.18
PPP4C-209	ENST00000566749	FAM133A	Q8N9E0	248 aa		28.68	■■■□□ 2.18
PPP4C-209	ENST00000566749	MYL10	Q9BUA6	226 aa		28.68	■■■□□ 2.18
PPP4C-209	ENST00000566749	NRBP1	Q9UHY1	535 aa		28.68	■■■□□ 2.18
PPP4C-209	ENST00000566749	CNPY2	Q9Y2B0	182 aa		28.68	■■■□□ 2.18
PPP4C-209	ENST00000566749	SYNGAP1	Q96PV0	1343 aa		28.68	■■■□□ 2.18
PPP4C-209	ENST00000566749	PDE4DIP	Q5VU43	2346 aa		28.68	■■■□□ 2.18
PPP4C-209	ENST00000566749	ANKLE1	Q8NAG6	615 aa		28.67	■■■□□ 2.18
PPP4C-209	ENST00000566749	CTCFL	Q8NI51	663 aa	Predicted RBP	28.67	■■■□□ 2.18
PPP4C-209	ENST00000566749	KCNB2	Q92953	911 aa		28.67	■■■□□ 2.18
PPP4C-209	ENST00000566749	FGD4	Q96M96	766 aa		28.67	■■■□□ 2.18
PPP4C-209	ENST00000566749	PTPDC1	A2A3K4	754 aa		28.66	■■■□□ 2.18
PPP4C-209	ENST00000566749	SEPT4	O43236	478 aa		28.66	■■■□□ 2.18
PPP4C-209	ENST00000566749	HMGB1	P09429	215 aa	Known RBP	28.66	■■■□□ 2.18
PPP4C-209	ENST00000566749	FBXO11	Q86XK2	927 aa		28.66	■■■□□ 2.18
PPP4C-209	ENST00000566749	CLEC4D	Q8WXI8	215 aa		28.66	■■■□□ 2.18
PPP4C-209	ENST00000566749	TCEANC2	Q96MN5	208 aa		28.66	■■■□□ 2.18
PPP4C-209	ENST00000566749	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	28.66	■■■□□ 2.18
PPP4C-209	ENST00000566749	EXOSC10	Q01780	885 aa	Known RBP	28.66	■■■□□ 2.18
PPP4C-209	ENST00000566749	BAAT	Q14032	418 aa	Predicted RBP	28.66	■■■□□ 2.18
PPP4C-209	ENST00000566749	UBE2Q1	Q7Z7E8	422 aa		28.66	■■■□□ 2.18
PPP4C-209	ENST00000566749	MAP3K14	Q99558	947 aa		28.66	■■■□□ 2.18
PPP4C-209	ENST00000566749	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		28.66	■■■□□ 2.18
PPP4C-209	ENST00000566749	SLC12A7	Q9Y666	1083 aa		28.66	■■■□□ 2.18
PPP4C-209	ENST00000566749	ABCB11	O95342	1321 aa		28.65	■■■□□ 2.18
PPP4C-209	ENST00000566749	SOWAHB	A6NEL2	793 aa		28.65	■■■□□ 2.18
PPP4C-209	ENST00000566749	KIF5B	P33176	963 aa		28.65	■■■□□ 2.18
PPP4C-209	ENST00000566749	RNF207	Q6ZRF8	634 aa		28.65	■■■□□ 2.18
PPP4C-209	ENST00000566749	JAKMIP1	Q96N16	626 aa	Known RBP	28.65	■■■□□ 2.18
PPP4C-209	ENST00000566749	BAZ2B	Q9UIF8	2168 aa	Known RBP	28.65	■■■□□ 2.18
PPP4C-209	ENST00000566749	MCM3AP	O60318	1980 aa		28.64	■■■□□ 2.18
PPP4C-209	ENST00000566749	FRMPD3	Q5JV73	1810 aa		28.64	■■■□□ 2.18
PPP4C-209	ENST00000566749	SNAI1	O95863	264 aa	Predicted RBP	28.64	■■■□□ 2.17
PPP4C-209	ENST00000566749	CALM1	P0DP23	149 aa		28.64	■■■□□ 2.17
PPP4C-209	ENST00000566749	CALM2	P0DP24	149 aa		28.64	■■■□□ 2.17
PPP4C-209	ENST00000566749	CALM3	P0DP25	149 aa		28.64	■■■□□ 2.17
PPP4C-209	ENST00000566749	ARMCX2	Q7L311	632 aa		28.64	■■■□□ 2.17
PPP4C-209	ENST00000566749	HOMER1	Q86YM7	354 aa		28.64	■■■□□ 2.17
PPP4C-209	ENST00000566749	PAWR	Q96IZ0	340 aa	Known RBP	28.64	■■■□□ 2.17
PPP4C-209	ENST00000566749	RIOX1	Q9H6W3	641 aa		28.64	■■■□□ 2.17
PPP4C-209	ENST00000566749	CDKN2AIP	Q9NXV6	580 aa	Predicted RBP	28.64	■■■□□ 2.17
PPP4C-209	ENST00000566749	ZBTB5	O15062	677 aa		28.63	■■■□□ 2.17
PPP4C-209	ENST00000566749	CALML3	P27482	149 aa		28.63	■■■□□ 2.17
PPP4C-209	ENST00000566749	ANO1	Q5XXA6	986 aa		28.63	■■■□□ 2.17
PPP4C-209	ENST00000566749	SGMS1	Q86VZ5	419 aa		28.63	■■■□□ 2.17
PPP4C-209	ENST00000566749	CCDC144CP	Q8IYA2	1237 aa		28.63	■■■□□ 2.17
PPP4C-209	ENST00000566749	DIS3L	Q8TF46	1054 aa	Known RBP	28.63	■■■□□ 2.17
PPP4C-209	ENST00000566749	MTMR8	Q96EF0	704 aa		28.63	■■■□□ 2.17
PPP4C-209	ENST00000566749	AMN	Q9BXJ7	453 aa		28.63	■■■□□ 2.17
PPP4C-209	ENST00000566749	ZHX1	Q9UKY1	873 aa	Predicted RBP	28.63	■■■□□ 2.17
PPP4C-209	ENST00000566749	ZNF865	P0CJ78	1059 aa	Predicted RBP	28.62	■■■□□ 2.17
PPP4C-209	ENST00000566749	RXRA	P19793	462 aa		28.62	■■■□□ 2.17
PPP4C-209	ENST00000566749	SLC30A10	Q6XR72	485 aa		28.62	■■■□□ 2.17
PPP4C-209	ENST00000566749	SYNE3	Q6ZMZ3	975 aa		28.62	■■■□□ 2.17
PPP4C-209	ENST00000566749	NECAB2	Q7Z6G3	386 aa		28.62	■■■□□ 2.17
PPP4C-209	ENST00000566749	PURB	Q96QR8	312 aa	Known RBP	28.62	■■■□□ 2.17
PPP4C-209	ENST00000566749	USP26	Q9BXU7	913 aa		28.62	■■■□□ 2.17
PPP4C-209	ENST00000566749	ASB14	A6NK59	587 aa		28.61	■■■□□ 2.17
PPP4C-209	ENST00000566749	CYTH3	O43739	400 aa		28.61	■■■□□ 2.17
PPP4C-209	ENST00000566749	RPS6	P62753	249 aa	Known RBP	28.61	■■■□□ 2.17
PPP4C-209	ENST00000566749	FGD1	P98174	961 aa		28.61	■■■□□ 2.17
PPP4C-209	ENST00000566749	SLC35G1	Q2M3R5	365 aa		28.61	■■■□□ 2.17
PPP4C-209	ENST00000566749	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		28.61	■■■□□ 2.17
PPP4C-209	ENST00000566749	PIGS	Q96S52	555 aa		28.61	■■■□□ 2.17
PPP4C-209	ENST00000566749	ABHD16B	Q9H3Z7	469 aa		28.61	■■■□□ 2.17
PPP4C-209	ENST00000566749	ADD3	Q9UEY8	706 aa	Known RBP	28.61	■■■□□ 2.17
PPP4C-209	ENST00000566749	MRPL11	Q9Y3B7	192 aa	Known RBP	28.61	■■■□□ 2.17
PPP4C-209	ENST00000566749	LCT	P09848	1927 aa		28.6	■■■□□ 2.17
PPP4C-209	ENST00000566749	GNAQ	P50148	359 aa		28.6	■■■□□ 2.17
PPP4C-209	ENST00000566749	ACVR2B	Q13705	512 aa		28.6	■■■□□ 2.17
PPP4C-209	ENST00000566749	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		28.6	■■■□□ 2.17
PPP4C-209	ENST00000566749	ASTN1	O14525	1302 aa		28.6	■■■□□ 2.17
PPP4C-209	ENST00000566749	AKR1A1	P14550	325 aa		28.59	■■■□□ 2.17
PPP4C-209	ENST00000566749	CPA1	P15085	419 aa		28.59	■■■□□ 2.17
PPP4C-209	ENST00000566749	MNX1	P50219	401 aa	Predicted RBP	28.59	■■■□□ 2.17
PPP4C-209	ENST00000566749	MICU3	Q86XE3	530 aa		28.59	■■■□□ 2.17
PPP4C-209	ENST00000566749	RGS22	Q8NE09	1264 aa		28.59	■■■□□ 2.17
PPP4C-209	ENST00000566749	LZTS2	Q9BRK4	669 aa		28.59	■■■□□ 2.17
PPP4C-209	ENST00000566749	HTATIP2	Q9BUP3	242 aa		28.59	■■■□□ 2.17
PPP4C-209	ENST00000566749	RARB	P10826	455 aa		28.59	■■■□□ 2.17
PPP4C-209	ENST00000566749	PSMA5	P28066	241 aa		28.59	■■■□□ 2.17
PPP4C-209	ENST00000566749	MCF2L2	Q86YR7	1114 aa		28.59	■■■□□ 2.17
PPP4C-209	ENST00000566749	PIBF1	Q8WXW3	757 aa		28.59	■■■□□ 2.17
PPP4C-209	ENST00000566749	FAM184B	Q9ULE4	1060 aa		28.59	■■■□□ 2.17
PPP4C-209	ENST00000566749	PCDHA1	Q9Y5I3	950 aa		28.59	■■■□□ 2.17
PPP4C-209	ENST00000566749	PNMA6F	A0A0J9YX94	578 aa		28.58	■■■□□ 2.17
PPP4C-209	ENST00000566749	PPP1R11	O60927	126 aa	Predicted RBP	28.58	■■■□□ 2.17
PPP4C-209	ENST00000566749	TRAF1	Q13077	416 aa		28.58	■■■□□ 2.17
PPP4C-209	ENST00000566749	FANCB	Q8NB91	859 aa		28.58	■■■□□ 2.17
PPP4C-209	ENST00000566749	SPZ1	Q9BXG8	430 aa		28.58	■■■□□ 2.17
PPP4C-209	ENST00000566749	C11orf49	Q9H6J7	331 aa		28.58	■■■□□ 2.17
PPP4C-209	ENST00000566749	PLEKHA8P1	O95397	391 aa		28.57	■■■□□ 2.16
PPP4C-209	ENST00000566749	MYCN	P04198	464 aa	Predicted RBP	28.57	■■■□□ 2.16
PPP4C-209	ENST00000566749	CAST	P20810	708 aa	Known RBP	28.57	■■■□□ 2.16
PPP4C-209	ENST00000566749	SMARCA1	P28370	1054 aa		28.57	■■■□□ 2.16

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