RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-231ENST00000552222 TAP1Q03518 808 aa16.5■□□□□ 0.23
CS-231ENST00000552222 ITGA7Q13683 1181 aa16.5■□□□□ 0.23
CS-231ENST00000552222 TMEM67Q5HYA8 995 aa16.5■□□□□ 0.23
CS-231ENST00000552222 ARMCX2Q7L311 632 aa16.5■□□□□ 0.23
CS-231ENST00000552222 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa16.5■□□□□ 0.23
CS-231ENST00000552222 SLC43A3Q8NBI5 491 aa16.5■□□□□ 0.23
CS-231ENST00000552222 PI4K2BQ8TCG2 481 aa16.5■□□□□ 0.23
CS-231ENST00000552222 ARMT1Q9H993 441 aa16.5■□□□□ 0.23
CS-231ENST00000552222 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
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CS-231ENST00000552222 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa16.49■□□□□ 0.23
CS-231ENST00000552222 STK11IPQ8N1F8 1099 aa16.49■□□□□ 0.23
CS-231ENST00000552222 CHMP4CQ96CF2 233 aa16.49■□□□□ 0.23
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CS-231ENST00000552222 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
CS-231ENST00000552222 TRANK1O15050 2925 aa16.49■□□□□ 0.23
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CS-231ENST00000552222 PDE6AP16499 860 aa16.48■□□□□ 0.23
CS-231ENST00000552222 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
CS-231ENST00000552222 CDK8P49336 464 aa16.48■□□□□ 0.23
CS-231ENST00000552222 NHLH1Q02575 133 aa16.48■□□□□ 0.23
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CS-231ENST00000552222 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP16.48■□□□□ 0.23
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CS-231ENST00000552222 SCN5AQ14524 2016 aa16.48■□□□□ 0.23
CS-231ENST00000552222 ZNF532Q9HCE3 1301 aa16.47■□□□□ 0.23
CS-231ENST00000552222 IL9P15248 144 aa16.47■□□□□ 0.23
CS-231ENST00000552222 EEPD1Q7L9B9 569 aa16.47■□□□□ 0.23
CS-231ENST00000552222 FBXL18Q96ME1 805 aa16.47■□□□□ 0.23
CS-231ENST00000552222 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
CS-231ENST00000552222 HOMER2Q9NSB8 354 aa16.47■□□□□ 0.23
CS-231ENST00000552222 COG5Q9UP83 839 aa16.47■□□□□ 0.23
CS-231ENST00000552222 PIEZO1Q92508 2521 aa16.47■□□□□ 0.23
CS-231ENST00000552222 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
CS-231ENST00000552222 SMPD1P17405 629 aa16.46■□□□□ 0.23
CS-231ENST00000552222 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa16.46■□□□□ 0.23
CS-231ENST00000552222 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
CS-231ENST00000552222 SPC25Q9HBM1 224 aa16.46■□□□□ 0.23
CS-231ENST00000552222 MTUS1Q9ULD2 1270 aa16.46■□□□□ 0.23
CS-231ENST00000552222 WDFY4Q6ZS81 3184 aa16.45■□□□□ 0.22
CS-231ENST00000552222 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa16.45■□□□□ 0.22
CS-231ENST00000552222 TNFAIP2Q03169 654 aa16.45■□□□□ 0.22
CS-231ENST00000552222 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
CS-231ENST00000552222 TLK2Q86UE8 772 aa16.45■□□□□ 0.22
CS-231ENST00000552222 SLF1Q9BQI6 1058 aa16.45■□□□□ 0.22
CS-231ENST00000552222 TEX13BQ9BXU2 312 aa16.45■□□□□ 0.22
CS-231ENST00000552222 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa16.45■□□□□ 0.22
CS-231ENST00000552222 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
CS-231ENST00000552222 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
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CS-231ENST00000552222 GJD3Q8N144 294 aa16.44■□□□□ 0.22
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CS-231ENST00000552222 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
CS-231ENST00000552222 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
CS-231ENST00000552222 KIFC2Q96AC6 838 aa16.44■□□□□ 0.22
CS-231ENST00000552222 USP17L12C9JPN9 530 aa16.43■□□□□ 0.22
CS-231ENST00000552222 USP17L21D6R901 530 aa16.43■□□□□ 0.22
CS-231ENST00000552222 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
CS-231ENST00000552222 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
CS-231ENST00000552222 KBTBD3Q8NAB2 608 aa16.43■□□□□ 0.22
CS-231ENST00000552222 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
CS-231ENST00000552222 SH2D4AQ9H788 454 aa16.43■□□□□ 0.22
CS-231ENST00000552222 SWAP70Q9UH65 585 aa16.43■□□□□ 0.22
CS-231ENST00000552222 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
CS-231ENST00000552222 MBD4O95243 580 aa16.42■□□□□ 0.22
CS-231ENST00000552222 NDUFB10O96000 172 aa16.42■□□□□ 0.22
CS-231ENST00000552222 KCNA5P22460 613 aa16.42■□□□□ 0.22
CS-231ENST00000552222 SNAP25P60880 206 aa16.42■□□□□ 0.22
CS-231ENST00000552222 TCTN1Q2MV58 587 aa16.42■□□□□ 0.22
CS-231ENST00000552222 C12orf60Q5U649 245 aa16.42■□□□□ 0.22
CS-231ENST00000552222 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
CS-231ENST00000552222 HERC6Q8IVU3 1022 aa16.42■□□□□ 0.22
CS-231ENST00000552222 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
CS-231ENST00000552222 FAM178BQ8IXR5 827 aa16.42■□□□□ 0.22
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CS-231ENST00000552222 NKX3-2P78367 333 aa16.41■□□□□ 0.22
CS-231ENST00000552222 CERS3Q8IU89 383 aa16.41■□□□□ 0.22
CS-231ENST00000552222 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP16.41■□□□□ 0.22
CS-231ENST00000552222 KANSL2Q9H9L4 492 aa16.41■□□□□ 0.22
CS-231ENST00000552222 GOPCQ9HD26 462 aa16.41■□□□□ 0.22
CS-231ENST00000552222 F5H6K3 240 aa16.4■□□□□ 0.22
CS-231ENST00000552222 ADD2P35612 726 aa16.4■□□□□ 0.22
CS-231ENST00000552222 KLRC3Q07444 240 aa16.4■□□□□ 0.22
CS-231ENST00000552222 TAPT1Q6NXT6 567 aa16.4■□□□□ 0.22
CS-231ENST00000552222 C16orf86Q6ZW13 317 aa16.4■□□□□ 0.22
CS-231ENST00000552222 SKAP1Q86WV1 359 aa16.4■□□□□ 0.22
CS-231ENST00000552222 EVI5LQ96CN4 794 aa16.4■□□□□ 0.22
CS-231ENST00000552222 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP16.4■□□□□ 0.22
CS-231ENST00000552222 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
CS-231ENST00000552222 MYH8P13535 1937 aa16.4■□□□□ 0.22
CS-231ENST00000552222 PTPRSQ13332 1948 aa16.4■□□□□ 0.22
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