RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491266.5

RABGGTB-212, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, human

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RABGGTB-212	ENST00000491266	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		7.55	□□□□□ -1.2
RABGGTB-212	ENST00000491266		H3BRJ5	948 aa		7.55	□□□□□ -1.2
RABGGTB-212	ENST00000491266	CIAO1	O76071	339 aa		7.55	□□□□□ -1.2
RABGGTB-212	ENST00000491266	B3GALT4	O96024	378 aa		7.55	□□□□□ -1.2
RABGGTB-212	ENST00000491266	SRGN	P10124	158 aa		7.55	□□□□□ -1.2
RABGGTB-212	ENST00000491266	ESRRA	P11474	423 aa	Predicted RBP	7.55	□□□□□ -1.2
RABGGTB-212	ENST00000491266	GSPT1	P15170	499 aa	Known RBP	7.55	□□□□□ -1.2
RABGGTB-212	ENST00000491266	FGFR2	P21802	821 aa		7.55	□□□□□ -1.2
RABGGTB-212	ENST00000491266	ADORA1	P30542	326 aa		7.55	□□□□□ -1.2
RABGGTB-212	ENST00000491266	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	7.55	□□□□□ -1.2
RABGGTB-212	ENST00000491266	RGS3	P49796	1198 aa		7.55	□□□□□ -1.2
RABGGTB-212	ENST00000491266	TIMM10	P62072	90 aa		7.55	□□□□□ -1.2
RABGGTB-212	ENST00000491266	PCDH1	Q08174	1060 aa		7.55	□□□□□ -1.2
RABGGTB-212	ENST00000491266	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	7.55	□□□□□ -1.2
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF423	Q2M1K9	1284 aa		7.55	□□□□□ -1.2
RABGGTB-212	ENST00000491266	SV2B	Q7L1I2	683 aa		7.55	□□□□□ -1.2
RABGGTB-212	ENST00000491266	SVOP	Q8N4V2	548 aa		7.55	□□□□□ -1.2
RABGGTB-212	ENST00000491266	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		7.55	□□□□□ -1.2
RABGGTB-212	ENST00000491266	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	7.55	□□□□□ -1.2
RABGGTB-212	ENST00000491266	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	7.55	□□□□□ -1.2
RABGGTB-212	ENST00000491266	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		7.55	□□□□□ -1.2
RABGGTB-212	ENST00000491266	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		7.55	□□□□□ -1.2
RABGGTB-212	ENST00000491266	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		7.54	□□□□□ -1.2
RABGGTB-212	ENST00000491266	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		7.54	□□□□□ -1.2
RABGGTB-212	ENST00000491266	RAB11FIP3	O75154	756 aa		7.54	□□□□□ -1.2
RABGGTB-212	ENST00000491266	TAF5L	O75529	589 aa		7.54	□□□□□ -1.2
RABGGTB-212	ENST00000491266	KLRK1	P26718	216 aa		7.54	□□□□□ -1.2
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF76	P36508	570 aa		7.54	□□□□□ -1.2
RABGGTB-212	ENST00000491266	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	7.54	□□□□□ -1.2
RABGGTB-212	ENST00000491266	CCDC57	Q2TAC2	916 aa		7.54	□□□□□ -1.2
RABGGTB-212	ENST00000491266	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		7.54	□□□□□ -1.2
RABGGTB-212	ENST00000491266	TNNI3K	Q59H18	835 aa		7.54	□□□□□ -1.2
RABGGTB-212	ENST00000491266	LINC00114	Q6XXX2	140 aa		7.54	□□□□□ -1.2
RABGGTB-212	ENST00000491266	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		7.54	□□□□□ -1.2
RABGGTB-212	ENST00000491266	ERMP1	Q7Z2K6	904 aa		7.54	□□□□□ -1.2
RABGGTB-212	ENST00000491266	IL22RA1	Q8N6P7	574 aa		7.54	□□□□□ -1.2
RABGGTB-212	ENST00000491266	RNF34	Q969K3	372 aa		7.54	□□□□□ -1.2
RABGGTB-212	ENST00000491266	KIF1BP	Q96EK5	621 aa		7.54	□□□□□ -1.2
RABGGTB-212	ENST00000491266	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		7.54	□□□□□ -1.2
RABGGTB-212	ENST00000491266	LRRCC1	Q9C099	1032 aa		7.54	□□□□□ -1.2
RABGGTB-212	ENST00000491266	CEP44	Q9C0F1	390 aa		7.54	□□□□□ -1.2
RABGGTB-212	ENST00000491266	SOX17	Q9H6I2	414 aa	Predicted RBP	7.54	□□□□□ -1.2
RABGGTB-212	ENST00000491266	ENAM	Q9NRM1	1142 aa		7.54	□□□□□ -1.2
RABGGTB-212	ENST00000491266	STAP2	Q9UGK3	403 aa		7.54	□□□□□ -1.2
RABGGTB-212	ENST00000491266	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	7.54	□□□□□ -1.2
RABGGTB-212	ENST00000491266	MINPP1	Q9UNW1	487 aa		7.54	□□□□□ -1.2
RABGGTB-212	ENST00000491266	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		7.54	□□□□□ -1.2
RABGGTB-212	ENST00000491266	PPME1	Q9Y570	386 aa		7.54	□□□□□ -1.2
RABGGTB-212	ENST00000491266	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		7.54	□□□□□ -1.2
RABGGTB-212	ENST00000491266	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		7.53	□□□□□ -1.2
RABGGTB-212	ENST00000491266	SOX1	O00570	391 aa	Predicted RBP	7.53	□□□□□ -1.2
RABGGTB-212	ENST00000491266	ENC1	O14682	589 aa		7.53	□□□□□ -1.2
RABGGTB-212	ENST00000491266	AMPD1	P23109	780 aa		7.53	□□□□□ -1.2
RABGGTB-212	ENST00000491266	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	7.53	□□□□□ -1.2
RABGGTB-212	ENST00000491266	PDE1A	P54750	535 aa		7.53	□□□□□ -1.2
RABGGTB-212	ENST00000491266	INSM1	Q01101	510 aa	Predicted RBP	7.53	□□□□□ -1.2
RABGGTB-212	ENST00000491266	CHRND	Q07001	517 aa		7.53	□□□□□ -1.2
RABGGTB-212	ENST00000491266	RAD51AP2	Q09MP3	1159 aa		7.53	□□□□□ -1.2
RABGGTB-212	ENST00000491266	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	7.53	□□□□□ -1.2
RABGGTB-212	ENST00000491266	GRAP	Q13588	217 aa		7.53	□□□□□ -1.2
RABGGTB-212	ENST00000491266	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		7.53	□□□□□ -1.2
RABGGTB-212	ENST00000491266	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	7.53	□□□□□ -1.2
RABGGTB-212	ENST00000491266	PI4K2B	Q8TCG2	481 aa		7.53	□□□□□ -1.2
RABGGTB-212	ENST00000491266	WNT8B	Q93098	351 aa		7.53	□□□□□ -1.2
RABGGTB-212	ENST00000491266	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		7.53	□□□□□ -1.2
RABGGTB-212	ENST00000491266	MTFR1L	Q9H019	292 aa		7.53	□□□□□ -1.2
RABGGTB-212	ENST00000491266	BSDC1	Q9NW68	430 aa	Predicted RBP	7.53	□□□□□ -1.2
RABGGTB-212	ENST00000491266	SNED1	Q8TER0	1413 aa		7.52	□□□□□ -1.2
RABGGTB-212	ENST00000491266	LAMB2	P55268	1798 aa		7.52	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266		A0A0G2JLW4	131 aa		7.52	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	CHGB	P05060	677 aa		7.52	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	DPEP1	P16444	411 aa		7.52	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	ST5	P78524	1137 aa		7.52	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	GPSM2	P81274	684 aa		7.52	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	AACS	Q86V21	672 aa		7.52	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	WFDC8	Q8IUA0	241 aa		7.52	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	7.52	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	RSRP1	Q9BUV0	290 aa		7.52	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	SRA1	Q9HD15	236 aa	Known RBP	7.52	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	OSGEP	Q9NPF4	335 aa		7.52	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	GPR108	Q9NPR9	543 aa		7.52	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF609	O15014	1411 aa		7.52	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	TAF1	P21675	1872 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266		A0A1B0GUL7	405 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	FBXO24	O75426	580 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	PDE8B	O95263	885 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	CELA3A	P09093	270 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	SNRPN	P63162	240 aa	Known RBP	7.51	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	7.51	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	IKBKE	Q14164	716 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	TTC22	Q5TAA0	569 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZSCAN1	Q8NBB4	408 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	NEDD1	Q8NHV4	660 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	TRIM11	Q96F44	468 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	NRSN2	Q9GZP1	204 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMEM39A	Q9NV64	488 aa		7.51	□□□□□ -1.21

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