RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LRRC45Q96CN5 670 aa18.3■□□□□ 0.52
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 USP17L4A6NCW7 530 aa18.29■□□□□ 0.52
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 USP17L1Q7RTZ2 530 aa18.29■□□□□ 0.52
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa18.28■□□□□ 0.52
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GALNT17Q6IS24 598 aa18.26■□□□□ 0.51
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ACRBPQ8NEB7 543 aa18.26■□□□□ 0.51
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KIF2CQ99661 725 aa18.26■□□□□ 0.51
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ST7Q9NRC1 585 aa18.26■□□□□ 0.51
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MECOMQ03112 1051 aa18.25■□□□□ 0.51
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 BRD3Q15059 726 aa18.25■□□□□ 0.51
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HYOU1Q9Y4L1 999 aa18.25■□□□□ 0.51
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KRIT1O00522 736 aa18.25■□□□□ 0.51
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PPP2R5DQ14738 602 aa18.25■□□□□ 0.51
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PALLDQ8WX93 1383 aa18.25■□□□□ 0.51
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