RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481121.5

NELFE-208, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 2

Gene NELFE, Length 1,543 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-208ENST00000481121 NFIBO00712 420 aa24.22■■□□□ 1.47
NELFE-208ENST00000481121 ADCK5Q3MIX3 580 aa24.22■■□□□ 1.47
NELFE-208ENST00000481121 TMTC2Q8N394 836 aa24.22■■□□□ 1.47
NELFE-208ENST00000481121 FAM133AQ8N9E0 248 aa24.22■■□□□ 1.47
NELFE-208ENST00000481121 ANKLE1Q8NAG6 615 aa24.22■■□□□ 1.47
NELFE-208ENST00000481121 LRRC2Q9BYS8 371 aa24.22■■□□□ 1.47
NELFE-208ENST00000481121 JMJD4Q9H9V9 463 aa24.22■■□□□ 1.47
NELFE-208ENST00000481121 NRBP1Q9UHY1 535 aa24.22■■□□□ 1.47
NELFE-208ENST00000481121 OGDHLQ9ULD0 1010 aa24.22■■□□□ 1.47
NELFE-208ENST00000481121 ALPK3Q96L96 1907 aa24.22■■□□□ 1.47
NELFE-208ENST00000481121 LIFRP42702 1097 aa24.21■■□□□ 1.47
NELFE-208ENST00000481121 CNTN2Q02246 1040 aa24.21■■□□□ 1.47
NELFE-208ENST00000481121 QRICH1Q2TAL8 776 aa24.21■■□□□ 1.47
NELFE-208ENST00000481121 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa24.21■■□□□ 1.47
NELFE-208ENST00000481121 LHX8Q68G74 356 aa24.21■■□□□ 1.47
NELFE-208ENST00000481121 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa24.21■■□□□ 1.47
NELFE-208ENST00000481121 FGD4Q96M96 766 aa24.21■■□□□ 1.47
NELFE-208ENST00000481121 CNPY2Q9Y2B0 182 aa24.21■■□□□ 1.47
NELFE-208ENST00000481121 SEPT4O43236 478 aa24.2■■□□□ 1.47
NELFE-208ENST00000481121 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa24.2■■□□□ 1.47
NELFE-208ENST00000481121 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.47
NELFE-208ENST00000481121 MYL10Q9BUA6 226 aa24.2■■□□□ 1.47
NELFE-208ENST00000481121 ABCB11O95342 1321 aa24.2■■□□□ 1.46
NELFE-208ENST00000481121 PTPDC1A2A3K4 754 aa24.2■■□□□ 1.46
NELFE-208ENST00000481121 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
NELFE-208ENST00000481121 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
NELFE-208ENST00000481121 KIF5BP33176 963 aa24.2■■□□□ 1.46
NELFE-208ENST00000481121 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
NELFE-208ENST00000481121 FBXO11Q86XK2 927 aa24.2■■□□□ 1.46
NELFE-208ENST00000481121 CLEC4DQ8WXI8 215 aa24.2■■□□□ 1.46
NELFE-208ENST00000481121 KCNB2Q92953 911 aa24.2■■□□□ 1.46
NELFE-208ENST00000481121 MAP3K14Q99558 947 aa24.2■■□□□ 1.46
NELFE-208ENST00000481121 TCEANC2Q96MN5 208 aa24.19■■□□□ 1.46
NELFE-208ENST00000481121 SNX14Q9Y5W7 946 aa24.19■■□□□ 1.46
NELFE-208ENST00000481121 SLC12A7Q9Y666 1083 aa24.19■■□□□ 1.46
NELFE-208ENST00000481121 SOWAHBA6NEL2 793 aa24.18■■□□□ 1.46
NELFE-208ENST00000481121 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
NELFE-208ENST00000481121 SLC30A10Q6XR72 485 aa24.18■■□□□ 1.46
NELFE-208ENST00000481121 RNF207Q6ZRF8 634 aa24.18■■□□□ 1.46
NELFE-208ENST00000481121 ARMCX2Q7L311 632 aa24.18■■□□□ 1.46
NELFE-208ENST00000481121 HOMER1Q86YM7 354 aa24.18■■□□□ 1.46
NELFE-208ENST00000481121 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
NELFE-208ENST00000481121 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
NELFE-208ENST00000481121 ZBTB5O15062 677 aa24.17■■□□□ 1.46
NELFE-208ENST00000481121 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
NELFE-208ENST00000481121 CALM1P0DP23 149 aa24.17■■□□□ 1.46
NELFE-208ENST00000481121 CALM2P0DP24 149 aa24.17■■□□□ 1.46
NELFE-208ENST00000481121 CALM3P0DP25 149 aa24.17■■□□□ 1.46
NELFE-208ENST00000481121 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
NELFE-208ENST00000481121 ANO1Q5XXA6 986 aa24.17■■□□□ 1.46
NELFE-208ENST00000481121 SGMS1Q86VZ5 419 aa24.17■■□□□ 1.46
NELFE-208ENST00000481121 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa24.17■■□□□ 1.46
NELFE-208ENST00000481121 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
NELFE-208ENST00000481121 MTMR8Q96EF0 704 aa24.17■■□□□ 1.46
NELFE-208ENST00000481121 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
NELFE-208ENST00000481121 AMNQ9BXJ7 453 aa24.17■■□□□ 1.46
NELFE-208ENST00000481121 RIOX1Q9H6W3 641 aa24.17■■□□□ 1.46
NELFE-208ENST00000481121 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
NELFE-208ENST00000481121 DNAH12Q6ZR08 3092 aa24.17■■□□□ 1.46
NELFE-208ENST00000481121 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
NELFE-208ENST00000481121 RXRAP19793 462 aa24.16■■□□□ 1.46
NELFE-208ENST00000481121 CALML3P27482 149 aa24.16■■□□□ 1.46
NELFE-208ENST00000481121 NECAB2Q7Z6G3 386 aa24.16■■□□□ 1.46
NELFE-208ENST00000481121 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
NELFE-208ENST00000481121 ASTN1O14525 1302 aa24.16■■□□□ 1.46
NELFE-208ENST00000481121 ASB14A6NK59 587 aa24.15■■□□□ 1.46
NELFE-208ENST00000481121 CYTH3O43739 400 aa24.15■■□□□ 1.46
NELFE-208ENST00000481121 AKR1A1P14550 325 aa24.15■■□□□ 1.46
NELFE-208ENST00000481121 SLC35G1Q2M3R5 365 aa24.15■■□□□ 1.46
NELFE-208ENST00000481121 MICU3Q86XE3 530 aa24.15■■□□□ 1.46
NELFE-208ENST00000481121 PIGSQ96S52 555 aa24.15■■□□□ 1.46
NELFE-208ENST00000481121 HTATIP2Q9BUP3 242 aa24.15■■□□□ 1.46
NELFE-208ENST00000481121 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa24.15■■□□□ 1.46
NELFE-208ENST00000481121 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
NELFE-208ENST00000481121 RPS6P62753 249 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
NELFE-208ENST00000481121 FGD1P98174 961 aa24.15■■□□□ 1.46
NELFE-208ENST00000481121 ACVR2BQ13705 512 aa24.15■■□□□ 1.46
NELFE-208ENST00000481121 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa24.15■■□□□ 1.46
NELFE-208ENST00000481121 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa24.15■■□□□ 1.46
NELFE-208ENST00000481121 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa24.15■■□□□ 1.46
NELFE-208ENST00000481121 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
NELFE-208ENST00000481121 RARBP10826 455 aa24.14■■□□□ 1.45
NELFE-208ENST00000481121 GNAQP50148 359 aa24.14■■□□□ 1.45
NELFE-208ENST00000481121 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
NELFE-208ENST00000481121 APOA5Q6Q788 366 aa24.14■■□□□ 1.45
NELFE-208ENST00000481121 SPZ1Q9BXG8 430 aa24.14■■□□□ 1.45
NELFE-208ENST00000481121 USP26Q9BXU7 913 aa24.14■■□□□ 1.45
NELFE-208ENST00000481121 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
NELFE-208ENST00000481121 CPA1P15085 419 aa24.13■■□□□ 1.45
NELFE-208ENST00000481121 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
NELFE-208ENST00000481121 TRAF1Q13077 416 aa24.13■■□□□ 1.45
NELFE-208ENST00000481121 MCF2L2Q86YR7 1114 aa24.13■■□□□ 1.45
NELFE-208ENST00000481121 RGS22Q8NE09 1264 aa24.13■■□□□ 1.45
NELFE-208ENST00000481121 LZTS2Q9BRK4 669 aa24.13■■□□□ 1.45
NELFE-208ENST00000481121 MAF1Q9H063 256 aa24.13■■□□□ 1.45
NELFE-208ENST00000481121 C11orf49Q9H6J7 331 aa24.13■■□□□ 1.45
NELFE-208ENST00000481121 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa24.12■■□□□ 1.45
NELFE-208ENST00000481121 PLEKHA8P1O95397 391 aa24.12■■□□□ 1.45
NELFE-208ENST00000481121 PSMA5P28066 241 aa24.12■■□□□ 1.45
NELFE-208ENST00000481121 FAM184BQ9ULE4 1060 aa24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.1 ms