RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425753.6

TSTA3-201, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TSTA3, Length 1,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-201ENST00000425753 ACAD9Q9H845 621 aa23.56■■□□□ 1.36
TSTA3-201ENST00000425753 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa23.56■■□□□ 1.36
TSTA3-201ENST00000425753 ZNF236Q9UL36 1845 aa23.56■■□□□ 1.36
TSTA3-201ENST00000425753 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
TSTA3-201ENST00000425753 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa23.55■■□□□ 1.36
TSTA3-201ENST00000425753 STRNO43815 780 aa23.55■■□□□ 1.36
TSTA3-201ENST00000425753 DEXIO95424 95 aa23.55■■□□□ 1.36
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TSTA3-201ENST00000425753 SOCS4Q8WXH5 440 aa23.53■■□□□ 1.36
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TSTA3-201ENST00000425753 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP23.52■■□□□ 1.36
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TSTA3-201ENST00000425753 HOXC6P09630 235 aa23.5■■□□□ 1.35
TSTA3-201ENST00000425753 IFFO2Q5TF58 517 aa23.5■■□□□ 1.35
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TSTA3-201ENST00000425753 HOXD10P28358 340 aa23.49■■□□□ 1.35
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TSTA3-201ENST00000425753 IRF5Q13568 498 aa23.48■■□□□ 1.35
TSTA3-201ENST00000425753 ZMYND12Q9H0C1 365 aa23.48■■□□□ 1.35
TSTA3-201ENST00000425753 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
TSTA3-201ENST00000425753 RPS6P62753 249 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
TSTA3-201ENST00000425753 NSMFQ6X4W1 530 aa23.47■■□□□ 1.35
TSTA3-201ENST00000425753 RNF207Q6ZRF8 634 aa23.47■■□□□ 1.35
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