RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423339.2

CCDC82-202, Transcript of coiled-coil domain containing 82, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC82, Length 1,878 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82-202ENST00000423339 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
CCDC82-202ENST00000423339 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
CCDC82-202ENST00000423339 SYT8Q8NBV8 401 aa4.71□□□□□ -1.66
CCDC82-202ENST00000423339 PRDM14Q9GZV8 571 aa4.71□□□□□ -1.66
CCDC82-202ENST00000423339 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
CCDC82-202ENST00000423339 TNFRSF1AP19438 455 aa4.7□□□□□ -1.66
CCDC82-202ENST00000423339 CASP7P55210 303 aa4.7□□□□□ -1.66
CCDC82-202ENST00000423339 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
CCDC82-202ENST00000423339 AUHQ13825 339 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
CCDC82-202ENST00000423339 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa4.7□□□□□ -1.66
CCDC82-202ENST00000423339 CCDC144BQ3MJ40 725 aa4.7□□□□□ -1.66
CCDC82-202ENST00000423339 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
CCDC82-202ENST00000423339 DCAF15Q66K64 600 aa4.7□□□□□ -1.66
CCDC82-202ENST00000423339 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
CCDC82-202ENST00000423339 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa4.7□□□□□ -1.66
CCDC82-202ENST00000423339 MKL1Q969V6 931 aa4.7□□□□□ -1.66
CCDC82-202ENST00000423339 SORCS2Q96PQ0 1159 aa4.7□□□□□ -1.66
CCDC82-202ENST00000423339 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
CCDC82-202ENST00000423339 OSBPL2Q9H1P3 480 aa4.7□□□□□ -1.66
CCDC82-202ENST00000423339 CRTAC1Q9NQ79 661 aa4.7□□□□□ -1.66
CCDC82-202ENST00000423339 SIRPGQ9P1W8 387 aa4.7□□□□□ -1.66
CCDC82-202ENST00000423339 FBXL21Q9UKT6 434 aa4.7□□□□□ -1.66
CCDC82-202ENST00000423339 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
CCDC82-202ENST00000423339 MINPP1Q9UNW1 487 aa4.7□□□□□ -1.66
CCDC82-202ENST00000423339 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
CCDC82-202ENST00000423339 KCNC1P48547 511 aa4.69□□□□□ -1.66
CCDC82-202ENST00000423339 HMGA2P52926 109 aa4.69□□□□□ -1.66
CCDC82-202ENST00000423339 RAB33AQ14088 237 aa4.69□□□□□ -1.66
CCDC82-202ENST00000423339 VMACQ2NL98 169 aa4.69□□□□□ -1.66
CCDC82-202ENST00000423339 UBXN11Q5T124 520 aa4.69□□□□□ -1.66
CCDC82-202ENST00000423339 SLC16A11Q8NCK7 471 aa4.69□□□□□ -1.66
CCDC82-202ENST00000423339 SLC12A7Q9Y666 1083 aa4.69□□□□□ -1.66
CCDC82-202ENST00000423339 PRAMEF1O95521 474 aa4.69□□□□□ -1.66
CCDC82-202ENST00000423339 EPHB3P54753 998 aa4.69□□□□□ -1.66
CCDC82-202ENST00000423339 CAP1Q01518 475 aa4.69□□□□□ -1.66
CCDC82-202ENST00000423339 GNPTABQ3T906 1256 aa4.69□□□□□ -1.66
CCDC82-202ENST00000423339 C7orf61Q8IZ16 206 aa4.69□□□□□ -1.66
CCDC82-202ENST00000423339 MZB1Q8WU39 189 aa4.69□□□□□ -1.66
CCDC82-202ENST00000423339 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
CCDC82-202ENST00000423339 HDAC8Q9BY41 377 aa4.69□□□□□ -1.66
CCDC82-202ENST00000423339 CNTD2Q9H8S5 307 aa4.69□□□□□ -1.66
CCDC82-202ENST00000423339 GFOD1Q9NXC2 390 aa4.69□□□□□ -1.66
CCDC82-202ENST00000423339 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa4.69□□□□□ -1.66
CCDC82-202ENST00000423339 MEIS1O00470 390 aa4.68□□□□□ -1.66
CCDC82-202ENST00000423339 SHOXO15266 292 aa4.68□□□□□ -1.66
CCDC82-202ENST00000423339 FSHBP01225 129 aa4.68□□□□□ -1.66
CCDC82-202ENST00000423339 TMEM62Q0P6H9 643 aa4.68□□□□□ -1.66
CCDC82-202ENST00000423339 FAM129CQ86XR2 697 aa4.68□□□□□ -1.66
CCDC82-202ENST00000423339 NLGN1Q8N2Q7 840 aa4.68□□□□□ -1.66
CCDC82-202ENST00000423339 SHISA4Q96DD7 197 aa4.68□□□□□ -1.66
CCDC82-202ENST00000423339 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
CCDC82-202ENST00000423339 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
CCDC82-202ENST00000423339 ACTR10Q9NZ32 417 aa4.68□□□□□ -1.66
CCDC82-202ENST00000423339 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
CCDC82-202ENST00000423339 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa4.68□□□□□ -1.66
CCDC82-202ENST00000423339 SIGLEC6O43699 453 aa4.67□□□□□ -1.66
CCDC82-202ENST00000423339 NFE2L2Q16236 605 aa4.67□□□□□ -1.66
CCDC82-202ENST00000423339 BBS9Q3SYG4 887 aa4.67□□□□□ -1.66
CCDC82-202ENST00000423339 NLRX1Q86UT6 975 aa4.67□□□□□ -1.66
CCDC82-202ENST00000423339 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
CCDC82-202ENST00000423339 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
CCDC82-202ENST00000423339 BRF1Q92994 677 aa4.67□□□□□ -1.66
CCDC82-202ENST00000423339 TCTN2Q96GX1 697 aa4.67□□□□□ -1.66
CCDC82-202ENST00000423339 TRIM55Q9BYV6 548 aa4.67□□□□□ -1.66
CCDC82-202ENST00000423339 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa4.67□□□□□ -1.66
CCDC82-202ENST00000423339 CHST7Q9NS84 486 aa4.67□□□□□ -1.66
CCDC82-202ENST00000423339 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa4.67□□□□□ -1.66
CCDC82-202ENST00000423339 CD247P20963 164 aa4.66□□□□□ -1.66
CCDC82-202ENST00000423339 VIPR1P32241 457 aa4.66□□□□□ -1.66
CCDC82-202ENST00000423339 YBX1P67809 324 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
CCDC82-202ENST00000423339 SLC7A5Q01650 507 aa4.66□□□□□ -1.66
CCDC82-202ENST00000423339 ANKRD39Q53RE8 183 aa4.66□□□□□ -1.66
CCDC82-202ENST00000423339 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
CCDC82-202ENST00000423339 KIAA1211LQ6NV74 962 aa4.66□□□□□ -1.66
CCDC82-202ENST00000423339 VHLLQ6RSH7 139 aa4.66□□□□□ -1.66
CCDC82-202ENST00000423339 LRP10Q7Z4F1 713 aa4.66□□□□□ -1.66
CCDC82-202ENST00000423339 USHBP1Q8N6Y0 703 aa4.66□□□□□ -1.66
CCDC82-202ENST00000423339 DAGLBQ8NCG7 672 aa4.66□□□□□ -1.66
CCDC82-202ENST00000423339 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
CCDC82-202ENST00000423339 KLHL6Q8WZ60 621 aa4.66□□□□□ -1.66
CCDC82-202ENST00000423339 PWWP2AQ96N64 755 aa4.66□□□□□ -1.66
CCDC82-202ENST00000423339 PIF1Q9H611 641 aa4.66□□□□□ -1.66
CCDC82-202ENST00000423339 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
CCDC82-202ENST00000423339 MATN3O15232 486 aa4.66□□□□□ -1.66
CCDC82-202ENST00000423339 CBFA2T2O43439 604 aa4.66□□□□□ -1.66
CCDC82-202ENST00000423339 ADAM17P78536 824 aa4.66□□□□□ -1.66
CCDC82-202ENST00000423339 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
CCDC82-202ENST00000423339 TMEFF1Q8IYR6 380 aa4.66□□□□□ -1.66
CCDC82-202ENST00000423339 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
CCDC82-202ENST00000423339 FGD4Q96M96 766 aa4.66□□□□□ -1.66
CCDC82-202ENST00000423339 HAUS7Q99871 368 aa4.66□□□□□ -1.66
CCDC82-202ENST00000423339 MENTQ9BUN1 341 aa4.66□□□□□ -1.66
CCDC82-202ENST00000423339 FOXP3Q9BZS1 431 aa4.66□□□□□ -1.66
CCDC82-202ENST00000423339 GP6Q9HCN6 339 aa4.66□□□□□ -1.66
CCDC82-202ENST00000423339 USP40Q9NVE5 1235 aa4.66□□□□□ -1.66
CCDC82-202ENST00000423339 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
CCDC82-202ENST00000423339 MSRB2Q9Y3D2 182 aa4.66□□□□□ -1.66
CCDC82-202ENST00000423339 CADPSQ9ULU8 1353 aa4.65□□□□□ -1.66
CCDC82-202ENST00000423339 GDF5P43026 501 aa4.65□□□□□ -1.66
CCDC82-202ENST00000423339 CTSKP43235 329 aa4.65□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.2 ms