RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368547.3

ECHS1-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase, short chain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHS1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1-201ENST00000368547 RIOX2Q8IUF8 465 aa34.08■■■■□ 3.05
ECHS1-201ENST00000368547 ALG1Q9BT22 464 aa34.08■■■■□ 3.05
ECHS1-201ENST00000368547 HOMER2Q9NSB8 354 aa34.08■■■■□ 3.05
ECHS1-201ENST00000368547 BARHL2Q9NY43 387 aa34.08■■■■□ 3.05
ECHS1-201ENST00000368547 hCG_1984214I3L0E3 225 aa34.06■■■■□ 3.04
ECHS1-201ENST00000368547 STXBP3O00186 592 aa34.06■■■■□ 3.04
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP34.06■■■■□ 3.04
ECHS1-201ENST00000368547 VPS54Q9P1Q0 977 aa34.06■■■■□ 3.04
ECHS1-201ENST00000368547 ABCB11O95342 1321 aa34.06■■■■□ 3.04
ECHS1-201ENST00000368547 TYW1BQ6NUM6 668 aa34.05■■■■□ 3.04
ECHS1-201ENST00000368547 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP34.04■■■■□ 3.04
ECHS1-201ENST00000368547 NAPAP54920 295 aa34.04■■■■□ 3.04
ECHS1-201ENST00000368547 CCNA1P78396 465 aa34.04■■■■□ 3.04
ECHS1-201ENST00000368547 TRERF1Q96PN7 1200 aa34.04■■■■□ 3.04
ECHS1-201ENST00000368547 BEGAINQ9BUH8 593 aa34.04■■■■□ 3.04
ECHS1-201ENST00000368547 RNF146Q9NTX7 359 aa34.04■■■■□ 3.04
ECHS1-201ENST00000368547 SAGE1Q9NXZ1 904 aa34.04■■■■□ 3.04
ECHS1-201ENST00000368547 KIF3AQ9Y496 699 aa34.04■■■■□ 3.04
ECHS1-201ENST00000368547 NCAPG2Q86XI2 1143 aa34.04■■■■□ 3.04
ECHS1-201ENST00000368547 SHISA4Q96DD7 197 aa34.04■■■■□ 3.04
ECHS1-201ENST00000368547 PORCNQ9H237 461 aa34.04■■■■□ 3.04
ECHS1-201ENST00000368547 GJB4Q9NTQ9 266 aa34.04■■■■□ 3.04
ECHS1-201ENST00000368547 SLC25A27O95847 323 aa34.03■■■■□ 3.04
ECHS1-201ENST00000368547 ERCC3P19447 782 aa34.03■■■■□ 3.04
ECHS1-201ENST00000368547 FOSBP53539 338 aa34.03■■■■□ 3.04
ECHS1-201ENST00000368547 TKFCQ3LXA3 575 aa34.03■■■■□ 3.04
ECHS1-201ENST00000368547 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP34.03■■■■□ 3.04
ECHS1-201ENST00000368547 MUM1L1Q5H9M0 696 aa34.02■■■■□ 3.04
ECHS1-201ENST00000368547 SH3GLB2Q9NR46 395 aa34.02■■■■□ 3.04
ECHS1-201ENST00000368547 SHCBP1Q8NEM2 672 aa34.01■■■■□ 3.04
ECHS1-201ENST00000368547 CLEC4DQ8WXI8 215 aa34.01■■■■□ 3.04
ECHS1-201ENST00000368547 WBP1LQ9NX94 342 aa34.01■■■■□ 3.04
ECHS1-201ENST00000368547 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP34.01■■■■□ 3.03
ECHS1-201ENST00000368547 XBP1P17861 261 aa34.01■■■■□ 3.03
ECHS1-201ENST00000368547 COPB2P35606 906 aa34.01■■■■□ 3.03
ECHS1-201ENST00000368547 PPP1R18Q6NYC8 613 aa34.01■■■■□ 3.03
ECHS1-201ENST00000368547 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP34.01■■■■□ 3.03
ECHS1-201ENST00000368547 EFCC1Q9HA90 598 aa34.01■■■■□ 3.03
ECHS1-201ENST00000368547 NFIBO00712 420 aa34■■■■□ 3.03
ECHS1-201ENST00000368547 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP34■■■■□ 3.03
ECHS1-201ENST00000368547 CHST13Q8NET6 341 aa34■■■■□ 3.03
ECHS1-201ENST00000368547 CCDC148Q8NFR7 591 aa34■■■■□ 3.03
ECHS1-201ENST00000368547 C8orf76Q96K31 380 aa34■■■■□ 3.03
ECHS1-201ENST00000368547 MROH8Q9H579 483 aa34■■■■□ 3.03
ECHS1-201ENST00000368547 ACAD9Q9H845 621 aa34■■■■□ 3.03
ECHS1-201ENST00000368547 OPLAHO14841 1288 aa33.99■■■■□ 3.03
ECHS1-201ENST00000368547 WDR78Q5VTH9 848 aa33.99■■■■□ 3.03
ECHS1-201ENST00000368547 FBXO40Q9UH90 709 aa33.98■■■■□ 3.03
ECHS1-201ENST00000368547 KCNJ14Q9UNX9 436 aa33.98■■■■□ 3.03
ECHS1-201ENST00000368547 SMCO2A6NFE2 343 aa33.97■■■■□ 3.03
ECHS1-201ENST00000368547 TRIM29Q14134 588 aa33.97■■■■□ 3.03
ECHS1-201ENST00000368547 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP33.97■■■■□ 3.03
ECHS1-201ENST00000368547 NLRP5P59047 1200 aa33.97■■■■□ 3.03
ECHS1-201ENST00000368547 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP33.97■■■■□ 3.03
ECHS1-201ENST00000368547 ZMYND12Q9H0C1 365 aa33.97■■■■□ 3.03
ECHS1-201ENST00000368547 PSTPIP2Q9H939 334 aa33.97■■■■□ 3.03
ECHS1-201ENST00000368547 TSKSQ9UJT2 592 aa33.97■■■■□ 3.03
ECHS1-201ENST00000368547 PLXNB2O15031 1838 aa33.96■■■■□ 3.03
ECHS1-201ENST00000368547 MGAMO43451 1857 aa33.96■■■■□ 3.03
ECHS1-201ENST00000368547 PDCP20941 246 aa33.96■■■■□ 3.03
ECHS1-201ENST00000368547 MAPK4P31152 587 aa33.96■■■■□ 3.03
ECHS1-201ENST00000368547 GUCY1B3Q02153 619 aa33.96■■■■□ 3.03
ECHS1-201ENST00000368547 KRT40Q6A162 431 aa33.96■■■■□ 3.03
ECHS1-201ENST00000368547 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP33.96■■■■□ 3.03
ECHS1-201ENST00000368547 JMYQ8N9B5 988 aa33.96■■■■□ 3.03
ECHS1-201ENST00000368547 TBC1D5Q92609 795 aa33.96■■■■□ 3.03
ECHS1-201ENST00000368547 PHF20Q9BVI0 1012 aa33.96■■■■□ 3.03
ECHS1-201ENST00000368547 ESYT2A0FGR8 921 aa33.95■■■■□ 3.03
ECHS1-201ENST00000368547 GPR25O00155 361 aa33.95■■■■□ 3.03
ECHS1-201ENST00000368547 BRD1O95696 1058 aa33.95■■■■□ 3.03
ECHS1-201ENST00000368547 SP3Q02447 781 aa33.95■■■■□ 3.03
ECHS1-201ENST00000368547 CFBP00751 764 aa33.94■■■■□ 3.02
ECHS1-201ENST00000368547 ADCY7P51828 1080 aa33.94■■■■□ 3.02
ECHS1-201ENST00000368547 NSMFQ6X4W1 530 aa33.94■■■■□ 3.02
ECHS1-201ENST00000368547 MCF2L2Q86YR7 1114 aa33.94■■■■□ 3.02
ECHS1-201ENST00000368547 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa33.94■■■■□ 3.02
ECHS1-201ENST00000368547 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP33.94■■■■□ 3.02
ECHS1-201ENST00000368547 CUL5Q93034 780 aa33.94■■■■□ 3.02
ECHS1-201ENST00000368547 C6orf50Q9HD87 102 aa33.94■■■■□ 3.02
ECHS1-201ENST00000368547 RIC8AQ9NPQ8 531 aa33.94■■■■□ 3.02
ECHS1-201ENST00000368547 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa33.94■■■■□ 3.02
ECHS1-201ENST00000368547 PKP1Q13835 747 aa33.93■■■■□ 3.02
ECHS1-201ENST00000368547 CLEC17AQ6ZS10 378 aa33.93■■■■□ 3.02
ECHS1-201ENST00000368547 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP33.93■■■■□ 3.02
ECHS1-201ENST00000368547 GNA11P29992 359 aa33.93■■■■□ 3.02
ECHS1-201ENST00000368547 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP33.93■■■■□ 3.02
ECHS1-201ENST00000368547 GPR142Q7Z601 462 aa33.93■■■■□ 3.02
ECHS1-201ENST00000368547 ANKRD35Q8N283 1001 aa33.93■■■■□ 3.02
ECHS1-201ENST00000368547 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP33.92■■■■□ 3.02
ECHS1-201ENST00000368547 SYT1P21579 422 aa33.92■■■■□ 3.02
ECHS1-201ENST00000368547 CALML3P27482 149 aa33.92■■■■□ 3.02
ECHS1-201ENST00000368547 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP33.92■■■■□ 3.02
ECHS1-201ENST00000368547 RGS22Q8NE09 1264 aa33.92■■■■□ 3.02
ECHS1-201ENST00000368547 ZDHHC9Q9Y397 364 aa33.92■■■■□ 3.02
ECHS1-201ENST00000368547 ADAMTS3O15072 1205 aa33.91■■■■□ 3.02
ECHS1-201ENST00000368547 MMP1P03956 469 aa33.91■■■■□ 3.02
ECHS1-201ENST00000368547 FCER1AP12319 257 aa33.91■■■■□ 3.02
ECHS1-201ENST00000368547 NPY5RQ15761 445 aa33.91■■■■□ 3.02
ECHS1-201ENST00000368547 USP17L6PQ6QN14 398 aa33.91■■■■□ 3.02
ECHS1-201ENST00000368547 RNF207Q6ZRF8 634 aa33.91■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51 ms