RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000360046.9

HOXA4-201, Transcript of homeobox A4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXA4, Length 1,747 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4-201ENST00000360046 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa25.06■■□□□ 1.6
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HOXA4-201ENST00000360046 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
HOXA4-201ENST00000360046 GRM1Q13255 1194 aa25.06■■□□□ 1.6
HOXA4-201ENST00000360046 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
HOXA4-201ENST00000360046 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa25.06■■□□□ 1.6
HOXA4-201ENST00000360046 MS4A4AQ96JQ5 239 aa25.06■■□□□ 1.6
HOXA4-201ENST00000360046 AGBL1Q96MI9 1066 aa25.06■■□□□ 1.6
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HOXA4-201ENST00000360046 MYPNQ86TC9 1320 aa25.05■■□□□ 1.6
HOXA4-201ENST00000360046 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa25.05■■□□□ 1.6
HOXA4-201ENST00000360046 M0R2N6 131 aa25.05■■□□□ 1.6
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HOXA4-201ENST00000360046 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
HOXA4-201ENST00000360046 USP28Q96RU2 1077 aa25.05■■□□□ 1.6
HOXA4-201ENST00000360046 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP25.05■■□□□ 1.6
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HOXA4-201ENST00000360046 ABCB11O95342 1321 aa25.04■■□□□ 1.6
HOXA4-201ENST00000360046 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
HOXA4-201ENST00000360046 DDX11L8A8MPP1 907 aa25.04■■□□□ 1.6
HOXA4-201ENST00000360046 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP25.04■■□□□ 1.6
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HOXA4-201ENST00000360046 GLT8D2Q9H1C3 349 aa25.04■■□□□ 1.6
HOXA4-201ENST00000360046 UBE2SQ16763 222 aa25.03■■□□□ 1.6
HOXA4-201ENST00000360046 RILPL1Q5EBL4 403 aa25.03■■□□□ 1.6
HOXA4-201ENST00000360046 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa25.03■■□□□ 1.6
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HOXA4-201ENST00000360046 CCDC102AQ96A19 550 aa25.03■■□□□ 1.6
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HOXA4-201ENST00000360046 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa25.03■■□□□ 1.6
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HOXA4-201ENST00000360046 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
HOXA4-201ENST00000360046 PNMA2Q9UL42 364 aa25.02■■□□□ 1.6
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HOXA4-201ENST00000360046 C1QTNF8P60827 252 aa25.01■■□□□ 1.59
HOXA4-201ENST00000360046 USP17L6PQ6QN14 398 aa25.01■■□□□ 1.59
HOXA4-201ENST00000360046 HOMER2Q9NSB8 354 aa25.01■■□□□ 1.59
HOXA4-201ENST00000360046 CLIC4Q9Y696 253 aa25.01■■□□□ 1.59
HOXA4-201ENST00000360046 BTBD19C9JJ37 291 aa25■■□□□ 1.59
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HOXA4-201ENST00000360046 REPS2Q8NFH8 660 aa25■■□□□ 1.59
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HOXA4-201ENST00000360046 A0A0G2JMZ2 1700 aa25■■□□□ 1.59
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HOXA4-201ENST00000360046 TMEM132BQ14DG7 1078 aa25■■□□□ 1.59
HOXA4-201ENST00000360046 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP25■■□□□ 1.59
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HOXA4-201ENST00000360046 POLR3EQ9NVU0 708 aa25■■□□□ 1.59
HOXA4-201ENST00000360046 RTEL1Q9NZ71 1219 aa25■■□□□ 1.59
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HOXA4-201ENST00000360046 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
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HOXA4-201ENST00000360046 HERVK_113P62684 666 aa24.98■■□□□ 1.59
HOXA4-201ENST00000360046 STK38Q15208 465 aa24.98■■□□□ 1.59
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HOXA4-201ENST00000360046 PNMA3Q9UL41 463 aa24.98■■□□□ 1.59
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HOXA4-201ENST00000360046 NASPP49321 788 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
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HOXA4-201ENST00000360046 TRERF1Q96PN7 1200 aa24.97■■□□□ 1.59
HOXA4-201ENST00000360046 LMBRD1Q9NUN5 540 aa24.97■■□□□ 1.59
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