RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 IGSF22Q8N9C0 903 aa5.38□□□□□ -1.55
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PTPRD-201ENST00000355233 STOML1Q9UBI4 398 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 RPS6KA1Q15418 735 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 ATG16L1Q676U5 607 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
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PTPRD-201ENST00000355233 STAG1Q8WVM7 1258 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 PPP1R14BQ96C90 147 aa5.38□□□□□ -1.55
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PTPRD-201ENST00000355233 CASP14P31944 242 aa5.38□□□□□ -1.55
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PTPRD-201ENST00000355233 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP5.37□□□□□ -1.55
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PTPRD-201ENST00000355233 CCPG1Q9ULG6 757 aa5.37□□□□□ -1.55
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