RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000342018.12

GTF3C5-201, Transcript of general transcription factor IIIC subunit 5, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene GTF3C5, Length 1,905 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C5-201ENST00000342018 HOMER2Q9NSB8 354 aa22.16■■□□□ 1.14
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GTF3C5-201ENST00000342018 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa22.16■■□□□ 1.14
GTF3C5-201ENST00000342018 SMCHD1A6NHR9 2005 aa22.16■■□□□ 1.14
GTF3C5-201ENST00000342018 TMEM88BA6NKF7 163 aa22.16■■□□□ 1.14
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GTF3C5-201ENST00000342018 GRM1Q13255 1194 aa22.14■■□□□ 1.14
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GTF3C5-201ENST00000342018 PGBD1Q96JS3 809 aa22.14■■□□□ 1.14
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GTF3C5-201ENST00000342018 ABCB11O95342 1321 aa22.14■■□□□ 1.13
GTF3C5-201ENST00000342018 MYPNQ86TC9 1320 aa22.14■■□□□ 1.13
GTF3C5-201ENST00000342018 MYH15Q9Y2K3 1946 aa22.13■■□□□ 1.13
GTF3C5-201ENST00000342018 GOLGA6L22H0YM25 854 aa22.13■■□□□ 1.13
GTF3C5-201ENST00000342018 FSTL1Q12841 308 aa22.13■■□□□ 1.13
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GTF3C5-201ENST00000342018 REPS2Q8NFH8 660 aa22.13■■□□□ 1.13
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GTF3C5-201ENST00000342018 CLIC4Q9Y696 253 aa22.13■■□□□ 1.13
GTF3C5-201ENST00000342018 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
GTF3C5-201ENST00000342018 BTBD19C9JJ37 291 aa22.12■■□□□ 1.13
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GTF3C5-201ENST00000342018 HERVK_113P62684 666 aa22.12■■□□□ 1.13
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GTF3C5-201ENST00000342018 CYP2C8P10632 490 aa22.12■■□□□ 1.13
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GTF3C5-201ENST00000342018 TBC1D5Q92609 795 aa22.12■■□□□ 1.13
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GTF3C5-201ENST00000342018 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
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GTF3C5-201ENST00000342018 GLT8D2Q9H1C3 349 aa22.11■■□□□ 1.13
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GTF3C5-201ENST00000342018 RIPK3Q9Y572 518 aa22.11■■□□□ 1.13
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GTF3C5-201ENST00000342018 MUM1L1Q5H9M0 696 aa22.1■■□□□ 1.13
GTF3C5-201ENST00000342018 POTEEQ6S8J3 1075 aa22.1■■□□□ 1.13
GTF3C5-201ENST00000342018 LBX2Q6XYB7 198 aa22.1■■□□□ 1.13
GTF3C5-201ENST00000342018 FAM43AQ8N2R8 423 aa22.1■■□□□ 1.13
GTF3C5-201ENST00000342018 TRERF1Q96PN7 1200 aa22.1■■□□□ 1.13
GTF3C5-201ENST00000342018 BTBD7Q9P203 1132 aa22.1■■□□□ 1.13
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GTF3C5-201ENST00000342018 SLC10A3P09131 477 aa22.1■■□□□ 1.13
GTF3C5-201ENST00000342018 STAT3P40763 770 aa22.1■■□□□ 1.13
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GTF3C5-201ENST00000342018 TEX13BQ9BXU2 312 aa22.1■■□□□ 1.13
GTF3C5-201ENST00000342018 PNMA3Q9UL41 463 aa22.1■■□□□ 1.13
GTF3C5-201ENST00000342018 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa22.1■■□□□ 1.13
GTF3C5-201ENST00000342018 CLK2P49760 499 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
GTF3C5-201ENST00000342018 OAZ1P54368 228 aa22.09■■□□□ 1.13
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GTF3C5-201ENST00000342018 FCHSD1Q86WN1 690 aa22.09■■□□□ 1.13
GTF3C5-201ENST00000342018 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
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GTF3C5-201ENST00000342018 POLR2MP0CAP2 368 aa22.08■■□□□ 1.13
GTF3C5-201ENST00000342018 STK38Q15208 465 aa22.08■■□□□ 1.13
GTF3C5-201ENST00000342018 ANKRD23Q86SG2 305 aa22.08■■□□□ 1.13
GTF3C5-201ENST00000342018 MB21D1Q8N884 522 aa22.08■■□□□ 1.13
GTF3C5-201ENST00000342018 TBCKQ8TEA7 893 aa22.08■■□□□ 1.13
GTF3C5-201ENST00000342018 CLEC4DQ8WXI8 215 aa22.08■■□□□ 1.13
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GTF3C5-201ENST00000342018 DDX11L8A8MPP1 907 aa22.08■■□□□ 1.12
GTF3C5-201ENST00000342018 ZNF174Q15697 407 aa22.08■■□□□ 1.12
GTF3C5-201ENST00000342018 TTC38Q5R3I4 469 aa22.08■■□□□ 1.12
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