RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000005558.8

IFRD1-201, Transcript of interferon related developmental regulator 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene IFRD1, Length 1,834 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFRD1-201ENST00000005558 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa21.87■■□□□ 1.09
IFRD1-201ENST00000005558 PSTPIP2Q9H939 334 aa21.87■■□□□ 1.09
IFRD1-201ENST00000005558 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa21.87■■□□□ 1.09
IFRD1-201ENST00000005558 KCNH4Q9UQ05 1017 aa21.87■■□□□ 1.09
IFRD1-201ENST00000005558 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
IFRD1-201ENST00000005558 ZNF174Q15697 407 aa21.87■■□□□ 1.09
IFRD1-201ENST00000005558 INF2Q27J81 1249 aa21.87■■□□□ 1.09
IFRD1-201ENST00000005558 TTC38Q5R3I4 469 aa21.87■■□□□ 1.09
IFRD1-201ENST00000005558 TREML2Q5T2D2 321 aa21.87■■□□□ 1.09
IFRD1-201ENST00000005558 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
IFRD1-201ENST00000005558 TBC1D5Q92609 795 aa21.87■■□□□ 1.09
IFRD1-201ENST00000005558 OTUD5Q96G74 571 aa21.87■■□□□ 1.09
IFRD1-201ENST00000005558 AGBL1Q96MI9 1066 aa21.87■■□□□ 1.09
IFRD1-201ENST00000005558 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
IFRD1-201ENST00000005558 PPP6R2O75170 966 aa21.86■■□□□ 1.09
IFRD1-201ENST00000005558 FLOT1O75955 427 aa21.86■■□□□ 1.09
IFRD1-201ENST00000005558 TRAPPC10P48553 1259 aa21.86■■□□□ 1.09
IFRD1-201ENST00000005558 CST9Q5W186 159 aa21.86■■□□□ 1.09
IFRD1-201ENST00000005558 ARMC9Q7Z3E5 817 aa21.86■■□□□ 1.09
IFRD1-201ENST00000005558 KCNG4Q8TDN1 519 aa21.86■■□□□ 1.09
IFRD1-201ENST00000005558 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
IFRD1-201ENST00000005558 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
IFRD1-201ENST00000005558 ADALQ6DHV7 355 aa21.85■■□□□ 1.09
IFRD1-201ENST00000005558 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
IFRD1-201ENST00000005558 KRT25Q7Z3Z0 450 aa21.85■■□□□ 1.09
IFRD1-201ENST00000005558 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
IFRD1-201ENST00000005558 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
IFRD1-201ENST00000005558 CUL5Q93034 780 aa21.85■■□□□ 1.09
IFRD1-201ENST00000005558 ATG4CQ96DT6 458 aa21.85■■□□□ 1.09
IFRD1-201ENST00000005558 MBD3O95983 291 aa21.85■■□□□ 1.09
IFRD1-201ENST00000005558 PPIL2Q13356 520 aa21.85■■□□□ 1.09
IFRD1-201ENST00000005558 BICD2Q8TD16 824 aa21.85■■□□□ 1.09
IFRD1-201ENST00000005558 OPTNQ96CV9 577 aa21.85■■□□□ 1.09
IFRD1-201ENST00000005558 CLIC6Q96NY7 704 aa21.85■■□□□ 1.09
IFRD1-201ENST00000005558 ZNF408Q9H9D4 720 aa21.85■■□□□ 1.09
IFRD1-201ENST00000005558 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa21.84■■□□□ 1.09
IFRD1-201ENST00000005558 VWA5AO00534 786 aa21.84■■□□□ 1.09
IFRD1-201ENST00000005558 ICAM1P05362 532 aa21.84■■□□□ 1.09
IFRD1-201ENST00000005558 DSG3P32926 999 aa21.84■■□□□ 1.09
IFRD1-201ENST00000005558 ME1P48163 572 aa21.84■■□□□ 1.09
IFRD1-201ENST00000005558 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
IFRD1-201ENST00000005558 IL17AQ16552 155 aa21.84■■□□□ 1.09
IFRD1-201ENST00000005558 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
IFRD1-201ENST00000005558 ENGASEQ8NFI3 743 aa21.84■■□□□ 1.09
IFRD1-201ENST00000005558 CRYGNQ8WXF5 182 aa21.84■■□□□ 1.09
IFRD1-201ENST00000005558 TRPM7Q96QT4 1865 aa21.83■■□□□ 1.09
IFRD1-201ENST00000005558 A0A0G2JMZ2 1700 aa21.83■■□□□ 1.09
IFRD1-201ENST00000005558 CXCL11O14625 94 aa21.83■■□□□ 1.09
IFRD1-201ENST00000005558 PTPREP23469 700 aa21.83■■□□□ 1.09
IFRD1-201ENST00000005558 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP21.83■■□□□ 1.09
IFRD1-201ENST00000005558 SHC4Q6S5L8 630 aa21.83■■□□□ 1.09
IFRD1-201ENST00000005558 TBCKQ8TEA7 893 aa21.83■■□□□ 1.09
IFRD1-201ENST00000005558 CLEC4DQ8WXI8 215 aa21.83■■□□□ 1.09
IFRD1-201ENST00000005558 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
IFRD1-201ENST00000005558 A0A1W2PQ27 194 aa21.83■■□□□ 1.08
IFRD1-201ENST00000005558 A0A1W2PQ64 194 aa21.83■■□□□ 1.08
IFRD1-201ENST00000005558 A0A1W2PQD8 194 aa21.83■■□□□ 1.08
IFRD1-201ENST00000005558 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
IFRD1-201ENST00000005558 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
IFRD1-201ENST00000005558 TMOD4Q9NZQ9 345 aa21.83■■□□□ 1.08
IFRD1-201ENST00000005558 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
IFRD1-201ENST00000005558 DCAF8L1A6NGE4 600 aa21.82■■□□□ 1.08
IFRD1-201ENST00000005558 PIK3CDO00329 1044 aa21.82■■□□□ 1.08
IFRD1-201ENST00000005558 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
IFRD1-201ENST00000005558 PTGDRQ13258 359 aa21.82■■□□□ 1.08
IFRD1-201ENST00000005558 COG2Q14746 738 aa21.82■■□□□ 1.08
IFRD1-201ENST00000005558 TMEM60Q9H2L4 133 aa21.82■■□□□ 1.08
IFRD1-201ENST00000005558 UNCXA6NJT0 531 aa21.81■■□□□ 1.08
IFRD1-201ENST00000005558 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
IFRD1-201ENST00000005558 NR1I2O75469 434 aa21.81■■□□□ 1.08
IFRD1-201ENST00000005558 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
IFRD1-201ENST00000005558 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
IFRD1-201ENST00000005558 RIPK3Q9Y572 518 aa21.81■■□□□ 1.08
IFRD1-201ENST00000005558 CELF2O95319 508 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
IFRD1-201ENST00000005558 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
IFRD1-201ENST00000005558 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
IFRD1-201ENST00000005558 MCM7P33993 719 aa21.8■■□□□ 1.08
IFRD1-201ENST00000005558 GPAT2Q6NUI2 795 aa21.8■■□□□ 1.08
IFRD1-201ENST00000005558 CHADLQ6NUI6 762 aa21.8■■□□□ 1.08
IFRD1-201ENST00000005558 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
IFRD1-201ENST00000005558 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
IFRD1-201ENST00000005558 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa21.8■■□□□ 1.08
IFRD1-201ENST00000005558 FKBP1BP68106 108 aa21.8■■□□□ 1.08
IFRD1-201ENST00000005558 TMEM132BQ14DG7 1078 aa21.8■■□□□ 1.08
IFRD1-201ENST00000005558 MUM1L1Q5H9M0 696 aa21.8■■□□□ 1.08
IFRD1-201ENST00000005558 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
IFRD1-201ENST00000005558 CCPG1Q9ULG6 757 aa21.8■■□□□ 1.08
IFRD1-201ENST00000005558 ABCB11O95342 1321 aa21.79■■□□□ 1.08
IFRD1-201ENST00000005558 PEX10O60683 326 aa21.79■■□□□ 1.08
IFRD1-201ENST00000005558 CMA1P23946 247 aa21.79■■□□□ 1.08
IFRD1-201ENST00000005558 GHRHRQ02643 423 aa21.79■■□□□ 1.08
IFRD1-201ENST00000005558 NEK8Q86SG6 692 aa21.79■■□□□ 1.08
IFRD1-201ENST00000005558 CPXCR1Q8N123 301 aa21.79■■□□□ 1.08
IFRD1-201ENST00000005558 GLT8D2Q9H1C3 349 aa21.79■■□□□ 1.08
IFRD1-201ENST00000005558 HPSEQ9Y251 543 aa21.79■■□□□ 1.08
IFRD1-201ENST00000005558 A0A1B0GVL5 298 aa21.78■■□□□ 1.08
IFRD1-201ENST00000005558 NFIBO00712 420 aa21.78■■□□□ 1.08
IFRD1-201ENST00000005558 CUTAO60888 179 aa21.78■■□□□ 1.08
IFRD1-201ENST00000005558 RESP18Q5W5W9 173 aa21.78■■□□□ 1.08
IFRD1-201ENST00000005558 USP49Q70CQ1 688 aa21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.4 ms