RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000189207.1

Gm28254-201, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Gm28254, Length 2,166 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Pglyrp2Q8VCS0 530 aa9.01□□□□□ -0.97
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Satb2Q8VI24 733 aa9.01□□□□□ -0.97
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Smap1Q91VZ6 440 aa9.01□□□□□ -0.97
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Xrcc4Q924T3 326 aa9.01□□□□□ -0.97
Gm28254-201ENSMUST00000189207 KarsQ99MN1 595 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
Gm28254-201ENSMUST00000189207 D830030K20RikE9PYQ5 218 aa9□□□□□ -0.97
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Gm6583E9Q8Z1 469 aa9□□□□□ -0.97
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Gm3043K7N693 218 aa9□□□□□ -0.97
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Gm16440K7N6G6 218 aa9□□□□□ -0.97
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Gm2244L7N2A3 218 aa9□□□□□ -0.97
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Gm3278L7N2D2 218 aa9□□□□□ -0.97
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Gm8271L7N2E2 218 aa9□□□□□ -0.97
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Cdk2ap1O35207 114 aa9□□□□□ -0.97
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Per1O35973 1291 aa9□□□□□ -0.97
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Klc1O88447 541 aa9□□□□□ -0.97
Gm28254-201ENSMUST00000189207 CfhP06909 1234 aa9□□□□□ -0.97
Gm28254-201ENSMUST00000189207 PahP16331 453 aa9□□□□□ -0.97
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Mtx1P47802 317 aa9□□□□□ -0.97
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Kifap3P70188 793 aa9□□□□□ -0.97
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Zfp607aQ3TQG9 686 aa9□□□□□ -0.97
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Hace1Q3U0D9 909 aa9□□□□□ -0.97
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Dnajc8Q6NZB0 253 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
Gm28254-201ENSMUST00000189207 TxlnaQ6PAM1 554 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
Gm28254-201ENSMUST00000189207 DaglaQ6WQJ1 1044 aa9□□□□□ -0.97
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Trim6Q8BGE7 488 aa9□□□□□ -0.97
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Lonp1Q8CGK3 949 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Nat10Q8K224 1024 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
Gm28254-201ENSMUST00000189207 HnrnpuQ8VEK3 800 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Ccdc7Q9D541 371 aa9□□□□□ -0.97
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Rab11fip1Q9D620 645 aa9□□□□□ -0.97
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Mapk8ip1Q9WVI9 707 aa9□□□□□ -0.97
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Atp6v0a1Q9Z1G4 839 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Gfpt2Q9Z2Z9 682 aa9□□□□□ -0.97
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Syde2E9PUP1 1314 aa9□□□□□ -0.97
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Kndc1Q0KK55 1742 aa9□□□□□ -0.97
Gm28254-201ENSMUST00000189207 CtcflA2APF3 636 aa9□□□□□ -0.97
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Krt28A6BLY7 462 aa9□□□□□ -0.97
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Stim2P83093 746 aa9□□□□□ -0.97
Gm28254-201ENSMUST00000189207 DeptorQ570Y9 409 aa9□□□□□ -0.97
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Ccdc42Q5SV66 316 aa9□□□□□ -0.97
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Rgl1Q60695 768 aa9□□□□□ -0.97
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Zrsr1Q64707 428 aa9□□□□□ -0.97
Gm28254-201ENSMUST00000189207 BegainQ68EF6 600 aa9□□□□□ -0.97
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Daam2Q80U19 1115 aa9□□□□□ -0.97
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Sestd1Q80UK0 696 aa9□□□□□ -0.97
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Zfpm2Q8CCH7 1151 aa9□□□□□ -0.97
Gm28254-201ENSMUST00000189207 P3h4Q8K2B0 443 aa9□□□□□ -0.97
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Lztr1Q9CQ33 837 aa9□□□□□ -0.97
Gm28254-201ENSMUST00000189207 KynuQ9CXF0 464 aa9□□□□□ -0.97
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Nup50Q9JIH2 466 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Stk32bQ9JJX8 414 aa9□□□□□ -0.97
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Trip6Q9Z1Y4 480 aa9□□□□□ -0.97
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Znf536Q8K083 1302 aa9□□□□□ -0.97
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Pcna-ps2A0A140T8V5 261 aa8.99□□□□□ -0.97
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Pde8aO88502 823 aa8.99□□□□□ -0.97
Gm28254-201ENSMUST00000189207 PomcP01193 235 aa8.99□□□□□ -0.97
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Syt1P46096 421 aa8.99□□□□□ -0.97
Gm28254-201ENSMUST00000189207 NcstnP57716 708 aa8.99□□□□□ -0.97
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Tubb4bP68372 445 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Hexim2Q3TVI4 313 aa8.99□□□□□ -0.97
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Trmt10cQ3UFY8 414 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Ttf2Q5NC05 1138 aa8.99□□□□□ -0.97
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Asic3Q6X1Y6 530 aa8.99□□□□□ -0.97
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Aldh8a1Q8BH00 487 aa8.99□□□□□ -0.97
Gm28254-201ENSMUST00000189207 ImmtQ8CAQ8 757 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Bclaf1Q8K019 919 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Exoc1Q8R3S6 894 aa8.99□□□□□ -0.97
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Rufy2Q8R4C2 606 aa8.99□□□□□ -0.97
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Slc12a5Q91V14 1138 aa8.99□□□□□ -0.97
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Cd248Q91V98 765 aa8.99□□□□□ -0.97
Gm28254-201ENSMUST00000189207 BrdtQ91Y44 956 aa8.99□□□□□ -0.97
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Efcab2Q9CQ46 164 aa8.99□□□□□ -0.97
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Spata17Q9D552 379 aa8.99□□□□□ -0.97
Gm28254-201ENSMUST00000189207 ChmQ9QXG2 665 aa8.99□□□□□ -0.97
Gm28254-201ENSMUST00000189207 PalmQ9Z0P4 383 aa8.99□□□□□ -0.97
Gm28254-201ENSMUST00000189207 AceP09470 1312 aa8.99□□□□□ -0.97
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Usp19Q3UJD6 1360 aa8.99□□□□□ -0.97
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Gm29133A0A1B0GT72 266 aa8.99□□□□□ -0.97
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Nhsl2B1AXH1 854 aa8.99□□□□□ -0.97
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Exoc3l2D3YUP5 789 aa8.99□□□□□ -0.97
Gm28254-201ENSMUST00000189207 NppaP05125 152 aa8.99□□□□□ -0.97
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Mcm10Q0VBD2 885 aa8.99□□□□□ -0.97
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Kansl1lQ5DTI6 991 aa8.99□□□□□ -0.97
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Sun3Q5SS91 320 aa8.99□□□□□ -0.97
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Vav2Q60992 868 aa8.99□□□□□ -0.97
Gm28254-201ENSMUST00000189207 WlsQ6DID7 541 aa8.99□□□□□ -0.97
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Ccdc189Q6NZQ0 333 aa8.99□□□□□ -0.97
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Slc39a10Q6P5F6 833 aa8.99□□□□□ -0.97
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Znf76Q8BMU0 568 aa8.99□□□□□ -0.97
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Znf428Q8C1M2 176 aa8.99□□□□□ -0.97
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Rbm28Q8CGC6 750 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Arhgap18Q8K0Q5 663 aa8.99□□□□□ -0.97
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Mapk8Q91Y86 384 aa8.99□□□□□ -0.97
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Dhx58Q99J87 678 aa8.99□□□□□ -0.97
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Q9D4A5 307 aa8.99□□□□□ -0.97
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Ppp1r3fQ9JIG4 799 aa8.99□□□□□ -0.97
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Dlc1Q9R0Z9 1092 aa8.99□□□□□ -0.97
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Dcst2A0A140LIJ0 701 aa8.98□□□□□ -0.97
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Brd1E9PZ26 1189 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Ebf2O08792 575 aa8.98□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 31.7 ms