Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

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Length 645 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC39.16■■■■□ 3.86
Rab11fip1Q9D620 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Rab11fip1Q9D620 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Rab11fip1Q9D620 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Rab11fip1Q9D620 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Rab11fip1Q9D620 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
Rab11fip1Q9D620 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC34.76■■■■□ 3.16
Rab11fip1Q9D620 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
Rab11fip1Q9D620 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Rab11fip1Q9D620 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
Rab11fip1Q9D620 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
Rab11fip1Q9D620 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Rab11fip1Q9D620 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Rab11fip1Q9D620 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
Rab11fip1Q9D620 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Rab11fip1Q9D620 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Rab11fip1Q9D620 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Rab11fip1Q9D620 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
Rab11fip1Q9D620 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Rab11fip1Q9D620 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Rab11fip1Q9D620 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Rab11fip1Q9D620 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Rab11fip1Q9D620 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Rab11fip1Q9D620 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Rab11fip1Q9D620 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Rab11fip1Q9D620 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Rab11fip1Q9D620 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Rab11fip1Q9D620 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Rab11fip1Q9D620 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
Rab11fip1Q9D620 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Rab11fip1Q9D620 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Rab11fip1Q9D620 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Rab11fip1Q9D620 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Rab11fip1Q9D620 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Rab11fip1Q9D620 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Rab11fip1Q9D620 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Rab11fip1Q9D620 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
Rab11fip1Q9D620 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Rab11fip1Q9D620 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Rab11fip1Q9D620 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Rab11fip1Q9D620 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Rab11fip1Q9D620 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Rab11fip1Q9D620 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Rab11fip1Q9D620 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Rab11fip1Q9D620 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Rab11fip1Q9D620 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
Rab11fip1Q9D620 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Rab11fip1Q9D620 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Rab11fip1Q9D620 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Rab11fip1Q9D620 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Rab11fip1Q9D620 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Rab11fip1Q9D620 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Rab11fip1Q9D620 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Rab11fip1Q9D620 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Rab11fip1Q9D620 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Rab11fip1Q9D620 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Rab11fip1Q9D620 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Rab11fip1Q9D620 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
Rab11fip1Q9D620 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Rab11fip1Q9D620 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Rab11fip1Q9D620 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Rab11fip1Q9D620 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Rab11fip1Q9D620 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
Rab11fip1Q9D620 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Rab11fip1Q9D620 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
Rab11fip1Q9D620 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Rab11fip1Q9D620 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Rab11fip1Q9D620 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Rab11fip1Q9D620 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Rab11fip1Q9D620 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
Rab11fip1Q9D620 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Rab11fip1Q9D620 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Rab11fip1Q9D620 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Rab11fip1Q9D620 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Rab11fip1Q9D620 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Rab11fip1Q9D620 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Rab11fip1Q9D620 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Rab11fip1Q9D620 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Rab11fip1Q9D620 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Rab11fip1Q9D620 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Rab11fip1Q9D620 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Rab11fip1Q9D620 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Rab11fip1Q9D620 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Rab11fip1Q9D620 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Rab11fip1Q9D620 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Rab11fip1Q9D620 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Rab11fip1Q9D620 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Rab11fip1Q9D620 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Rab11fip1Q9D620 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Rab11fip1Q9D620 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Rab11fip1Q9D620 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Rab11fip1Q9D620 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Rab11fip1Q9D620 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Rab11fip1Q9D620 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Rab11fip1Q9D620 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Rab11fip1Q9D620 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Rab11fip1Q9D620 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Rab11fip1Q9D620 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Rab11fip1Q9D620 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rab11fip1Q9D620 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
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