RNA–Protein interactions for RNA: tT(AGU)C

tT(AGU)C, Transcript of Threonine tRNA (tRNA-Thr), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tT(AGU)C, Length 73 nt, Biotype tRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tT(AGU)CtT(AGU)C USA1Q03714 838 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C RKM2Q03942 479 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C CTK1Q03957 528 aaKnown RBP0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C MUS81Q04149 632 aaPredicted RBP0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C YMR111CQ04461 462 aaPredicted RBP0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C YML096WQ04489 525 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C RRN11Q04712 507 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C ARG7Q04728 441 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C RCO1Q04779 684 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C STP3Q05937 343 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C YLR456WQ06199 204 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C YLR177WQ06251 628 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C ERF2Q06551 359 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C ATG23Q06671 453 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C YFT2Q06676 274 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C YET3Q07451 203 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C VAM6Q07468 1049 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C YDL129WQ07555 291 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C PSR1Q07800 427 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C YLL032CQ07834 825 aaKnown RBP RIP-Chip data0.69□□□□□ -2.3not detected
tT(AGU)CtT(AGU)C OPI10Q08202 246 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C YOL036WQ08206 761 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C BSC6Q08280 497 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C MPC54Q08550 464 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C GUP2Q08929 609 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C PFA4Q12006 378 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C TRM8Q12009 286 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C TGL5Q12043 749 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C NUS1Q12063 375 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C MCD1Q12158 566 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C RUD3Q12234 484 aaKnown RBP0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C SUL2Q12325 893 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C FRE7Q12333 620 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C RKM5Q12367 367 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C NCA2Q12374 616 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C ICT1Q12385 394 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C ZRT2Q12436 422 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C NSI1Q12457 570 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C NOT5Q12514 560 aaPredicted RBP0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C YMR030W-AQ3E760 96 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C YKL018C-AQ3E7A7 99 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C NOP14Q99207 810 aaKnown RBP0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C SEY1Q99287 776 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C FAB1P34756 2278 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C COX1P00401 534 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C COX6P00427 148 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C ATP6P00854 259 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C AI4P03878 556 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C HXK2P04807 486 aaKnown RBP0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C HTA2P04912 132 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C CMD1P06787 147 aaKnown RBP0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C CYT1P07143 309 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C SEC53P07283 254 aaKnown RBP0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C CAR2P07991 424 aaKnown RBP0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C SPS1P08458 490 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C RPS4AP0CX35 261 aaKnown RBP0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C RPS4BP0CX36 261 aaKnown RBP0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C HOM3P10869 527 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C MRP13P12686 339 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C GUK1P15454 187 aaKnown RBP0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C PDC5P16467 563 aaKnown RBP0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C PHO81P17442 1178 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C PET123P17558 318 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C SNF5P18480 905 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C STE4P18851 423 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C DAL82P21705 255 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C BAS1P22035 811 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C SEC15P22224 910 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C MRPL25P23369 157 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C SEC14P24280 304 aaKnown RBP0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C RBK1P25332 333 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C PHO87P25360 923 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C YCL049CP25577 312 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C PBN1P25580 416 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C SPB1P25582 841 aaPredicted RBP0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C IMG1P25626 169 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C RSC6P25632 483 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C YCR090CP25654 182 aaKnown RBP0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C BUB3P26449 341 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C CTS1P29029 562 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C BEM1P29366 551 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C FAA1P30624 700 aaKnown RBP0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C SIN4P32259 974 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C NDI1P32340 513 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C PHA2P32452 334 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C HXT4P32467 576 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C MKK2P32491 506 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C NRP1P32770 719 aaKnown RBP RIP-Chip data0.68□□□□□ -2.3not detected
tT(AGU)CtT(AGU)C SFA1P32771 386 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C MGM101P32787 269 aaKnown RBP0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C YSC84P32793 468 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C PTM1P32857 523 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C MRS6P32864 603 aaKnown RBP0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C CYM1P32898 989 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C WBP1P33767 430 aaKnown RBP0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C SIP2P34164 415 aaKnown RBP0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C SKT5P34226 696 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C LST4P34239 828 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C PEX5P35056 612 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C TAF14P35189 244 aa0.68□□□□□ -2.3
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 38 ms