RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639501.1

PMS1-222, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 2,506 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-222ENST00000639501 PDCLQ13371 301 aa22.92■■□□□ 1.26
PMS1-222ENST00000639501 KRT26Q7Z3Y9 468 aa22.92■■□□□ 1.26
PMS1-222ENST00000639501 H7C1D1 291 aa22.91■■□□□ 1.26
PMS1-222ENST00000639501 XBP1P17861 261 aa22.91■■□□□ 1.26
PMS1-222ENST00000639501 MCM7P33993 719 aa22.91■■□□□ 1.26
PMS1-222ENST00000639501 CTSWP56202 376 aa22.91■■□□□ 1.26
PMS1-222ENST00000639501 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
PMS1-222ENST00000639501 ADSSL1Q8N142 457 aa22.91■■□□□ 1.26
PMS1-222ENST00000639501 CARD10Q9BWT7 1032 aa22.91■■□□□ 1.26
PMS1-222ENST00000639501 BCORQ6W2J9 1755 aa22.91■■□□□ 1.26
PMS1-222ENST00000639501 SHTN1A0MZ66 631 aa22.91■■□□□ 1.26
PMS1-222ENST00000639501 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa22.91■■□□□ 1.26
PMS1-222ENST00000639501 BMP15O95972 392 aa22.91■■□□□ 1.26
PMS1-222ENST00000639501 INPP5BP32019 993 aa22.91■■□□□ 1.26
PMS1-222ENST00000639501 SH2D3CQ8N5H7 860 aa22.91■■□□□ 1.26
PMS1-222ENST00000639501 PSMB7Q99436 277 aa22.91■■□□□ 1.26
PMS1-222ENST00000639501 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP22.9■■□□□ 1.26
PMS1-222ENST00000639501 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
PMS1-222ENST00000639501 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP22.9■■□□□ 1.26
PMS1-222ENST00000639501 RCAN1P53805 252 aa22.9■■□□□ 1.26
PMS1-222ENST00000639501 MAP3K12Q12852 859 aa22.9■■□□□ 1.26
PMS1-222ENST00000639501 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
PMS1-222ENST00000639501 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
PMS1-222ENST00000639501 TMTC2Q8N394 836 aa22.9■■□□□ 1.26
PMS1-222ENST00000639501 LRWD1Q9UFC0 647 aa22.9■■□□□ 1.26
PMS1-222ENST00000639501 SNX12Q9UMY4 172 aa22.9■■□□□ 1.26
PMS1-222ENST00000639501 PAPPAQ13219 1627 aa22.9■■□□□ 1.26
PMS1-222ENST00000639501 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
PMS1-222ENST00000639501 MNAT1P51948 309 aa22.9■■□□□ 1.26
PMS1-222ENST00000639501 HLFQ16534 295 aa22.9■■□□□ 1.26
PMS1-222ENST00000639501 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa22.9■■□□□ 1.26
PMS1-222ENST00000639501 AMOTL1Q8IY63 956 aa22.9■■□□□ 1.26
PMS1-222ENST00000639501 MMGT1Q8N4V1 131 aa22.9■■□□□ 1.26
PMS1-222ENST00000639501 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
PMS1-222ENST00000639501 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa22.89■■□□□ 1.26
PMS1-222ENST00000639501 MLXIPQ9HAP2 919 aa22.89■■□□□ 1.26
PMS1-222ENST00000639501 MYH10P35580 1976 aa22.89■■□□□ 1.25
PMS1-222ENST00000639501 GOLGA8KD6RF30 607 aa22.89■■□□□ 1.25
PMS1-222ENST00000639501 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
PMS1-222ENST00000639501 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
PMS1-222ENST00000639501 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
PMS1-222ENST00000639501 GBP6Q6ZN66 633 aa22.89■■□□□ 1.25
PMS1-222ENST00000639501 SDR42E1Q8WUS8 393 aa22.89■■□□□ 1.25
PMS1-222ENST00000639501 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
PMS1-222ENST00000639501 MINDY4BA8MYZ0 360 aa22.88■■□□□ 1.25
PMS1-222ENST00000639501 MYO1FO00160 1098 aa22.88■■□□□ 1.25
PMS1-222ENST00000639501 SRGNP10124 158 aa22.88■■□□□ 1.25
PMS1-222ENST00000639501 CXCR5P32302 372 aa22.88■■□□□ 1.25
PMS1-222ENST00000639501 GPIHBP1Q8IV16 184 aa22.88■■□□□ 1.25
PMS1-222ENST00000639501 CNPY4Q8N129 248 aa22.88■■□□□ 1.25
PMS1-222ENST00000639501 SPATA4Q8NEY3 305 aa22.88■■□□□ 1.25
PMS1-222ENST00000639501 TRIM47Q96LD4 638 aa22.88■■□□□ 1.25
PMS1-222ENST00000639501 GSCP56915 257 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
PMS1-222ENST00000639501 CCDC91Q7Z6B0 441 aa22.88■■□□□ 1.25
PMS1-222ENST00000639501 NACAP1Q9BZK3 213 aa22.88■■□□□ 1.25
PMS1-222ENST00000639501 RMND1Q9NWS8 449 aa22.88■■□□□ 1.25
PMS1-222ENST00000639501 CAPN7Q9Y6W3 813 aa22.88■■□□□ 1.25
PMS1-222ENST00000639501 FGFR2P21802 821 aa22.87■■□□□ 1.25
PMS1-222ENST00000639501 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
PMS1-222ENST00000639501 ATP1A2P50993 1020 aa22.87■■□□□ 1.25
PMS1-222ENST00000639501 KCTD16Q68DU8 428 aa22.87■■□□□ 1.25
PMS1-222ENST00000639501 NFRKBQ6P4R8 1299 aa22.87■■□□□ 1.25
PMS1-222ENST00000639501 RTL9Q8NET4 1388 aa22.87■■□□□ 1.25
PMS1-222ENST00000639501 PLCH1Q4KWH8 1693 aa22.87■■□□□ 1.25
PMS1-222ENST00000639501 MYH3P11055 1940 aa22.87■■□□□ 1.25
PMS1-222ENST00000639501 VAV2P52735 878 aa22.87■■□□□ 1.25
PMS1-222ENST00000639501 NAALADL2Q58DX5 795 aa22.87■■□□□ 1.25
PMS1-222ENST00000639501 HAUS3Q68CZ6 603 aa22.87■■□□□ 1.25
PMS1-222ENST00000639501 POTEDQ86YR6 584 aa22.87■■□□□ 1.25
PMS1-222ENST00000639501 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
PMS1-222ENST00000639501 PP2D1A8MPX8 630 aa22.86■■□□□ 1.25
PMS1-222ENST00000639501 SKOR1P84550 965 aa22.86■■□□□ 1.25
PMS1-222ENST00000639501 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
PMS1-222ENST00000639501 IQCEQ6IPM2 695 aa22.86■■□□□ 1.25
PMS1-222ENST00000639501 ADGRA1Q86SQ6 560 aa22.86■■□□□ 1.25
PMS1-222ENST00000639501 NLRP10Q86W26 655 aa22.86■■□□□ 1.25
PMS1-222ENST00000639501 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
PMS1-222ENST00000639501 NDUFAB1O14561 156 aa22.86■■□□□ 1.25
PMS1-222ENST00000639501 MOCS3O95396 460 aa22.86■■□□□ 1.25
PMS1-222ENST00000639501 KRT14P02533 472 aa22.86■■□□□ 1.25
PMS1-222ENST00000639501 STAT6P42226 847 aa22.86■■□□□ 1.25
PMS1-222ENST00000639501 FNTAP49354 379 aa22.86■■□□□ 1.25
PMS1-222ENST00000639501 KIF5AQ12840 1032 aa22.86■■□□□ 1.25
PMS1-222ENST00000639501 TTI2Q6NXR4 508 aa22.86■■□□□ 1.25
PMS1-222ENST00000639501 LPIN2Q92539 896 aa22.86■■□□□ 1.25
PMS1-222ENST00000639501 ZIM3Q96PE6 472 aa22.86■■□□□ 1.25
PMS1-222ENST00000639501 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa22.86■■□□□ 1.25
PMS1-222ENST00000639501 EXOC1Q9NV70 894 aa22.86■■□□□ 1.25
PMS1-222ENST00000639501 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa22.85■■□□□ 1.25
PMS1-222ENST00000639501 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
PMS1-222ENST00000639501 IL2RBP14784 551 aa22.85■■□□□ 1.25
PMS1-222ENST00000639501 DNM2P50570 870 aa22.85■■□□□ 1.25
PMS1-222ENST00000639501 CCDC96Q2M329 555 aa22.85■■□□□ 1.25
PMS1-222ENST00000639501 KIF6Q6ZMV9 814 aa22.85■■□□□ 1.25
PMS1-222ENST00000639501 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
PMS1-222ENST00000639501 THAP9Q9H5L6 903 aa22.85■■□□□ 1.25
PMS1-222ENST00000639501 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa22.85■■□□□ 1.25
PMS1-222ENST00000639501 KLRC4O43908 158 aa22.85■■□□□ 1.25
PMS1-222ENST00000639501 EPB41P11171 864 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
PMS1-222ENST00000639501 CCDC70Q6NSX1 233 aa22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.4 ms