RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636120.1

PDE4D-228, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 6,659 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-228ENST00000636120 SCNN1DP51172 638 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 PTGDRQ13258 359 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 PPP2R5EQ16537 467 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 SLC27A3Q5K4L6 730 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 NSMFQ6X4W1 530 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 OR8K1Q8NGG5 319 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP7.15□□□□□ -1.26
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PDE4D-228ENST00000636120 PARP2Q9UGN5 583 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
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PDE4D-228ENST00000636120 FAM160B1Q5W0V3 765 aa7.15□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 HACE1Q8IYU2 909 aa7.15□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 RTKN2Q8IZC4 609 aa7.15□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 CPXCR1Q8N123 301 aa7.15□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 ISCA1Q9BUE6 129 aa7.15□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 ANTXR1Q9H6X2 564 aa7.15□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 RCOR1Q9UKL0 485 aa7.15□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 COMMD10Q9Y6G5 202 aa7.15□□□□□ -1.27
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PDE4D-228ENST00000636120 IGKV5-2P06315 115 aa7.15□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 GBP6Q6ZN66 633 aa7.15□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 GIMAP7Q8NHV1 300 aa7.15□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 ADGRB1O14514 1584 aa7.15□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 ALDH3A1P30838 453 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 MECOMQ03112 1051 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 CCDC93Q567U6 631 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 PLA2G4DQ86XP0 818 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 NELFCDQ8IXH7 590 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 MASTLQ96GX5 879 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 FAM81BQ96LP2 452 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 PLCB1Q9NQ66 1216 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 MYO3BQ8WXR4 1341 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 MSL1Q68DK7 614 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 DPH6Q7L8W6 267 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 KIAA0825Q8IV33 1275 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 DEPTORQ8TB45 409 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 TBC1D7Q9P0N9 293 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 CPS1P31327 1500 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 TMEM232C9JQI7 657 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 RESTQ13127 1097 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 PSMD2Q13200 908 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 RASGRF1Q13972 1273 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
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PDE4D-228ENST00000636120 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa7.14□□□□□ -1.27
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PDE4D-228ENST00000636120 RETREG2Q8NC44 543 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 DCAF4Q8WV16 495 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 RIC8AQ9NPQ8 531 aa7.14□□□□□ -1.27
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PDE4D-228ENST00000636120 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 PAK2Q13177 524 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 RPS6KA1Q15418 735 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 FAM102BQ5T8I3 360 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 DPY19L2Q6NUT2 758 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 FAM160B2Q86V87 743 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 LRRC8AQ8IWT6 810 aa7.14□□□□□ -1.27
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PDE4D-228ENST00000636120 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa7.14□□□□□ -1.27
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PDE4D-228ENST00000636120 CCPG1Q9ULG6 757 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 MCAMP43121 646 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 MAP3K9P80192 1104 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
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PDE4D-228ENST00000636120 RRAGAQ7L523 313 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 LINC00301Q8NCQ3 95 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 AXIN2Q9Y2T1 843 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 GOLGA8HP0CJ92 632 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 STAT1P42224 750 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 DGKHQ86XP1 1220 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 NRBP2Q9NSY0 501 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 TXNDC16Q9P2K2 825 aa7.13□□□□□ -1.27
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