RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602319.1

HCG18-242, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

BASIC

Gene HCG18, Length 3,342 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-242ENST00000602319 ZBED6P86452 979 aa11.06□□□□□ -0.64
HCG18-242ENST00000602319 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
HCG18-242ENST00000602319 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
HCG18-242ENST00000602319 CCDC155Q8N6L0 562 aa11.06□□□□□ -0.64
HCG18-242ENST00000602319 LRRC1Q9BTT6 524 aa11.06□□□□□ -0.64
HCG18-242ENST00000602319 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
HCG18-242ENST00000602319 INCENPQ9NQS7 918 aa11.06□□□□□ -0.64
HCG18-242ENST00000602319 VPS54Q9P1Q0 977 aa11.06□□□□□ -0.64
HCG18-242ENST00000602319 PJA2O43164 708 aa11.06□□□□□ -0.64
HCG18-242ENST00000602319 DNM2P50570 870 aa11.06□□□□□ -0.64
HCG18-242ENST00000602319 WTAPQ15007 396 aa11.06□□□□□ -0.64
HCG18-242ENST00000602319 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
HCG18-242ENST00000602319 COBLL1Q53SF7 1204 aa11.06□□□□□ -0.64
HCG18-242ENST00000602319 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP11.06□□□□□ -0.64
HCG18-242ENST00000602319 ZNF654Q8IZM8 581 aa11.06□□□□□ -0.64
HCG18-242ENST00000602319 SPATA4Q8NEY3 305 aa11.06□□□□□ -0.64
HCG18-242ENST00000602319 TRIM58Q8NG06 486 aa11.06□□□□□ -0.64
HCG18-242ENST00000602319 HDAC7Q8WUI4 952 aa11.06□□□□□ -0.64
HCG18-242ENST00000602319 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
HCG18-242ENST00000602319 CAPZA3Q96KX2 299 aa11.06□□□□□ -0.64
HCG18-242ENST00000602319 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
HCG18-242ENST00000602319 ANAPC4Q9UJX5 808 aa11.06□□□□□ -0.64
HCG18-242ENST00000602319 TFR2Q9UP52 801 aa11.06□□□□□ -0.64
HCG18-242ENST00000602319 NUP98P52948 1817 aa11.06□□□□□ -0.64
HCG18-242ENST00000602319 SCN7AQ01118 1682 aa11.06□□□□□ -0.64
HCG18-242ENST00000602319 TMCO5BA8MYB1 307 aa11.06□□□□□ -0.64
HCG18-242ENST00000602319 KLRC4O43908 158 aa11.06□□□□□ -0.64
HCG18-242ENST00000602319 MYL1P05976 194 aa11.06□□□□□ -0.64
HCG18-242ENST00000602319 TCIRG1Q13488 830 aa11.06□□□□□ -0.64
HCG18-242ENST00000602319 C4orf32Q8N8J7 132 aa11.06□□□□□ -0.64
HCG18-242ENST00000602319 ZIM3Q96PE6 472 aa11.06□□□□□ -0.64
HCG18-242ENST00000602319 STIM2Q9P246 746 aa11.06□□□□□ -0.64
HCG18-242ENST00000602319 PHLPP1O60346 1717 aa11.05□□□□□ -0.64
HCG18-242ENST00000602319 FGFR2P21802 821 aa11.05□□□□□ -0.64
HCG18-242ENST00000602319 NAA35Q5VZE5 725 aa11.05□□□□□ -0.64
HCG18-242ENST00000602319 CCDC70Q6NSX1 233 aa11.05□□□□□ -0.64
HCG18-242ENST00000602319 TTI2Q6NXR4 508 aa11.05□□□□□ -0.64
HCG18-242ENST00000602319 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
HCG18-242ENST00000602319 AIDAQ96BJ3 306 aa11.05□□□□□ -0.64
HCG18-242ENST00000602319 IDEP14735 1019 aa11.05□□□□□ -0.64
HCG18-242ENST00000602319 LSP1P33241 339 aa11.05□□□□□ -0.64
HCG18-242ENST00000602319 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
HCG18-242ENST00000602319 PTGISQ16647 500 aa11.05□□□□□ -0.64
HCG18-242ENST00000602319 ESCO1Q5FWF5 840 aa11.05□□□□□ -0.64
HCG18-242ENST00000602319 TTLL11Q8NHH1 800 aa11.05□□□□□ -0.64
HCG18-242ENST00000602319 ERGIC2Q96RQ1 377 aa11.05□□□□□ -0.64
HCG18-242ENST00000602319 CAPN7Q9Y6W3 813 aa11.05□□□□□ -0.64
HCG18-242ENST00000602319 CHUKO15111 745 aa11.04□□□□□ -0.64
HCG18-242ENST00000602319 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa11.04□□□□□ -0.64
HCG18-242ENST00000602319 MYBP10242 640 aa11.04□□□□□ -0.64
HCG18-242ENST00000602319 TCP1P17987 556 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
HCG18-242ENST00000602319 MNAT1P51948 309 aa11.04□□□□□ -0.64
HCG18-242ENST00000602319 PMS1P54277 932 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
HCG18-242ENST00000602319 TTC38Q5R3I4 469 aa11.04□□□□□ -0.64
HCG18-242ENST00000602319 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
HCG18-242ENST00000602319 MICALCLQ6ZW33 695 aa11.04□□□□□ -0.64
HCG18-242ENST00000602319 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
HCG18-242ENST00000602319 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
HCG18-242ENST00000602319 MAST2Q6P0Q8 1798 aa11.04□□□□□ -0.64
HCG18-242ENST00000602319 ZNF233A6NK53 670 aa11.04□□□□□ -0.64
HCG18-242ENST00000602319 MYO1FO00160 1098 aa11.04□□□□□ -0.64
HCG18-242ENST00000602319 HSF2BPO75031 334 aa11.04□□□□□ -0.64
HCG18-242ENST00000602319 MIIPQ5JXC2 388 aa11.04□□□□□ -0.64
HCG18-242ENST00000602319 KIAA1328Q86T90 577 aa11.04□□□□□ -0.64
HCG18-242ENST00000602319 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa11.04□□□□□ -0.64
HCG18-242ENST00000602319 OSBPL9Q96SU4 736 aa11.04□□□□□ -0.64
HCG18-242ENST00000602319 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
HCG18-242ENST00000602319 EXOC1Q9NV70 894 aa11.04□□□□□ -0.64
HCG18-242ENST00000602319 CASZ1Q86V15 1759 aa11.04□□□□□ -0.64
HCG18-242ENST00000602319 RHOBTB3O94955 611 aa11.04□□□□□ -0.64
HCG18-242ENST00000602319 GNAT2P19087 354 aa11.04□□□□□ -0.64
HCG18-242ENST00000602319 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
HCG18-242ENST00000602319 MFSD6Q6ZSS7 791 aa11.04□□□□□ -0.64
HCG18-242ENST00000602319 GPATCH11Q8N954 259 aa11.04□□□□□ -0.64
HCG18-242ENST00000602319 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
HCG18-242ENST00000602319 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
HCG18-242ENST00000602319 BLZF1Q9H2G9 400 aa11.04□□□□□ -0.64
HCG18-242ENST00000602319 SUFUQ9UMX1 484 aa11.04□□□□□ -0.64
HCG18-242ENST00000602319 GDAQ9Y2T3 454 aa11.04□□□□□ -0.64
HCG18-242ENST00000602319 HYOU1Q9Y4L1 999 aa11.04□□□□□ -0.64
HCG18-242ENST00000602319 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa11.04□□□□□ -0.64
HCG18-242ENST00000602319 COBLO75128 1261 aa11.03□□□□□ -0.64
HCG18-242ENST00000602319 LONP1P36776 959 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
HCG18-242ENST00000602319 PDCLQ13371 301 aa11.03□□□□□ -0.64
HCG18-242ENST00000602319 PPP4R3AQ6IN85 833 aa11.03□□□□□ -0.64
HCG18-242ENST00000602319 CAGE1Q8TC20 777 aa11.03□□□□□ -0.64
HCG18-242ENST00000602319 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
HCG18-242ENST00000602319 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa11.03□□□□□ -0.64
HCG18-242ENST00000602319 SAMM50Q9Y512 469 aa11.03□□□□□ -0.64
HCG18-242ENST00000602319 DUSP10Q9Y6W6 482 aa11.03□□□□□ -0.64
HCG18-242ENST00000602319 NDUFAB1O14561 156 aa11.03□□□□□ -0.64
HCG18-242ENST00000602319 FGRP09769 529 aa11.03□□□□□ -0.64
HCG18-242ENST00000602319 XBP1P17861 261 aa11.03□□□□□ -0.64
HCG18-242ENST00000602319 TAX1BP1Q86VP1 789 aa11.03□□□□□ -0.64
HCG18-242ENST00000602319 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP11.03□□□□□ -0.64
HCG18-242ENST00000602319 NAPBQ9H115 298 aa11.03□□□□□ -0.64
HCG18-242ENST00000602319 RNF14Q9UBS8 474 aa11.03□□□□□ -0.64
HCG18-242ENST00000602319 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa11.03□□□□□ -0.64
HCG18-242ENST00000602319 SLIT2O94813 1529 aa11.03□□□□□ -0.64
HCG18-242ENST00000602319 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa11.02□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.6 ms