RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597315.5

BRD4-208, Transcript of bromodomain containing 4, human

TSL 5

Gene BRD4, Length 892 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRD4-208	ENST00000597315	ANKS1A	Q92625	1134 aa		31.56	■■■□□ 2.64
BRD4-208	ENST00000597315	AGBL1	Q96MI9	1066 aa		31.56	■■■□□ 2.64
BRD4-208	ENST00000597315	ACAD9	Q9H845	621 aa		31.56	■■■□□ 2.64
BRD4-208	ENST00000597315	PDE4DIP	Q5VU43	2346 aa		31.55	■■■□□ 2.64
BRD4-208	ENST00000597315		E7EWF7	191 aa		31.55	■■■□□ 2.64
BRD4-208	ENST00000597315	MSC	O60682	206 aa		31.55	■■■□□ 2.64
BRD4-208	ENST00000597315	SNAP25	P60880	206 aa		31.55	■■■□□ 2.64
BRD4-208	ENST00000597315	ERICH6B	Q5W0A0	696 aa		31.55	■■■□□ 2.64
BRD4-208	ENST00000597315	ANKLE1	Q8NAG6	615 aa		31.55	■■■□□ 2.64
BRD4-208	ENST00000597315	HTATIP2	Q9BUP3	242 aa		31.55	■■■□□ 2.64
BRD4-208	ENST00000597315	RNF146	Q9NTX7	359 aa		31.55	■■■□□ 2.64
BRD4-208	ENST00000597315	CCPG1	Q9ULG6	757 aa		31.55	■■■□□ 2.64
BRD4-208	ENST00000597315	SNHG28	P0DPA3	235 aa		31.54	■■■□□ 2.64
BRD4-208	ENST00000597315	ZNF792	Q3KQV3	632 aa		31.54	■■■□□ 2.64
BRD4-208	ENST00000597315	TRERF1	Q96PN7	1200 aa		31.54	■■■□□ 2.64
BRD4-208	ENST00000597315	LSG1	Q9H089	658 aa	Known RBP	31.53	■■■□□ 2.64
BRD4-208	ENST00000597315	RANBP17	Q9H2T7	1088 aa	Known RBP	31.53	■■■□□ 2.64
BRD4-208	ENST00000597315	PPP4R2	Q9NY27	417 aa		31.53	■■■□□ 2.64
BRD4-208	ENST00000597315	PNMA2	Q9UL42	364 aa		31.53	■■■□□ 2.64
BRD4-208	ENST00000597315	ZNFX1	Q9P2E3	1918 aa	Known RBP	31.53	■■■□□ 2.64
BRD4-208	ENST00000597315	ZNF536	O15090	1300 aa		31.52	■■■□□ 2.64
BRD4-208	ENST00000597315	IFIT3	O14879	490 aa	Known RBP	31.52	■■■□□ 2.64
BRD4-208	ENST00000597315	ICAM1	P05362	532 aa		31.52	■■■□□ 2.64
BRD4-208	ENST00000597315	CYB5R4	Q7L1T6	521 aa		31.52	■■■□□ 2.64
BRD4-208	ENST00000597315	TINF2	Q9BSI4	451 aa		31.52	■■■□□ 2.64
BRD4-208	ENST00000597315	DDX20	Q9UHI6	824 aa	Known RBP	31.52	■■■□□ 2.64
BRD4-208	ENST00000597315	GOLGA8H	P0CJ92	632 aa		31.51	■■■□□ 2.63
BRD4-208	ENST00000597315	CYBA	P13498	195 aa		31.51	■■■□□ 2.63
BRD4-208	ENST00000597315	ASPRV1	Q53RT3	343 aa		31.51	■■■□□ 2.63
BRD4-208	ENST00000597315	DHX30	Q7L2E3	1194 aa	Known RBP eCLIP	31.51	■■■□□ 2.63	6e-7	■■□□□ 11.5
BRD4-208	ENST00000597315	NECAB2	Q7Z6G3	386 aa		31.51	■■■□□ 2.63
BRD4-208	ENST00000597315	OGDHL	Q9ULD0	1010 aa		31.51	■■■□□ 2.63
BRD4-208	ENST00000597315	TNRC18	O15417	2968 aa	Predicted RBP	31.5	■■■□□ 2.63
BRD4-208	ENST00000597315	PARP1	P09874	1014 aa	Known RBP	31.5	■■■□□ 2.63
BRD4-208	ENST00000597315	DPF3	Q92784	378 aa		31.5	■■■□□ 2.63
BRD4-208	ENST00000597315	CNPY2	Q9Y2B0	182 aa		31.5	■■■□□ 2.63
BRD4-208	ENST00000597315	DHX16	O60231	1041 aa	Known RBP	31.49	■■■□□ 2.63
BRD4-208	ENST00000597315	RNF20	Q5VTR2	975 aa		31.49	■■■□□ 2.63
BRD4-208	ENST00000597315	MSL3	Q8N5Y2	521 aa	Known RBP	31.49	■■■□□ 2.63
BRD4-208	ENST00000597315	PAWR	Q96IZ0	340 aa	Known RBP	31.49	■■■□□ 2.63
BRD4-208	ENST00000597315	NRBP1	Q9UHY1	535 aa		31.49	■■■□□ 2.63
BRD4-208	ENST00000597315	POTEB2	H3BUK9	544 aa		31.48	■■■□□ 2.63
BRD4-208	ENST00000597315	WTAP	Q15007	396 aa		31.48	■■■□□ 2.63
BRD4-208	ENST00000597315	PRPF38B	Q5VTL8	546 aa	Known RBP	31.48	■■■□□ 2.63
BRD4-208	ENST00000597315	PFAS	O15067	1338 aa		31.48	■■■□□ 2.63
BRD4-208	ENST00000597315	BRCA2	P51587	3418 aa		31.47	■■■□□ 2.63
BRD4-208	ENST00000597315	DNAJC25-GNG10	A0A024R161	153 aa		31.47	■■■□□ 2.63
BRD4-208	ENST00000597315	IGHA2	P01877	340 aa		31.47	■■■□□ 2.63
BRD4-208	ENST00000597315	SEC23A	Q15436	765 aa		31.47	■■■□□ 2.63
BRD4-208	ENST00000597315	PRAMEF19	Q5SWL8	479 aa		31.47	■■■□□ 2.63
BRD4-208	ENST00000597315	LHX8	Q68G74	356 aa		31.47	■■■□□ 2.63
BRD4-208	ENST00000597315	UBE2Q1	Q7Z7E8	422 aa		31.47	■■■□□ 2.63
BRD4-208	ENST00000597315	TRPV1	Q8NER1	839 aa		31.47	■■■□□ 2.63
BRD4-208	ENST00000597315	UBA5	Q9GZZ9	404 aa		31.47	■■■□□ 2.63
BRD4-208	ENST00000597315	PLXNA1	Q9UIW2	1896 aa		31.46	■■■□□ 2.63
BRD4-208	ENST00000597315	SLC27A2	O14975	620 aa		31.46	■■■□□ 2.63
BRD4-208	ENST00000597315	SEPT4	O43236	478 aa		31.46	■■■□□ 2.63
BRD4-208	ENST00000597315	TMEM67	Q5HYA8	995 aa		31.46	■■■□□ 2.63
BRD4-208	ENST00000597315	CREB3L3	Q68CJ9	461 aa		31.46	■■■□□ 2.63
BRD4-208	ENST00000597315	NSMF	Q6X4W1	530 aa		31.46	■■■□□ 2.63
BRD4-208	ENST00000597315	STOX1	Q6ZVD7	989 aa		31.46	■■■□□ 2.63
BRD4-208	ENST00000597315	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	31.46	■■■□□ 2.63
BRD4-208	ENST00000597315	TAF6L	Q9Y6J9	622 aa		31.46	■■■□□ 2.63
BRD4-208	ENST00000597315	CHST3	Q7LGC8	479 aa		31.45	■■■□□ 2.63
BRD4-208	ENST00000597315	ZNF467	Q7Z7K2	595 aa	Predicted RBP	31.45	■■■□□ 2.63
BRD4-208	ENST00000597315	SYNGAP1	Q96PV0	1343 aa		31.45	■■■□□ 2.62
BRD4-208	ENST00000597315	DIS3L	Q8TF46	1054 aa	Known RBP	31.44	■■■□□ 2.62
BRD4-208	ENST00000597315	C11orf49	Q9H6J7	331 aa		31.44	■■■□□ 2.62
BRD4-208	ENST00000597315	MUM1L1	Q5H9M0	696 aa		31.43	■■■□□ 2.62
BRD4-208	ENST00000597315	MB21D2	Q8IYB1	491 aa	Predicted RBP	31.43	■■■□□ 2.62
BRD4-208	ENST00000597315	WDR19	Q8NEZ3	1342 aa		31.43	■■■□□ 2.62
BRD4-208	ENST00000597315	MCM5	P33992	734 aa		31.42	■■■□□ 2.62
BRD4-208	ENST00000597315	NECTIN1	Q15223	517 aa		31.42	■■■□□ 2.62
BRD4-208	ENST00000597315	ANO1	Q5XXA6	986 aa		31.42	■■■□□ 2.62
BRD4-208	ENST00000597315	MAMDC4	Q6UXC1	1216 aa		31.42	■■■□□ 2.62
BRD4-208	ENST00000597315	CATIP	Q7Z7H3	387 aa		31.42	■■■□□ 2.62
BRD4-208	ENST00000597315	ADGRF4	Q8IZF3	695 aa		31.42	■■■□□ 2.62
BRD4-208	ENST00000597315	ARRDC4	Q8NCT1	418 aa		31.42	■■■□□ 2.62
BRD4-208	ENST00000597315	CPVL	Q9H3G5	476 aa		31.42	■■■□□ 2.62
BRD4-208	ENST00000597315	VAT1L	Q9HCJ6	419 aa		31.42	■■■□□ 2.62
BRD4-208	ENST00000597315	MYCN	P04198	464 aa	Predicted RBP	31.41	■■■□□ 2.62
BRD4-208	ENST00000597315	CNTN2	Q02246	1040 aa		31.41	■■■□□ 2.62
BRD4-208	ENST00000597315	CDC37	Q16543	378 aa	Predicted RBP	31.41	■■■□□ 2.62
BRD4-208	ENST00000597315	ZHX1	Q9UKY1	873 aa	Predicted RBP	31.41	■■■□□ 2.62
BRD4-208	ENST00000597315	NR2E3	Q9Y5X4	410 aa		31.41	■■■□□ 2.62
BRD4-208	ENST00000597315	PTPDC1	A2A3K4	754 aa		31.4	■■■□□ 2.62
BRD4-208	ENST00000597315	PRC1	O43663	620 aa		31.4	■■■□□ 2.62
BRD4-208	ENST00000597315	RARB	P10826	455 aa		31.4	■■■□□ 2.62
BRD4-208	ENST00000597315	USH1G	Q495M9	461 aa		31.4	■■■□□ 2.62
BRD4-208	ENST00000597315	MTA3	Q9BTC8	594 aa		31.4	■■■□□ 2.62
BRD4-208	ENST00000597315	CYP39A1	Q9NYL5	469 aa		31.4	■■■□□ 2.62
BRD4-208	ENST00000597315	ASB14	A6NK59	587 aa		31.39	■■■□□ 2.62
BRD4-208	ENST00000597315	KLRF2	D3W0D1	207 aa		31.39	■■■□□ 2.62
BRD4-208	ENST00000597315	EVI5	O60447	810 aa		31.39	■■■□□ 2.62
BRD4-208	ENST00000597315	AKR1A1	P14550	325 aa		31.39	■■■□□ 2.62
BRD4-208	ENST00000597315	TAL1	P17542	331 aa	Predicted RBP	31.39	■■■□□ 2.62
BRD4-208	ENST00000597315	NFXL1	Q6ZNB6	911 aa		31.39	■■■□□ 2.62
BRD4-208	ENST00000597315	FAM133A	Q8N9E0	248 aa		31.39	■■■□□ 2.62
BRD4-208	ENST00000597315	CDKN2AIP	Q9NXV6	580 aa	Predicted RBP	31.39	■■■□□ 2.62
BRD4-208	ENST00000597315	KBTBD13	C9JR72	458 aa		31.38	■■■□□ 2.61

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