RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589146.5

CAPNS1-207, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CAPNS1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-207ENST00000589146 RIC8AQ9NPQ8 531 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-207ENST00000589146 DOCK1Q14185 1865 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-207ENST00000589146 ADCY7P51828 1080 aa26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-207ENST00000589146 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-207ENST00000589146 SHC4Q6S5L8 630 aa26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-207ENST00000589146 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-207ENST00000589146 HPSEQ9Y251 543 aa26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-207ENST00000589146 CTAGE5O15320 804 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-207ENST00000589146 MRE11P49959 708 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-207ENST00000589146 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM160B2Q86V87 743 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-207ENST00000589146 SCYL3Q8IZE3 742 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-207ENST00000589146 RASGRP4Q8TDF6 673 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-207ENST00000589146 CHURC1Q8WUH1 139 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-207ENST00000589146 FERMT2Q96AC1 680 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-207ENST00000589146 WDR18Q9BV38 432 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-207ENST00000589146 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-207ENST00000589146 SSC5DA1L4H1 1573 aa26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-207ENST00000589146 WNT7AO00755 349 aa26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-207ENST00000589146 ATP2B1P20020 1258 aa26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-207ENST00000589146 NDUFA8P51970 172 aa26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-207ENST00000589146 STAT2P52630 851 aa26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-207ENST00000589146 GPR162Q16538 588 aa26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-207ENST00000589146 MAP3K11Q16584 847 aa26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-207ENST00000589146 TEX2Q8IWB9 1127 aa26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-207ENST00000589146 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-207ENST00000589146 FUCA2Q9BTY2 467 aa26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-207ENST00000589146 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-207ENST00000589146 TNMDQ9H2S6 317 aa26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-207ENST00000589146 PRR12Q9ULL5 1215 aa26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-207ENST00000589146 A0A1B0GVL5 298 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-207ENST00000589146 INPP5BP32019 993 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-207ENST00000589146 CLK2P49760 499 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
CAPNS1-207ENST00000589146 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
CAPNS1-207ENST00000589146 TRAF1Q13077 416 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-207ENST00000589146 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
CAPNS1-207ENST00000589146 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP26■■□□□ 1.75
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF174Q15697 407 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-207ENST00000589146 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM83BQ5T0W9 1011 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-207ENST00000589146 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
CAPNS1-207ENST00000589146 SPICE1Q8N0Z3 855 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-207ENST00000589146 LPAR1Q92633 364 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-207ENST00000589146 TIGD1Q96MW7 591 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-207ENST00000589146 AMNQ9BXJ7 453 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-207ENST00000589146 FEM1BQ9UK73 627 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-207ENST00000589146 KINO60870 393 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-207ENST00000589146 PFKFB1P16118 471 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-207ENST00000589146 C4orf32Q8N8J7 132 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-207ENST00000589146 CUL5Q93034 780 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-207ENST00000589146 KLRG1Q96E93 195 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-207ENST00000589146 CLIC6Q96NY7 704 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-207ENST00000589146 TSPY26PQ9H489 355 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-207ENST00000589146 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-207ENST00000589146 FBXO11Q86XK2 927 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-207ENST00000589146 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-207ENST00000589146 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-207ENST00000589146 GRPEL1Q9HAV7 217 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-207ENST00000589146 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-207ENST00000589146 WDR46O15213 610 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
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CAPNS1-207ENST00000589146 INF2Q27J81 1249 aa25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-207ENST00000589146 MCTP2Q6DN12 878 aa25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-207ENST00000589146 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-207ENST00000589146 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-207ENST00000589146 PSTPIP2Q9H939 334 aa25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-207ENST00000589146 AS3MTQ9HBK9 375 aa25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-207ENST00000589146 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-207ENST00000589146 GLTPD2A6NH11 291 aa25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-207ENST00000589146 USP14P54578 494 aa25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-207ENST00000589146 IKQ13123 557 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-207ENST00000589146 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-207ENST00000589146 WRNIP1Q96S55 665 aa25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-207ENST00000589146 FEZ1Q99689 392 aa25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-207ENST00000589146 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-207ENST00000589146 LAD1O00515 517 aa25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF202O95125 648 aa25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-207ENST00000589146 PTPRAP18433 802 aa25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-207ENST00000589146 GRIN1Q05586 938 aa25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-207ENST00000589146 CAMK4Q16566 473 aa25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-207ENST00000589146 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-207ENST00000589146 NEK8Q86SG6 692 aa25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-207ENST00000589146 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-207ENST00000589146 PICK1Q9NRD5 415 aa25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-207ENST00000589146 TMEM260Q9NX78 707 aa25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM13BQ9NYF5 915 aa25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-207ENST00000589146 SCN4AP35499 1836 aa25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-207ENST00000589146 MCM7P33993 719 aa25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-207ENST00000589146 SYKP43405 635 aa25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-207ENST00000589146 SULF1Q8IWU6 871 aa25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-207ENST00000589146 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP25.94■■□□□ 1.748e-20■■□□□ 14.3
CAPNS1-207ENST00000589146 CSRNP2Q9H175 543 aa25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-207ENST00000589146 RBSNQ9H1K0 784 aa25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-207ENST00000589146 MRVI1Q9Y6F6 885 aa25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-207ENST00000589146 PHIPQ8WWQ0 1821 aa25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-207ENST00000589146 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-207ENST00000589146 USP2O75604 605 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-207ENST00000589146 EPHX2P34913 555 aa25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-207ENST00000589146 PRPHP41219 470 aa25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-207ENST00000589146 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
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