RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565922.1

CMTM3-211, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CMTM3, Length 615 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3-211ENST00000565922 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa23.28■■□□□ 1.32
CMTM3-211ENST00000565922 ANKRD35Q8N283 1001 aa23.28■■□□□ 1.32
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CMTM3-211ENST00000565922 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
CMTM3-211ENST00000565922 NCOA7Q8NI08 942 aa23.28■■□□□ 1.32
CMTM3-211ENST00000565922 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
CMTM3-211ENST00000565922 GPCPD1Q9NPB8 672 aa23.28■■□□□ 1.32
CMTM3-211ENST00000565922 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
CMTM3-211ENST00000565922 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
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CMTM3-211ENST00000565922 CNGA1P29973 690 aa23.27■■□□□ 1.32
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CMTM3-211ENST00000565922 NECAB2Q7Z6G3 386 aa23.26■■□□□ 1.31
CMTM3-211ENST00000565922 TINF2Q9BSI4 451 aa23.26■■□□□ 1.31
CMTM3-211ENST00000565922 HOMER2Q9NSB8 354 aa23.26■■□□□ 1.31
CMTM3-211ENST00000565922 RNF146Q9NTX7 359 aa23.26■■□□□ 1.31
CMTM3-211ENST00000565922 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
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CMTM3-211ENST00000565922 SMCHD1A6NHR9 2005 aa23.26■■□□□ 1.31
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CMTM3-211ENST00000565922 SLC16A2P36021 539 aa23.25■■□□□ 1.31
CMTM3-211ENST00000565922 ASPRV1Q53RT3 343 aa23.25■■□□□ 1.31
CMTM3-211ENST00000565922 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
CMTM3-211ENST00000565922 AGBL1Q96MI9 1066 aa23.25■■□□□ 1.31
CMTM3-211ENST00000565922 PFASO15067 1338 aa23.25■■□□□ 1.31
CMTM3-211ENST00000565922 SEPT4O43236 478 aa23.24■■□□□ 1.31
CMTM3-211ENST00000565922 CDC45O75419 566 aa23.24■■□□□ 1.31
CMTM3-211ENST00000565922 LHX8Q68G74 356 aa23.24■■□□□ 1.31
CMTM3-211ENST00000565922 SKAP1Q86WV1 359 aa23.24■■□□□ 1.31
CMTM3-211ENST00000565922 TRERF1Q96PN7 1200 aa23.24■■□□□ 1.31
CMTM3-211ENST00000565922 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
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CMTM3-211ENST00000565922 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa23.24■■□□□ 1.31
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CMTM3-211ENST00000565922 CNPY2Q9Y2B0 182 aa23.23■■□□□ 1.31
CMTM3-211ENST00000565922 ALPK3Q96L96 1907 aa23.22■■□□□ 1.31
CMTM3-211ENST00000565922 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
CMTM3-211ENST00000565922 SEC23AQ15436 765 aa23.22■■□□□ 1.31
CMTM3-211ENST00000565922 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa23.22■■□□□ 1.31
CMTM3-211ENST00000565922 CYB5R4Q7L1T6 521 aa23.22■■□□□ 1.31
CMTM3-211ENST00000565922 TRPV1Q8NER1 839 aa23.22■■□□□ 1.31
CMTM3-211ENST00000565922 WDR19Q8NEZ3 1342 aa23.22■■□□□ 1.31
CMTM3-211ENST00000565922 POTEB2H3BUK9 544 aa23.21■■□□□ 1.31
CMTM3-211ENST00000565922 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
CMTM3-211ENST00000565922 SNAP25P60880 206 aa23.21■■□□□ 1.31
CMTM3-211ENST00000565922 RNF20Q5VTR2 975 aa23.21■■□□□ 1.31
CMTM3-211ENST00000565922 DPF3Q92784 378 aa23.21■■□□□ 1.31
CMTM3-211ENST00000565922 C11orf49Q9H6J7 331 aa23.21■■□□□ 1.31
CMTM3-211ENST00000565922 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
CMTM3-211ENST00000565922 WTAPQ15007 396 aa23.2■■□□□ 1.3
CMTM3-211ENST00000565922 MTA3Q9BTC8 594 aa23.2■■□□□ 1.3
CMTM3-211ENST00000565922 PPP4R2Q9NY27 417 aa23.2■■□□□ 1.3
CMTM3-211ENST00000565922 LCTP09848 1927 aa23.2■■□□□ 1.3
CMTM3-211ENST00000565922 GOLGA8HP0CJ92 632 aa23.19■■□□□ 1.3
CMTM3-211ENST00000565922 STOX1Q6ZVD7 989 aa23.19■■□□□ 1.3
CMTM3-211ENST00000565922 ARRDC4Q8NCT1 418 aa23.19■■□□□ 1.3
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CMTM3-211ENST00000565922 SLC27A2O14975 620 aa23.18■■□□□ 1.3
CMTM3-211ENST00000565922 NECTIN1Q15223 517 aa23.18■■□□□ 1.3
CMTM3-211ENST00000565922 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa23.18■■□□□ 1.3
CMTM3-211ENST00000565922 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
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CMTM3-211ENST00000565922 NR2E3Q9Y5X4 410 aa23.18■■□□□ 1.3
CMTM3-211ENST00000565922 ASB14A6NK59 587 aa23.17■■□□□ 1.3
CMTM3-211ENST00000565922 DNM1LO00429 736 aa23.17■■□□□ 1.3
CMTM3-211ENST00000565922 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
CMTM3-211ENST00000565922 RARBP10826 455 aa23.17■■□□□ 1.3
CMTM3-211ENST00000565922 AKR1A1P14550 325 aa23.17■■□□□ 1.3
CMTM3-211ENST00000565922 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
CMTM3-211ENST00000565922 MUM1L1Q5H9M0 696 aa23.17■■□□□ 1.3
CMTM3-211ENST00000565922 TMEM67Q5HYA8 995 aa23.17■■□□□ 1.3
CMTM3-211ENST00000565922 CREB3L3Q68CJ9 461 aa23.17■■□□□ 1.3
CMTM3-211ENST00000565922 NSMFQ6X4W1 530 aa23.17■■□□□ 1.3
CMTM3-211ENST00000565922 UBA5Q9GZZ9 404 aa23.17■■□□□ 1.3
CMTM3-211ENST00000565922 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa23.17■■□□□ 1.3
CMTM3-211ENST00000565922 CYP39A1Q9NYL5 469 aa23.17■■□□□ 1.3
CMTM3-211ENST00000565922 TAF6LQ9Y6J9 622 aa23.17■■□□□ 1.3
CMTM3-211ENST00000565922 MCM5P33992 734 aa23.16■■□□□ 1.3
CMTM3-211ENST00000565922 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
CMTM3-211ENST00000565922 ADGRF4Q8IZF3 695 aa23.16■■□□□ 1.3
CMTM3-211ENST00000565922 MAF1Q9H063 256 aa23.16■■□□□ 1.3
CMTM3-211ENST00000565922 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
CMTM3-211ENST00000565922 LRRC37A2A6NM11 1700 aa23.16■■□□□ 1.3
CMTM3-211ENST00000565922 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa23.15■■□□□ 1.3
CMTM3-211ENST00000565922 KBTBD13C9JR72 458 aa23.15■■□□□ 1.3
CMTM3-211ENST00000565922 EVI5O60447 810 aa23.15■■□□□ 1.3
CMTM3-211ENST00000565922 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
CMTM3-211ENST00000565922 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
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