RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486161.5

PTPRD-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 5,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-211ENST00000486161 FAM83AQ86UY5 434 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRD-211ENST00000486161 IL25Q9H293 177 aa9.29□□□□□ -0.92
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PTPRD-211ENST00000486161 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa9.29□□□□□ -0.92
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PTPRD-211ENST00000486161 TECP42680 631 aa9.29□□□□□ -0.92
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PTPRD-211ENST00000486161 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP9.29□□□□□ -0.92
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PTPRD-211ENST00000486161 USP17L20D6RJB6 530 aa9.28□□□□□ -0.92
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PTPRD-211ENST00000486161 DESP17661 470 aa9.26□□□□□ -0.93
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PTPRD-211ENST00000486161 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
PTPRD-211ENST00000486161 EXOC7Q9UPT5 735 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRD-211ENST00000486161 MRVI1Q9Y6F6 885 aa9.26□□□□□ -0.93
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PTPRD-211ENST00000486161 MYL5Q02045 173 aa9.26□□□□□ -0.93
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