RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485765.5

NISCH-209, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 4

Gene NISCH, Length 563 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-209ENST00000485765 TKFCQ3LXA3 575 aa22.33■■□□□ 1.17
NISCH-209ENST00000485765 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
NISCH-209ENST00000485765 SYDE2Q5VT97 1194 aa22.33■■□□□ 1.17
NISCH-209ENST00000485765 NCOA7Q8NI08 942 aa22.33■■□□□ 1.17
NISCH-209ENST00000485765 AGBL1Q96MI9 1066 aa22.33■■□□□ 1.17
NISCH-209ENST00000485765 UBAC1Q9BSL1 405 aa22.33■■□□□ 1.17
NISCH-209ENST00000485765 PGK2P07205 417 aa22.32■■□□□ 1.16
NISCH-209ENST00000485765 SNAP25P60880 206 aa22.32■■□□□ 1.16
NISCH-209ENST00000485765 LHX8Q68G74 356 aa22.32■■□□□ 1.16
NISCH-209ENST00000485765 SLC4A3P48751 1232 aa22.31■■□□□ 1.16
NISCH-209ENST00000485765 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
NISCH-209ENST00000485765 TRPV1Q8NER1 839 aa22.31■■□□□ 1.16
NISCH-209ENST00000485765 ANO2Q9NQ90 1003 aa22.31■■□□□ 1.16
NISCH-209ENST00000485765 OGDHLQ9ULD0 1010 aa22.31■■□□□ 1.16
NISCH-209ENST00000485765 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
NISCH-209ENST00000485765 SLC27A2O14975 620 aa22.3■■□□□ 1.16
NISCH-209ENST00000485765 ICAM1P05362 532 aa22.3■■□□□ 1.16
NISCH-209ENST00000485765 CYBAP13498 195 aa22.3■■□□□ 1.16
NISCH-209ENST00000485765 CCDC174Q6PII3 467 aa22.3■■□□□ 1.16
NISCH-209ENST00000485765 CASC1Q6TDU7 716 aa22.3■■□□□ 1.16
NISCH-209ENST00000485765 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
NISCH-209ENST00000485765 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
NISCH-209ENST00000485765 DDX11Q96FC9 970 aa22.3■■□□□ 1.16
NISCH-209ENST00000485765 GOLGA8HP0CJ92 632 aa22.29■■□□□ 1.16
NISCH-209ENST00000485765 CREB3L3Q68CJ9 461 aa22.29■■□□□ 1.16
NISCH-209ENST00000485765 ANKLE1Q8NAG6 615 aa22.29■■□□□ 1.16
NISCH-209ENST00000485765 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa22.29■■□□□ 1.16
NISCH-209ENST00000485765 TRERF1Q96PN7 1200 aa22.29■■□□□ 1.16
NISCH-209ENST00000485765 TINF2Q9BSI4 451 aa22.29■■□□□ 1.16
NISCH-209ENST00000485765 ACAD9Q9H845 621 aa22.29■■□□□ 1.16
NISCH-209ENST00000485765 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
NISCH-209ENST00000485765 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
NISCH-209ENST00000485765 ANTXR2P58335 489 aa22.28■■□□□ 1.16
NISCH-209ENST00000485765 ASPRV1Q53RT3 343 aa22.28■■□□□ 1.16
NISCH-209ENST00000485765 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa22.28■■□□□ 1.16
NISCH-209ENST00000485765 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
NISCH-209ENST00000485765 ANKRD35Q8N283 1001 aa22.28■■□□□ 1.16
NISCH-209ENST00000485765 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
NISCH-209ENST00000485765 MTA3Q9BTC8 594 aa22.28■■□□□ 1.16
NISCH-209ENST00000485765 RNF146Q9NTX7 359 aa22.28■■□□□ 1.16
NISCH-209ENST00000485765 NRBP1Q9UHY1 535 aa22.28■■□□□ 1.16
NISCH-209ENST00000485765 ALAS1P13196 640 aa22.27■■□□□ 1.16
NISCH-209ENST00000485765 FGD4Q96M96 766 aa22.27■■□□□ 1.16
NISCH-209ENST00000485765 UBA5Q9GZZ9 404 aa22.27■■□□□ 1.16
NISCH-209ENST00000485765 HOMER2Q9NSB8 354 aa22.27■■□□□ 1.16
NISCH-209ENST00000485765 PNMA2Q9UL42 364 aa22.27■■□□□ 1.16
NISCH-209ENST00000485765 CCPG1Q9ULG6 757 aa22.27■■□□□ 1.16
NISCH-209ENST00000485765 MSCO60682 206 aa22.26■■□□□ 1.15
NISCH-209ENST00000485765 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
NISCH-209ENST00000485765 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
NISCH-209ENST00000485765 TSGA10IPQ3SY00 556 aa22.26■■□□□ 1.15
NISCH-209ENST00000485765 MUM1L1Q5H9M0 696 aa22.26■■□□□ 1.15
NISCH-209ENST00000485765 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa22.26■■□□□ 1.15
NISCH-209ENST00000485765 CHST3Q7LGC8 479 aa22.26■■□□□ 1.15
NISCH-209ENST00000485765 SENP2Q9HC62 589 aa22.26■■□□□ 1.15
NISCH-209ENST00000485765 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
NISCH-209ENST00000485765 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
NISCH-209ENST00000485765 ERICH2A1L162 156 aa22.25■■□□□ 1.15
NISCH-209ENST00000485765 WTAPQ15007 396 aa22.25■■□□□ 1.15
NISCH-209ENST00000485765 SART3Q15020 963 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
NISCH-209ENST00000485765 ADGRF4Q8IZF3 695 aa22.25■■□□□ 1.15
NISCH-209ENST00000485765 FAM133AQ8N9E0 248 aa22.25■■□□□ 1.15
NISCH-209ENST00000485765 CPVLQ9H3G5 476 aa22.25■■□□□ 1.15
NISCH-209ENST00000485765 MAD2L2Q9UI95 211 aa22.25■■□□□ 1.15
NISCH-209ENST00000485765 WDR19Q8NEZ3 1342 aa22.25■■□□□ 1.15
NISCH-209ENST00000485765 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa22.25■■□□□ 1.15
NISCH-209ENST00000485765 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
NISCH-209ENST00000485765 SEPT4O43236 478 aa22.24■■□□□ 1.15
NISCH-209ENST00000485765 CNGA1P29973 690 aa22.24■■□□□ 1.15
NISCH-209ENST00000485765 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
NISCH-209ENST00000485765 TMEM67Q5HYA8 995 aa22.24■■□□□ 1.15
NISCH-209ENST00000485765 STAG2Q8N3U4 1231 aa22.24■■□□□ 1.15
NISCH-209ENST00000485765 CYP39A1Q9NYL5 469 aa22.24■■□□□ 1.15
NISCH-209ENST00000485765 PFASO15067 1338 aa22.24■■□□□ 1.15
NISCH-209ENST00000485765 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
NISCH-209ENST00000485765 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
NISCH-209ENST00000485765 MCM5P33992 734 aa22.23■■□□□ 1.15
NISCH-209ENST00000485765 CNTN2Q02246 1040 aa22.23■■□□□ 1.15
NISCH-209ENST00000485765 TROAPQ12815 778 aa22.23■■□□□ 1.15
NISCH-209ENST00000485765 RNF20Q5VTR2 975 aa22.23■■□□□ 1.15
NISCH-209ENST00000485765 CLEC4DQ8WXI8 215 aa22.23■■□□□ 1.15
NISCH-209ENST00000485765 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
NISCH-209ENST00000485765 LY9Q9HBG7 655 aa22.23■■□□□ 1.15
NISCH-209ENST00000485765 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa22.23■■□□□ 1.15
NISCH-209ENST00000485765 KLRF2D3W0D1 207 aa22.22■■□□□ 1.15
NISCH-209ENST00000485765 POTEB2H3BUK9 544 aa22.22■■□□□ 1.15
NISCH-209ENST00000485765 PRC1O43663 620 aa22.22■■□□□ 1.15
NISCH-209ENST00000485765 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
NISCH-209ENST00000485765 NECAB2Q7Z6G3 386 aa22.22■■□□□ 1.15
NISCH-209ENST00000485765 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
NISCH-209ENST00000485765 KCNB2Q92953 911 aa22.22■■□□□ 1.15
NISCH-209ENST00000485765 TMEM87BQ96K49 555 aa22.22■■□□□ 1.15
NISCH-209ENST00000485765 JMJD4Q9H9V9 463 aa22.22■■□□□ 1.15
NISCH-209ENST00000485765 SOWAHBA6NEL2 793 aa22.21■■□□□ 1.15
NISCH-209ENST00000485765 GRM4Q14833 912 aa22.21■■□□□ 1.15
NISCH-209ENST00000485765 TMTC2Q8N394 836 aa22.21■■□□□ 1.15
NISCH-209ENST00000485765 MTMR8Q96EF0 704 aa22.21■■□□□ 1.15
NISCH-209ENST00000485765 MAP3K14Q99558 947 aa22.21■■□□□ 1.15
NISCH-209ENST00000485765 MAF1Q9H063 256 aa22.21■■□□□ 1.15
NISCH-209ENST00000485765 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa22.21■■□□□ 1.15
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