RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa4.1□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 LRRC57Q8N9N7 239 aa4.1□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 MBOAT7Q96N66 472 aa4.1□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 KCNMB3Q9NPA1 279 aa4.1□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa4.1□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 PCP11498 1178 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 HOXD13P35453 343 aa4.09□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 SKOR1P84550 965 aa4.09□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 CYP27A1Q02318 531 aa4.09□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 C12orf60Q5U649 245 aa4.09□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 MFSD6Q6ZSS7 791 aa4.09□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 TMTC2Q8N394 836 aa4.09□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 STAG2Q8N3U4 1231 aa4.09□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 GOLGA1Q92805 767 aa4.09□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 AIDAQ96BJ3 306 aa4.09□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP4.09□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 CCP110O43303 1012 aa4.09□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 TNFRSF8P28908 595 aa4.09□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 GYG1P46976 350 aa4.09□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 TUBB2AQ13885 445 aa4.09□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 TTC38Q5R3I4 469 aa4.09□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 TUBB2BQ9BVA1 445 aa4.09□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa4.09□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 TRADDQ15628 312 aa4.09□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 MIGA1Q8NAN2 632 aa4.09□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 SLF1Q9BQI6 1058 aa4.09□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 NAPBQ9H115 298 aa4.09□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 MAD2L2Q9UI95 211 aa4.09□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 MINPP1Q9UNW1 487 aa4.09□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 A0A1W2PQJ5 194 aa4.09□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 KLK7P49862 253 aa4.09□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 LMOD2Q6P5Q4 547 aa4.09□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 USP17L12C9JPN9 530 aa4.09□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 USP17L21D6R901 530 aa4.09□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 PPFIA4O75335 1185 aa4.09□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 IRAK1P51617 712 aa4.09□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 ZBED6P86452 979 aa4.09□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 TTMPQ5BVD1 217 aa4.09□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 CLEC4GQ6UXB4 293 aa4.09□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 MB21D1Q8N884 522 aa4.09□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 TAB2Q9NYJ8 693 aa4.09□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 SNX12Q9UMY4 172 aa4.09□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa4.09□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa4.09□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa4.09□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 ZEB2O60315 1214 aa4.09□□□□□ -1.76
PGGT1B-203ENST00000419445 RASA1P20936 1047 aa4.09□□□□□ -1.76
PGGT1B-203ENST00000419445 CRKLP46109 303 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.76
PGGT1B-203ENST00000419445 MARSP56192 900 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.76
PGGT1B-203ENST00000419445 PPP4CP60510 307 aa4.09□□□□□ -1.76
PGGT1B-203ENST00000419445 KCNMA1Q12791 1236 aa4.09□□□□□ -1.76
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PGGT1B-203ENST00000419445 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa4.09□□□□□ -1.76
PGGT1B-203ENST00000419445 OR8K1Q8NGG5 319 aa4.09□□□□□ -1.76
PGGT1B-203ENST00000419445 TXLNGYQ9BZA5 131 aa4.09□□□□□ -1.76
PGGT1B-203ENST00000419445 MED4Q9NPJ6 270 aa4.09□□□□□ -1.76
PGGT1B-203ENST00000419445 EHD2Q9NZN4 543 aa4.09□□□□□ -1.76
PGGT1B-203ENST00000419445 LRRC37AA6NMS7 1700 aa4.09□□□□□ -1.76
PGGT1B-203ENST00000419445 KCNJ18B7U540 433 aa4.09□□□□□ -1.76
PGGT1B-203ENST00000419445 STXBP3O00186 592 aa4.09□□□□□ -1.76
PGGT1B-203ENST00000419445 SRGAP2O75044 1071 aa4.09□□□□□ -1.76
PGGT1B-203ENST00000419445 CLSTN1O94985 981 aa4.09□□□□□ -1.76
PGGT1B-203ENST00000419445 KCNJ12Q14500 433 aa4.09□□□□□ -1.76
PGGT1B-203ENST00000419445 KANK3Q6NY19 840 aa4.09□□□□□ -1.76
PGGT1B-203ENST00000419445 CCDC82Q8N4S0 544 aa4.09□□□□□ -1.76
PGGT1B-203ENST00000419445 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa4.09□□□□□ -1.76
PGGT1B-203ENST00000419445 ATAD5Q96QE3 1844 aa4.09□□□□□ -1.76
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF233A6NK53 670 aa4.09□□□□□ -1.76
PGGT1B-203ENST00000419445 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.76
PGGT1B-203ENST00000419445 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.76
PGGT1B-203ENST00000419445 CCNE1P24864 410 aa4.09□□□□□ -1.76
PGGT1B-203ENST00000419445 CLK2P49760 499 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.76
PGGT1B-203ENST00000419445 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.76
PGGT1B-203ENST00000419445 ANKRD40Q6AI12 368 aa4.09□□□□□ -1.76
PGGT1B-203ENST00000419445 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.76
PGGT1B-203ENST00000419445 HAS1Q92839 578 aa4.09□□□□□ -1.76
PGGT1B-203ENST00000419445 BLZF1Q9H2G9 400 aa4.09□□□□□ -1.76
PGGT1B-203ENST00000419445 SIPA1L1O43166 1804 aa4.08□□□□□ -1.76
PGGT1B-203ENST00000419445 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP4.08□□□□□ -1.76
PGGT1B-203ENST00000419445 H7C1D1 291 aa4.08□□□□□ -1.76
PGGT1B-203ENST00000419445 BMP15O95972 392 aa4.08□□□□□ -1.76
PGGT1B-203ENST00000419445 MYL1P05976 194 aa4.08□□□□□ -1.76
PGGT1B-203ENST00000419445 TPM1P09493 284 aa4.08□□□□□ -1.76
PGGT1B-203ENST00000419445 SPAG1Q07617 926 aa4.08□□□□□ -1.76
PGGT1B-203ENST00000419445 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP4.08□□□□□ -1.76
PGGT1B-203ENST00000419445 GRM4Q14833 912 aa4.08□□□□□ -1.76
PGGT1B-203ENST00000419445 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa4.08□□□□□ -1.76
PGGT1B-203ENST00000419445 LENG9Q96B70 501 aa4.08□□□□□ -1.76
PGGT1B-203ENST00000419445 ARL8AQ96BM9 186 aa4.08□□□□□ -1.76
PGGT1B-203ENST00000419445 C7orf25Q9BPX7 421 aa4.08□□□□□ -1.76
PGGT1B-203ENST00000419445 PCDHA6Q9UN73 950 aa4.08□□□□□ -1.76
PGGT1B-203ENST00000419445 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa4.08□□□□□ -1.76
PGGT1B-203ENST00000419445 ENC1O14682 589 aa4.08□□□□□ -1.76
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