RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335523.7

VSTM2B-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 2B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene VSTM2B, Length 1,488 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM2B-201ENST00000335523 USP17L15C9J2P7 530 aa22.45■■□□□ 1.18
VSTM2B-201ENST00000335523 USP17L13C9JLJ4 530 aa22.45■■□□□ 1.18
VSTM2B-201ENST00000335523 USP17L11C9JVI0 530 aa22.45■■□□□ 1.18
VSTM2B-201ENST00000335523 USP17L18D6R9N7 530 aa22.45■■□□□ 1.18
VSTM2B-201ENST00000335523 USP17L22D6RA61 530 aa22.45■■□□□ 1.18
VSTM2B-201ENST00000335523 USP17L17D6RBQ6 530 aa22.45■■□□□ 1.18
VSTM2B-201ENST00000335523 USP17L19D6RCP7 530 aa22.45■■□□□ 1.18
VSTM2B-201ENST00000335523 USP17L20D6RJB6 530 aa22.45■■□□□ 1.18
VSTM2B-201ENST00000335523 MCM4P33991 863 aa22.45■■□□□ 1.18
VSTM2B-201ENST00000335523 KRT85P78386 507 aa22.45■■□□□ 1.18
VSTM2B-201ENST00000335523 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
VSTM2B-201ENST00000335523 USP17L24Q0WX57 530 aa22.45■■□□□ 1.18
VSTM2B-201ENST00000335523 BLIDQ8IZY5 108 aa22.45■■□□□ 1.18
VSTM2B-201ENST00000335523 BICD2Q8TD16 824 aa22.45■■□□□ 1.18
VSTM2B-201ENST00000335523 COA7Q96BR5 231 aa22.45■■□□□ 1.18
VSTM2B-201ENST00000335523 GLT8D2Q9H1C3 349 aa22.45■■□□□ 1.18
VSTM2B-201ENST00000335523 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
VSTM2B-201ENST00000335523 FBXO28Q9NVF7 368 aa22.45■■□□□ 1.18
VSTM2B-201ENST00000335523 CFAP45Q9UL16 551 aa22.45■■□□□ 1.18
VSTM2B-201ENST00000335523 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa22.45■■□□□ 1.18
VSTM2B-201ENST00000335523 KIF28PB7ZC32 967 aa22.44■■□□□ 1.18
VSTM2B-201ENST00000335523 NCLP19338 710 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
VSTM2B-201ENST00000335523 DGKZQ13574 1117 aa22.44■■□□□ 1.18
VSTM2B-201ENST00000335523 NFKBIBQ15653 356 aa22.44■■□□□ 1.18
VSTM2B-201ENST00000335523 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa22.44■■□□□ 1.18
VSTM2B-201ENST00000335523 TYW1BQ6NUM6 668 aa22.44■■□□□ 1.18
VSTM2B-201ENST00000335523 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
VSTM2B-201ENST00000335523 DAGLBQ8NCG7 672 aa22.44■■□□□ 1.18
VSTM2B-201ENST00000335523 CREBZFQ9NS37 354 aa22.44■■□□□ 1.18
VSTM2B-201ENST00000335523 PNMA2Q9UL42 364 aa22.44■■□□□ 1.18
VSTM2B-201ENST00000335523 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa22.44■■□□□ 1.18
VSTM2B-201ENST00000335523 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
VSTM2B-201ENST00000335523 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
VSTM2B-201ENST00000335523 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
VSTM2B-201ENST00000335523 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
VSTM2B-201ENST00000335523 SNAP25P60880 206 aa22.43■■□□□ 1.18
VSTM2B-201ENST00000335523 COG2Q14746 738 aa22.43■■□□□ 1.18
VSTM2B-201ENST00000335523 CST9Q5W186 159 aa22.43■■□□□ 1.18
VSTM2B-201ENST00000335523 FAM173BQ6P4H8 233 aa22.43■■□□□ 1.18
VSTM2B-201ENST00000335523 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa22.43■■□□□ 1.18
VSTM2B-201ENST00000335523 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
VSTM2B-201ENST00000335523 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
VSTM2B-201ENST00000335523 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa22.43■■□□□ 1.18
VSTM2B-201ENST00000335523 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
VSTM2B-201ENST00000335523 DDX11L8A8MPP1 907 aa22.42■■□□□ 1.18
VSTM2B-201ENST00000335523 ZBED4O75132 1171 aa22.42■■□□□ 1.18
VSTM2B-201ENST00000335523 PTMSP20962 102 aa22.42■■□□□ 1.18
VSTM2B-201ENST00000335523 ADCY7P51828 1080 aa22.42■■□□□ 1.18
VSTM2B-201ENST00000335523 NPY5RQ15761 445 aa22.42■■□□□ 1.18
VSTM2B-201ENST00000335523 OXER1Q8TDS5 423 aa22.42■■□□□ 1.18
VSTM2B-201ENST00000335523 HOXC10Q9NYD6 342 aa22.42■■□□□ 1.18
VSTM2B-201ENST00000335523 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa22.42■■□□□ 1.18
VSTM2B-201ENST00000335523 MYH6P13533 1939 aa22.42■■□□□ 1.18
VSTM2B-201ENST00000335523 NR5A1Q13285 461 aa22.41■■□□□ 1.18
VSTM2B-201ENST00000335523 SNAPC2Q13487 334 aa22.41■■□□□ 1.18
VSTM2B-201ENST00000335523 MYSM1Q5VVJ2 828 aa22.41■■□□□ 1.18
VSTM2B-201ENST00000335523 GADL1Q6ZQY3 521 aa22.41■■□□□ 1.18
VSTM2B-201ENST00000335523 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
VSTM2B-201ENST00000335523 CCDC174Q6PII3 467 aa22.41■■□□□ 1.18
VSTM2B-201ENST00000335523 PSTPIP2Q9H939 334 aa22.41■■□□□ 1.18
VSTM2B-201ENST00000335523 RIC8AQ9NPQ8 531 aa22.41■■□□□ 1.18
VSTM2B-201ENST00000335523 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
VSTM2B-201ENST00000335523 CNPY2Q9Y2B0 182 aa22.41■■□□□ 1.18
VSTM2B-201ENST00000335523 MYPNQ86TC9 1320 aa22.4■■□□□ 1.18
VSTM2B-201ENST00000335523 DSG3P32926 999 aa22.4■■□□□ 1.18
VSTM2B-201ENST00000335523 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP22.4■■□□□ 1.18
VSTM2B-201ENST00000335523 RILPL1Q5EBL4 403 aa22.4■■□□□ 1.18
VSTM2B-201ENST00000335523 TEX2Q8IWB9 1127 aa22.4■■□□□ 1.18
VSTM2B-201ENST00000335523 CUL5Q93034 780 aa22.4■■□□□ 1.18
VSTM2B-201ENST00000335523 CHAMP1Q96JM3 812 aa22.4■■□□□ 1.18
VSTM2B-201ENST00000335523 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa22.4■■□□□ 1.18
VSTM2B-201ENST00000335523 ICAM1P05362 532 aa22.39■■□□□ 1.17
VSTM2B-201ENST00000335523 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
VSTM2B-201ENST00000335523 USH1GQ495M9 461 aa22.39■■□□□ 1.17
VSTM2B-201ENST00000335523 POTEDQ86YR6 584 aa22.39■■□□□ 1.17
VSTM2B-201ENST00000335523 TNFRSF25Q93038 417 aa22.39■■□□□ 1.17
VSTM2B-201ENST00000335523 WNK4Q96J92 1243 aa22.39■■□□□ 1.17
VSTM2B-201ENST00000335523 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
VSTM2B-201ENST00000335523 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
VSTM2B-201ENST00000335523 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa22.38■■□□□ 1.17
VSTM2B-201ENST00000335523 TMEM88BA6NKF7 163 aa22.38■■□□□ 1.17
VSTM2B-201ENST00000335523 VWA5AO00534 786 aa22.38■■□□□ 1.17
VSTM2B-201ENST00000335523 GTF2A2P52657 109 aa22.38■■□□□ 1.17
VSTM2B-201ENST00000335523 HUNKP57058 714 aa22.38■■□□□ 1.17
VSTM2B-201ENST00000335523 MCTP2Q6DN12 878 aa22.38■■□□□ 1.17
VSTM2B-201ENST00000335523 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
VSTM2B-201ENST00000335523 PCDHA6Q9UN73 950 aa22.38■■□□□ 1.17
VSTM2B-201ENST00000335523 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa22.38■■□□□ 1.17
VSTM2B-201ENST00000335523 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa22.38■■□□□ 1.17
VSTM2B-201ENST00000335523 ABCB11O95342 1321 aa22.38■■□□□ 1.17
VSTM2B-201ENST00000335523 PHIPQ8WWQ0 1821 aa22.37■■□□□ 1.17
VSTM2B-201ENST00000335523 M0R2N6 131 aa22.37■■□□□ 1.17
VSTM2B-201ENST00000335523 FIBPO43427 364 aa22.37■■□□□ 1.17
VSTM2B-201ENST00000335523 CETPP11597 493 aa22.37■■□□□ 1.17
VSTM2B-201ENST00000335523 GJA5P36382 358 aa22.37■■□□□ 1.17
VSTM2B-201ENST00000335523 TREML2Q5T2D2 321 aa22.37■■□□□ 1.17
VSTM2B-201ENST00000335523 KRT25Q7Z3Z0 450 aa22.37■■□□□ 1.17
VSTM2B-201ENST00000335523 RTEL1Q9NZ71 1219 aa22.37■■□□□ 1.17
VSTM2B-201ENST00000335523 CCPG1Q9ULG6 757 aa22.37■■□□□ 1.17
VSTM2B-201ENST00000335523 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.7 ms